29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1538 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_1538  TraB pilus assembly family protein  100 
 
 		 472 aa  952    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.245365 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2650  TraB pilus assembly  68.02 
 
 		 457 aa  582  1.0000000000000001e-165  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.835433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2317  TraB pilus assembly  68.93 
 
 		 456 aa  578  1e-164  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.653277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0076  type IV conjugative transfer system protein TraB  43.18 
 
 		 438 aa  199  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4181  TraB pilus assembly family protein  48.08 
 
 		 449 aa  190  4e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000413656  hitchhiker  0.000231943 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6794  TraB pilus assembly family protein  41.38 
 
 		 440 aa  183  6e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0932  sex pilus assembly protein  40.5 
 
 		 446 aa  181  2e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.112358  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0255  TraB pilus assembly family protein  32.35 
 
 		 418 aa  179  7e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.844609  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0367  sex pilus assembly protein  43.22 
 
 		 402 aa  178  2e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0565513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0318  TraB pilus assembly family protein  36.8 
 
 		 422 aa  169  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3779  TraB pilus assembly family protein  31.62 
 
 		 468 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.603832  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4287  conjugal transfer pilus assembly protein TraB  30 
 
 		 466 aa  142  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0035  conjugal transfer pilus assembly protein TraB  29.37 
 
 		 475 aa  127  3e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1081  conjugal transfer protein, putative  29.33 
 
 		 543 aa  121  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_06  conjugative transfer protein TraB  26.42 
 
 		 476 aa  121  3e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4537  TraB pilus assembly family protein  31.27 
 
 		 508 aa  120  7e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.749618  normal  0.479712 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4376  TraB pilus assembly family protein  31.27 
 
 		 508 aa  120  7e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4629  TraB pilus assembly family protein  31.14 
 
 		 509 aa  119  9e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.803556 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4500  TraB pilus assembly family protein  31.27 
 
 		 509 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4440  TraB pilus assembly family protein  30.91 
 
 		 508 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4444  TraB pilus assembly family protein  30.91 
 
 		 508 aa  118  3e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4224  putative conjugative transfer factor, TraB  31.42 
 
 		 417 aa  108  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0018  hypothetical protein  33.64 
 
 		 457 aa  107  5e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.6486  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6227  hypothetical protein  30.94 
 
 		 453 aa  107  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.771617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4009  TraB pilus assembly family protein  32.56 
 
 		 458 aa  105  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.702041  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4258  TraB pilus assembly family protein  30.57 
 
 		 452 aa  104  4e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.346298  normal  0.0301907 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0026  hypothetical protein  29.08 
 
 		 484 aa  102  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2159  TraB pilus assembly  32.7 
 
 		 446 aa  93.6  6e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5368  TraB pilus assembly family protein  29.31 
 
 		 443 aa  88.6  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.181212 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>