29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_6227 on replicon NC_010070
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010070  Bmul_6227  hypothetical protein  100 
 
 
453 aa  906    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.771617  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0367  sex pilus assembly protein  34.22 
 
 
402 aa  124  3e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0565513  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1081  conjugal transfer protein, putative  30.28 
 
 
543 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2317  TraB pilus assembly  32.46 
 
 
456 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.653277  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1538  TraB pilus assembly family protein  29.63 
 
 
472 aa  108  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.245365 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2650  TraB pilus assembly  34.27 
 
 
457 aa  106  9e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.835433  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0932  sex pilus assembly protein  27.05 
 
 
446 aa  104  3e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.112358  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0255  TraB pilus assembly family protein  30.67 
 
 
418 aa  103  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.844609  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0076  type IV conjugative transfer system protein TraB  33.33 
 
 
438 aa  101  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0318  TraB pilus assembly family protein  30.22 
 
 
422 aa  93.2  9e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3779  TraB pilus assembly family protein  31.32 
 
 
468 aa  87.8  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.603832  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4287  conjugal transfer pilus assembly protein TraB  29.74 
 
 
466 aa  87.4  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6794  TraB pilus assembly family protein  33.33 
 
 
440 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0035  conjugal transfer pilus assembly protein TraB  32.96 
 
 
475 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4181  TraB pilus assembly family protein  28.44 
 
 
449 aa  78.2  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000413656  hitchhiker  0.000231943 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_06  conjugative transfer protein TraB  27.32 
 
 
476 aa  73.2  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4009  TraB pilus assembly family protein  25.95 
 
 
458 aa  68.6  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.702041  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4444  TraB pilus assembly family protein  25.56 
 
 
508 aa  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4629  TraB pilus assembly family protein  25.11 
 
 
509 aa  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.803556 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4440  TraB pilus assembly family protein  26.52 
 
 
508 aa  65.9  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4500  TraB pilus assembly family protein  25.97 
 
 
509 aa  65.5  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4537  TraB pilus assembly family protein  25.97 
 
 
508 aa  65.9  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.749618  normal  0.479712 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4376  TraB pilus assembly family protein  25.97 
 
 
508 aa  65.9  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4224  putative conjugative transfer factor, TraB  25.2 
 
 
417 aa  63.5  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2159  TraB pilus assembly  26.37 
 
 
446 aa  62  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4258  TraB pilus assembly family protein  24.1 
 
 
452 aa  60.8  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.346298  normal  0.0301907 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0018  hypothetical protein  27.12 
 
 
457 aa  58.9  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.6486  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5368  TraB pilus assembly family protein  26.88 
 
 
443 aa  56.6  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.181212 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0026  hypothetical protein  24.64 
 
 
484 aa  50.4  0.00007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>