More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0397 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0397  ribosomal protein S10  100 
 
 		 108 aa  217  5e-56  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4316  30S ribosomal protein S10  69.31 
 
 		 102 aa  154  3e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318544 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3924  30S ribosomal protein S10  69.31 
 
 		 102 aa  154  3e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3906  30S ribosomal protein S10  70.3 
 
 		 102 aa  152  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0687  30S ribosomal protein S10  69.31 
 
 		 102 aa  151  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.38034 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1184  30S ribosomal protein S10  66.34 
 
 		 102 aa  150  4e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0592971 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2647  30S ribosomal protein S10  69.31 
 
 		 102 aa  150  5e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.186933  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6050  30S ribosomal protein S10  68.32 
 
 		 102 aa  150  5e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0825788  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4322  ribosomal protein S10  68.32 
 
 		 102 aa  150  5e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5123  ribosomal protein S10  68.32 
 
 		 102 aa  150  5e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.971498 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0581  30S ribosomal protein S10  68.32 
 
 		 102 aa  150  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1085  30S ribosomal protein S10  67.33 
 
 		 102 aa  149  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0930  30S ribosomal protein S10  66.34 
 
 		 102 aa  147  7e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243784  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0561  30S ribosomal protein S10  66.34 
 
 		 102 aa  145  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3759  ribosomal protein S10  67 
 
 		 101 aa  145  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.542492  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6615  30S ribosomal protein S10  67 
 
 		 101 aa  145  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4508  ribosomal protein S10  67 
 
 		 101 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.815174  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3436  ribosomal protein S10  67 
 
 		 101 aa  145  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1039  30S ribosomal protein S10  67 
 
 		 101 aa  144  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5050  30S ribosomal protein S10  67 
 
 		 101 aa  144  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.38543 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0193  SSU ribosomal protein S10P  65.69 
 
 		 103 aa  144  3e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000113928  normal  0.060255 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03970  30S ribosomal protein S10  67 
 
 		 101 aa  144  3e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.914635 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1012  30S ribosomal protein S10  67 
 
 		 101 aa  144  3e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1122  30S ribosomal protein S10  66 
 
 		 101 aa  144  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0305  30S ribosomal protein S10  66.34 
 
 		 102 aa  145  3e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170298 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1029  30S ribosomal protein S10  67 
 
 		 101 aa  144  3e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.632906 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1304  30S ribosomal protein S10  67 
 
 		 101 aa  144  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.155802  normal  0.101468 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17170  30S ribosomal protein S10  66.34 
 
 		 102 aa  144  5e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0484484  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20880  SSU ribosomal protein S10P  66.34 
 
 		 102 aa  144  6e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0503549  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2660  ribosomal protein S10  65.35 
 
 		 102 aa  143  7.0000000000000006e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10714  30S ribosomal protein S10  66 
 
 		 101 aa  143  8.000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.193361 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29750  SSU ribosomal protein S10P  65.35 
 
 		 102 aa  143  8.000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.2403 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0586  ribosomal protein S10  65.35 
 
 		 102 aa  143  8.000000000000001e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.114557  normal  0.306746 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2688  30S ribosomal protein S10  65.35 
 
 		 102 aa  142  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.832571 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2976  30S ribosomal protein S10  65.35 
 
 		 102 aa  142  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.430962  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3144  ribosomal protein S10  64.36 
 
 		 102 aa  142  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0968346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0626  ribosomal protein S10  64.36 
 
 		 102 aa  141  2e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23820  SSU ribosomal protein S10P  65.35 
 
 		 102 aa  142  2e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1163  ribosomal protein S10  65.35 
 
 		 102 aa  141  3e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000000940072  hitchhiker  0.000000509949 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0757  30S ribosomal protein S10  64.71 
 
 		 103 aa  140  5e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515165  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2902  30S ribosomal protein S10  63.73 
 
 		 103 aa  139  9.999999999999999e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000945352  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0214  ribosomal protein S10  65.66 
 
 		 102 aa  138  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114911  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2715  30S ribosomal protein S10  66.34 
 
 		 102 aa  136  7.999999999999999e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000442606  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2400  30S ribosomal protein S10  66.34 
 
 		 102 aa  136  7.999999999999999e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000028025  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1525  ribosomal protein S10  62.38 
 
 		 102 aa  136  1e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.651999  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2712  ribosomal protein S10  62.38 
 
 		 102 aa  135  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000160608  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1706  30S ribosomal protein S10  61.39 
 
 		 102 aa  135  2e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00186428  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0421  30S ribosomal protein S10  62.38 
 
 		 102 aa  135  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000238297  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1575  ribosomal protein S10  58.42 
 
 		 102 aa  135  2e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000000735097  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0980  ribosomal protein S10  60.61 
 
 		 106 aa  134  3.0000000000000003e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.604539  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1746  30S ribosomal protein S10  59.62 
 
 		 106 aa  135  3.0000000000000003e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000231589  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0224  ribosomal protein S10  63.37 
 
 		 102 aa  134  4e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2461  30S ribosomal protein S10  61.39 
 
 		 102 aa  134  4e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.043315 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0866  30S ribosomal protein S10  62 
 
 		 102 aa  134  5e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000610931  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16250  SSU ribosomal protein S10P  61.39 
 
 		 107 aa  134  5e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00216069  hitchhiker  0.00000702102 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01160  ribosomal protein S10  62.63 
 
 		 103 aa  133  6.0000000000000005e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000349687  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1484  30S ribosomal protein S10  61.39 
 
 		 102 aa  133  7.000000000000001e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000272811  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0961  ribosomal protein S10  60.4 
 
 		 102 aa  133  9.999999999999999e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000260411  hitchhiker  0.000000000152054 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10030  SSU ribosomal protein S10P  60.4 
 
 		 102 aa  133  9.999999999999999e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000017716  hitchhiker  0.00000000188362 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0285  ribosomal protein S10  60.61 
 
 		 102 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0119984  hitchhiker  0.00531479 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1395  30S ribosomal protein S10  60.61 
 
 		 102 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00721101  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0985  30S ribosomal protein S10  66.67 
 
 		 102 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.547253  normal  0.0405609 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1291  30S ribosomal protein S10  60.61 
 
 		 102 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000123252  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1234  30S ribosomal protein S10  65.66 
 
 		 102 aa  131  3e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.159706  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1331  30S ribosomal protein S10  66.67 
 
 		 102 aa  131  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.104333  normal  0.0980723 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1197  30S ribosomal protein S10  65.66 
 
 		 102 aa  131  3e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.56445  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3449  30S ribosomal protein S10  64.65 
 
 		 102 aa  131  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.852431 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1839  30S ribosomal protein S10  65.66 
 
 		 102 aa  131  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.051766  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2402  30S ribosomal protein S10  58.42 
 
 		 102 aa  131  3e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000476333  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1429  30S ribosomal protein S10  66.67 
 
 		 102 aa  131  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0117668  normal  0.0108914 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0195  30S ribosomal protein S10  58.42 
 
 		 102 aa  131  3e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00451174  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1955  30S ribosomal protein S10  65.66 
 
 		 102 aa  131  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158653  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0110  30S ribosomal protein S10  59.41 
 
 		 102 aa  131  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000437851  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1363  30S ribosomal protein S10  64.65 
 
 		 102 aa  130  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.562313 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2294  30S ribosomal protein S10  64.65 
 
 		 102 aa  130  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.335659 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3185  30S ribosomal protein S10  64.65 
 
 		 102 aa  130  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.887844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1544  30S ribosomal protein S10  64.65 
 
 		 102 aa  130  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3668  30S ribosomal protein S10  64.65 
 
 		 102 aa  130  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5071  30S ribosomal protein S10  64.65 
 
 		 102 aa  130  3.9999999999999996e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.755306 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1678  30S ribosomal protein S10  65.66 
 
 		 102 aa  131  3.9999999999999996e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.196634  hitchhiker  0.0000449756 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2735  ribosomal protein S10  59.41 
 
 		 102 aa  130  5e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.796099  normal  0.119445 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0106  30S ribosomal protein S10  58.42 
 
 		 102 aa  130  6e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1868  30S ribosomal protein S10  62.89 
 
 		 107 aa  130  6e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0207865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1907  30S ribosomal protein S10  64.65 
 
 		 102 aa  130  6.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000187857  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0354  30S ribosomal protein S10  64.65 
 
 		 102 aa  130  6.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.953045  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0720  30S ribosomal protein S10  64.65 
 
 		 105 aa  130  7.999999999999999e-30  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0939005  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4027  30S ribosomal protein S10  58.42 
 
 		 102 aa  130  7.999999999999999e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000005274 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0707  30S ribosomal protein S10  57.14 
 
 		 105 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.282417  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0057  30S ribosomal protein S10  56.44 
 
 		 102 aa  129  1.0000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0000459643  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1554  30S ribosomal protein S10  59.41 
 
 		 103 aa  129  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000633059  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0140  30S ribosomal protein S10  58.42 
 
 		 102 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000306915  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0105  30S ribosomal protein S10  58.42 
 
 		 102 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.602740000000001e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0103  30S ribosomal protein S10  58.42 
 
 		 102 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000504345  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0121  30S ribosomal protein S10  58.42 
 
 		 102 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.5859e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5196  30S ribosomal protein S10  58.42 
 
 		 102 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000324324  unclonable  1.19812e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0104  30S ribosomal protein S10  58.42 
 
 		 102 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000227261  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1796  SSU ribosomal protein S10P  62 
 
 		 104 aa  128  2.0000000000000002e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.13057  normal  0.040484 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1908  30S ribosomal protein S10  56.44 
 
 		 102 aa  129  2.0000000000000002e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000309802  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0130  30S ribosomal protein S10  58.42 
 
 		 102 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000826776  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0103  30S ribosomal protein S10  58.42 
 
 		 102 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000302631  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>