More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3273 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_3273  ParB family protein  100 
 
 
369 aa  726    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3933  chromosome segregation DNA-binding protein  34.78 
 
 
292 aa  108  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000290836  hitchhiker  0.00288573 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4025  chromosome segregation DNA-binding protein  34.78 
 
 
292 aa  108  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.006539  normal  0.910655 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4138  chromosome segregation DNA-binding protein  34.78 
 
 
292 aa  108  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.001205  hitchhiker  0.000138083 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4755  ParB family protein  33.04 
 
 
292 aa  107  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3964  parB-like partition protein  36.52 
 
 
292 aa  103  5e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.20429  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2174  parB-like partition proteins  38.46 
 
 
289 aa  103  6e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000145902  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2334  parB-like partition protein  35.05 
 
 
286 aa  102  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000401981  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3760  parB-like partition proteins  40.26 
 
 
294 aa  102  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0200998  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3965  parB-like partition protein  35.87 
 
 
307 aa  102  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0008  parB-like partition protein  33.17 
 
 
281 aa  101  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2154  chromosome segregation DNA-binding protein  37.19 
 
 
321 aa  100  3e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4515  parB-like partition protein  38.51 
 
 
292 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0559335  normal  0.0103959 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4374  parB-like partition protein  38.51 
 
 
292 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000285839  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4318  parB-like partition protein  38.51 
 
 
292 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0394503  hitchhiker  0.000000000117233 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4373  parB-like partition protein  38.51 
 
 
292 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000487851  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4248  parB-like partition protein  34.33 
 
 
294 aa  100  5e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00203372  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0195  chromosome partitioning protein  38.51 
 
 
290 aa  99.8  7e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1936  parB-like partition protein  38.61 
 
 
296 aa  99.4  8e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2128  ParB-like partition protein  38.51 
 
 
288 aa  99.4  8e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0007  parB-like partition proteins  40.98 
 
 
292 aa  99  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3780  chromosome segregation DNA-binding protein  41.38 
 
 
303 aa  97.4  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000296744 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4106  chromosome segregation DNA-binding protein  40.41 
 
 
284 aa  97.4  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000709761  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02929  chromosome partitioning protein  34.67 
 
 
309 aa  97.4  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0207  parB-like partition protein  33.85 
 
 
283 aa  97.1  5e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0004  parB-like partition protein  33.48 
 
 
314 aa  96.7  5e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3853  parB-like partition protein  35.19 
 
 
292 aa  96.7  6e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0431793  unclonable  0.00000203867 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3201  parB-like partition protein  36.9 
 
 
296 aa  96.3  8e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4906  parB-like partition protein  38.06 
 
 
296 aa  96.3  8e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00066278  normal  0.174016 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0862  parB-like partition protein  32.55 
 
 
293 aa  95.9  9e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1399  parB-like partition protein  44.6 
 
 
310 aa  94.7  2e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2767  parB-like partition proteins  38.36 
 
 
285 aa  95.1  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000194668  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4494  ParB family protein  38.89 
 
 
294 aa  95.1  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00131449  hitchhiker  0.00000708734 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  34.45 
 
 
289 aa  94.7  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3652  ParB family protein  37.66 
 
 
292 aa  94.4  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0209333  unclonable  0.00000847343 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1473  chromosome partitioning protein  43.88 
 
 
310 aa  94.4  3e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0115  chromosome segregation DNA-binding protein  34.93 
 
 
295 aa  94.4  3e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5027  parB-like partition protein  37.85 
 
 
297 aa  94  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0056  chromosome segregation DNA-binding protein  35.59 
 
 
313 aa  94  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5942  parB-like partition protein  40.28 
 
 
295 aa  94  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2752  chromosome segregation DNA-binding protein  36.81 
 
 
286 aa  93.6  4e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000743085  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0656  parB-like partition protein  39.77 
 
 
362 aa  93.2  7e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.235927  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0051  parB-like partition protein  34.04 
 
 
311 aa  92.8  7e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3292  chromosome segregation DNA-binding protein  41.67 
 
 
306 aa  93.2  7e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0014  chromosome partitioning protein ParB  31.3 
 
 
303 aa  92.8  7e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.110445  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0068  parB-like partition proteins  36.36 
 
 
311 aa  92.8  8e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.820114 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3902  parB-like partition protein  38.71 
 
 
295 aa  92.8  8e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0198  parB-like partition protein  35.48 
 
 
302 aa  92.8  8e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.395189 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2805  hypothetical protein  33.82 
 
 
289 aa  92  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0029  chromosome segregation DNA-binding protein  34.63 
 
 
305 aa  92  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4385  chromosome partitioning protein  38.36 
 
 
292 aa  92.4  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4053  parB-like partition proteins  38.19 
 
 
293 aa  92  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2951  hypothetical protein  33.83 
 
 
301 aa  91.3  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3372  parB-like partition protein  32.58 
 
 
529 aa  91.7  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0078  chromosome segregation DNA-binding protein  34.78 
 
 
311 aa  91.3  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0893  parB-like partition protein  37.01 
 
 
279 aa  92  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2058  chromosome partitioning protein ParB  31.16 
 
 
293 aa  90.9  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3036  parB-like partition protein  38.22 
 
 
310 aa  91.3  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3317  stage 0 sporulation protein J, putative  38.71 
 
 
295 aa  90.9  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0408  parB-like partition protein  31.3 
 
 
278 aa  90.9  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0649712  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0419  parB-like partition protein  31.3 
 
 
278 aa  90.9  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.220541  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1978  chromosome partitioning protein ParB  31.16 
 
 
293 aa  90.9  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0035  parB-like partition proteins  44 
 
 
304 aa  90.5  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23510  parB-like partition protein  40.15 
 
 
287 aa  90.5  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.107848  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2438  parB-like partition proteins  32.66 
 
 
297 aa  90.9  4e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.291744  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4303  parB-like partition proteins  35.62 
 
 
290 aa  90.5  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.279457  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0031  chromosome segregation DNA-binding protein  37.42 
 
 
295 aa  90.1  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0038  spoOJ protein  32.24 
 
 
280 aa  89.4  8e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0133  chromosome segregation DNA-binding protein  36.32 
 
 
315 aa  89.7  8e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1068  parB-like partition proteins  35.16 
 
 
303 aa  89.7  8e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.701967  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3278  chromosome segregation DNA-binding protein  37.42 
 
 
305 aa  89.4  9e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325017  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2959  parB-like partition proteins  32.46 
 
 
297 aa  89.4  9e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0113  parB-like partition protein  32.46 
 
 
297 aa  89.4  9e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0096  parB-like partition proteins  32.46 
 
 
305 aa  89.4  9e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4053  ParB family protein  38.06 
 
 
295 aa  89.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2947  stage 0 sporulation protein J, putative  38.06 
 
 
295 aa  89.4  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3006  putative stage 0 sporulation protein J  38.06 
 
 
295 aa  89.4  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0187  chromosome partitioning protein ParB  38.06 
 
 
295 aa  89.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0323647  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1596  putative stage 0 sporulation protein J  38.06 
 
 
295 aa  89.4  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.265363  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  36.88 
 
 
286 aa  89  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4615  chromosome segregation DNA-binding protein  39.38 
 
 
289 aa  89  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3979  ParB family protein  38.06 
 
 
295 aa  89.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0625323  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3364  putative stage 0 sporulation protein J  38.06 
 
 
295 aa  89.4  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4094  parB-like partition protein  35.19 
 
 
306 aa  89  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0135978 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3927  parB-like partition protein  37.74 
 
 
293 aa  89  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.47088 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002022  chromosome (plasmid) partitioning protein ParB/stage 0 sporulation protein J  30.65 
 
 
293 aa  88.2  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000100798  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4253  parB-like partition protein  37.11 
 
 
293 aa  88.2  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  46.03 
 
 
274 aa  88.6  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3082  ParB-like partition protein  39.1 
 
 
291 aa  88.2  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0110147  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0940  parB-like partition protein  35.75 
 
 
409 aa  87.8  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3956  parB-like partition protein  37.11 
 
 
279 aa  88.2  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3468  chromosome segregation DNA-binding protein  37.74 
 
 
288 aa  88.2  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2145  parB-like partition protein  36.21 
 
 
283 aa  88.2  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2551  parB-like partition protein  32.88 
 
 
379 aa  87.8  3e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00820425  normal  0.388314 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3042  parB-like partition protein  32.11 
 
 
294 aa  87.8  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1653  parB-like partition protein  40 
 
 
300 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623968  normal  0.854391 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  41.61 
 
 
294 aa  87.8  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1586  parB-like partition protein  40 
 
 
300 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.746131  normal  0.0130059 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4041  parB-like partition protein  37.11 
 
 
279 aa  87.4  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111922 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2520  ParB family protein  32.31 
 
 
293 aa  87.8  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000102448  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>