74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2903 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_2903  respiratory nitrite reductase specific menaquinol--cytochrome-c reductase (NrfH) precursor  100 
 
 
151 aa  311  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2988  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  97.35 
 
 
151 aa  306  6.999999999999999e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3093  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  96.69 
 
 
151 aa  305  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0956  cytochrome c-type protein  68.38 
 
 
150 aa  201  3e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.394996  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0961  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  69.35 
 
 
151 aa  184  4e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.176798  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0964  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  69.35 
 
 
151 aa  184  4e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0911  respiratory nitrite reductase specific menaquinol--cytochrome-c reductase (NrfH) precursor  69.35 
 
 
151 aa  183  6e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.890022  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4607  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  47.4 
 
 
158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2867  cytochrome c nitrite reductase  43.65 
 
 
177 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1821  cytochrome c nitrite reductase, small subunit NrfH  41.61 
 
 
203 aa  117  6e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1979  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  39.61 
 
 
172 aa  116  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.257844 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1100  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  34.78 
 
 
205 aa  108  2.0000000000000002e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0130  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  39.72 
 
 
180 aa  108  4.0000000000000004e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0706  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  38.73 
 
 
177 aa  106  1e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000199981  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1023  cytochrome c nitrite reductase, small subunit NrfH  34.15 
 
 
164 aa  99.8  1e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.127457  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0340  cytochrome c-type protein nrfH  34.64 
 
 
171 aa  97.1  7e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.349319  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4235  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  35.33 
 
 
161 aa  96.3  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1547  cytochrome c-type protein nrfH  34.78 
 
 
171 aa  95.9  2e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1360  cytochrome c-type protein nrfH  34.78 
 
 
171 aa  95.9  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1243  cytochrome c-type protein NrfH  32.24 
 
 
166 aa  92  2e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1893  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  36.7 
 
 
174 aa  82  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0693886  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2399  cytochrome c nitrite reductase, small subunit NrfH, putative  34.04 
 
 
153 aa  82  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.524559  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0700  cytochrome c nitrite reductase small subunit NrfH  34.55 
 
 
153 aa  77  0.00000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3707  cytochrome c nitrite reductase, small subunit NrfH, putative  34.38 
 
 
152 aa  72.4  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.741906  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0664  hypothetical protein  34.29 
 
 
154 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0192323  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1199  cytochrome c nitrite reductase, small subunit NrfH, putative  33.04 
 
 
154 aa  70.9  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2386  cytochrome c nitrite reductase small subunit  33.82 
 
 
158 aa  70.1  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1043  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  33.09 
 
 
161 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00711927  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0295  respiratory nitrite reductase specific menaquinol--cytochrome-c reductase (NrfH) precursor  31.53 
 
 
153 aa  68.2  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000597678  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1522  cytochrome c nitrite reductase small subunit NrfH  33.33 
 
 
125 aa  67.4  0.00000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2334  NapC/NirT cytochrome c family protein  35.21 
 
 
159 aa  66.2  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000913356 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3155  cytochrome c nitrite reductase, small subunit NrfH, putative  34.65 
 
 
134 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1491  cytochrome c nitrite reductase small subunit  32.14 
 
 
159 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2096  NapC/NirT cytochrome c family protein  30.71 
 
 
158 aa  64.3  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.999464  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0082  NapC/NirT cytochrome c family protein  30.77 
 
 
155 aa  57.4  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.2818  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0799  putative tetraheme cytochrome c  28.65 
 
 
183 aa  53.5  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  unclonable  0.000000000000122582  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3630  cytochrome c nitrite reductase, small subunit NrfH  25.52 
 
 
166 aa  52.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000885954  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1635  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  26.14 
 
 
180 aa  50.1  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000671983  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1875  NapC/NirT cytochrome c-like  29.31 
 
 
391 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0299  trimethylamine N-oxide reductase, cytochrome c-type subunit  26.67 
 
 
188 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.649247  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2384  NapC/NirT cytochrome c domain protein  27.5 
 
 
185 aa  46.6  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000872  cytochrome c-type protein TorY  24.12 
 
 
364 aa  45.8  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1582  NapC/NirT cytochrome c, N-terminal  25.6 
 
 
195 aa  45.1  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.220778  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4756  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  29.41 
 
 
188 aa  44.7  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.540179  unclonable  0.0000000129737 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06847  cytochrome c protein, subunit of nitrate reductase  24.1 
 
 
364 aa  44.3  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2415  cytochrome c-type protein NapC  23.67 
 
 
200 aa  43.5  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4155  cytochrome c-type protein torC  24.29 
 
 
394 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4034  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  24.29 
 
 
394 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003774  putative cytochrome c-type protein  24.58 
 
 
194 aa  42.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4213  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  24.29 
 
 
394 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02088  hypothetical protein  25.3 
 
 
200 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.254061  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1457  periplasmic nitrate (or nitrite) reductase c-type cytochrome, NapC/NirT family  25.3 
 
 
200 aa  42  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3339  cytochrome c-type protein NapC  25.3 
 
 
200 aa  42  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2501  cytochrome c-type protein NapC  25.3 
 
 
200 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02129  nitrate reductase, cytochrome c-type, periplasmic  25.3 
 
 
200 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.268616  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1678  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  27.88 
 
 
196 aa  42  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.184526  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2340  cytochrome c-type protein NapC  25.3 
 
 
200 aa  42  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2350  cytochrome c-type protein NapC  25.3 
 
 
200 aa  42  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0739  cytochrome c-type protein NapC  25.3 
 
 
200 aa  42  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4106  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  24.29 
 
 
394 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4051  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  24.29 
 
 
394 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1448  cytochrome c-type protein NapC  25.3 
 
 
200 aa  41.6  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2719  cytochrome c-type protein NapC  23.08 
 
 
200 aa  41.6  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4075  NapC/NirT cytochrome c-like  26.42 
 
 
198 aa  41.6  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.621031  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1539  cytochrome c-type protein YecK  26.67 
 
 
368 aa  41.2  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2609  trimethylamine N-oxide reductase III, c-type cytochrome subunit TorY  23.42 
 
 
366 aa  40.4  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.637408  hitchhiker  0.00703853 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2128  cytochrome c-type protein torC  25 
 
 
390 aa  40.4  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2599  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  25 
 
 
390 aa  40.4  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.426905 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4367  putative cytochrome c-type protein  27.14 
 
 
160 aa  40.4  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1113  cytochrome c-type protein torC  25 
 
 
390 aa  40.4  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.444567  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1107  cytochrome c-type protein torC  25 
 
 
390 aa  40.4  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0861  hypothetical protein  28.28 
 
 
507 aa  40.4  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000162424  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2646  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  25 
 
 
390 aa  40.4  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1232  cytochrome c-type protein torC  25 
 
 
390 aa  40.4  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>