68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0664 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0664  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  319  9.000000000000001e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0192323  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3707  cytochrome c nitrite reductase, small subunit NrfH, putative  70.39 
 
 		 152 aa  237  4e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.741906  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3155  cytochrome c nitrite reductase, small subunit NrfH, putative  75.37 
 
 		 134 aa  224  4e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1043  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  60.96 
 
 		 161 aa  197  6e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00711927  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2399  cytochrome c nitrite reductase, small subunit NrfH, putative  63.16 
 
 		 153 aa  186  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.524559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0295  respiratory nitrite reductase specific menaquinol--cytochrome-c reductase (NrfH) precursor  61.07 
 
 		 153 aa  184  3e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000597678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1199  cytochrome c nitrite reductase, small subunit NrfH, putative  64.04 
 
 		 154 aa  160  8.000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0706  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  31.01 
 
 		 177 aa  95.9  2e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000199981  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1893  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  40 
 
 		 174 aa  94  7e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0693886  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1100  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  32.89 
 
 		 205 aa  93.6  9e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1821  cytochrome c nitrite reductase, small subunit NrfH  26.22 
 
 		 203 aa  79.3  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4235  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  32.03 
 
 		 161 aa  77.8  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2386  cytochrome c nitrite reductase small subunit  34.56 
 
 		 158 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1491  cytochrome c nitrite reductase small subunit  35.37 
 
 		 159 aa  72.8  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2334  NapC/NirT cytochrome c family protein  33.33 
 
 		 159 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000913356 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2903  respiratory nitrite reductase specific menaquinol--cytochrome-c reductase (NrfH) precursor  34.29 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2096  NapC/NirT cytochrome c family protein  34.38 
 
 		 158 aa  71.2  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.999464  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2988  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  33.57 
 
 		 151 aa  70.5  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0082  NapC/NirT cytochrome c family protein  33.79 
 
 		 155 aa  69.3  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.2818  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3093  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  32.86 
 
 		 151 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0340  cytochrome c-type protein nrfH  27.78 
 
 		 171 aa  69.3  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.349319  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1360  cytochrome c-type protein nrfH  27.78 
 
 		 171 aa  67  0.00000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1547  cytochrome c-type protein nrfH  27.78 
 
 		 171 aa  67  0.00000000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3630  cytochrome c nitrite reductase, small subunit NrfH  31.65 
 
 		 166 aa  65.9  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000885954  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0956  cytochrome c-type protein  30.53 
 
 		 150 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.394996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2867  cytochrome c nitrite reductase  32.77 
 
 		 177 aa  64.7  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0700  cytochrome c nitrite reductase small subunit NrfH  26.98 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4607  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  27.52 
 
 		 158 aa  63.9  0.0000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1979  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  26.52 
 
 		 172 aa  62  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.257844 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1522  cytochrome c nitrite reductase small subunit NrfH  30.91 
 
 		 125 aa  60.5  0.000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0961  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  30 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.176798  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0964  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  30 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0911  respiratory nitrite reductase specific menaquinol--cytochrome-c reductase (NrfH) precursor  30 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.890022  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0807  cytochrome c-type protein  25.57 
 
 		 378 aa  57.8  0.00000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1243  cytochrome c-type protein NrfH  24.03 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1023  cytochrome c nitrite reductase, small subunit NrfH  23.38 
 
 		 164 aa  53.9  0.0000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.127457  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1063  hypothetical protein  35.23 
 
 		 507 aa  52.4  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.27837e-22 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0130  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  25 
 
 		 180 aa  52.8  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3199  hypothetical protein  35.23 
 
 		 507 aa  52  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00139796  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0799  putative tetraheme cytochrome c  25.15 
 
 		 183 aa  51.6  0.000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  unclonable  0.000000000000122582  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1635  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  25.15 
 
 		 180 aa  50.8  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000671983  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2199  cytochrome c family protein  30.08 
 
 		 468 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0994812  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3174  cytochrome c family protein  29.06 
 
 		 504 aa  50.8  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.000000000000139741  normal  0.372287 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2287  cytochrome c family protein  30.08 
 
 		 468 aa  50.8  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0861  hypothetical protein  34.09 
 
 		 507 aa  50.4  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000162424  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1659  cytochrome c family protein  31.93 
 
 		 468 aa  50.4  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228643  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2384  NapC/NirT cytochrome c domain protein  25.95 
 
 		 185 aa  47  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1947  nitrate/TMAO reductase  26.01 
 
 		 192 aa  46.6  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.674395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0299  trimethylamine N-oxide reductase, cytochrome c-type subunit  25 
 
 		 188 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.649247  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1539  cytochrome c-type protein YecK  24.68 
 
 		 368 aa  45.1  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2609  trimethylamine N-oxide reductase III, c-type cytochrome subunit TorY  23.98 
 
 		 366 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.637408  hitchhiker  0.00703853 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0452  cytochrome c family protein  30.68 
 
 		 478 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.395423  normal  0.353435 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3259  cytochrome c family protein  27.35 
 
 		 507 aa  42.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00302296  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3161  cytochrome c-type protein NapC  26.9 
 
 		 237 aa  42.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3342  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  25 
 
 		 392 aa  42.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.688416  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4219  denitrification system component NirT/cytochrome c552  25.15 
 
 		 603 aa  42.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.50309  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01844  TMAO reductase III (TorYZ), cytochrome c-type subunit  25.17 
 
 		 366 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2584  cytochrome c family protein  26.79 
 
 		 496 aa  42.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01833  hypothetical protein  25.17 
 
 		 366 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2712  cytochrome c family protein  27.19 
 
 		 501 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.627653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0138  putative tetraheme cytochrome c  22.36 
 
 		 190 aa  42  0.003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0617458  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1767  NapC/NirT cytochrome c domain protein  24.49 
 
 		 366 aa  41.6  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.936098  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2180  hypothetical protein  28.69 
 
 		 346 aa  40.4  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05451  cytochrome c protein, subunit of nitrate reductase  22.22 
 
 		 361 aa  40.4  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3232  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  28.44 
 
 		 386 aa  40.4  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000448194 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1313  trimethylamine N-oxide reductase III, c-type cytochrome subunit TorY  24.49 
 
 		 366 aa  40.4  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.563249 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2086  NapC/NirT cytochrome c domain protein  29.57 
 
 		 210 aa  40.4  0.009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0195  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  24.04 
 
 		 187 aa  40  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.14908 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>