74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0911 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_0911  respiratory nitrite reductase specific menaquinol--cytochrome-c reductase (NrfH) precursor  100 
 
 
151 aa  307  4e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.890022  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0961  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  99.34 
 
 
151 aa  306  9e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.176798  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0964  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  99.34 
 
 
151 aa  306  9e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0956  cytochrome c-type protein  77.37 
 
 
150 aa  223  8e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.394996  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3093  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  65.77 
 
 
151 aa  202  9e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2988  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  65.77 
 
 
151 aa  202  1e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2903  respiratory nitrite reductase specific menaquinol--cytochrome-c reductase (NrfH) precursor  65.77 
 
 
151 aa  202  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4607  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  45.45 
 
 
158 aa  146  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2867  cytochrome c nitrite reductase  44.44 
 
 
177 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1979  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  41.18 
 
 
172 aa  117  4.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.257844 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0130  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  39.01 
 
 
180 aa  108  3e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1821  cytochrome c nitrite reductase, small subunit NrfH  40 
 
 
203 aa  106  1e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1100  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  35.14 
 
 
205 aa  104  4e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0706  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  37.25 
 
 
177 aa  99.4  2e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000199981  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1023  cytochrome c nitrite reductase, small subunit NrfH  34.34 
 
 
164 aa  97.8  4e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.127457  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1360  cytochrome c-type protein nrfH  34.97 
 
 
171 aa  94  7e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1547  cytochrome c-type protein nrfH  34.97 
 
 
171 aa  94  7e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0340  cytochrome c-type protein nrfH  34.97 
 
 
171 aa  93.2  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.349319  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1243  cytochrome c-type protein NrfH  32.3 
 
 
166 aa  92.4  2e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4235  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  31.88 
 
 
161 aa  73.6  0.0000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2399  cytochrome c nitrite reductase, small subunit NrfH, putative  28.86 
 
 
153 aa  72.4  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.524559  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1893  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  32.73 
 
 
174 aa  68.2  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0693886  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1199  cytochrome c nitrite reductase, small subunit NrfH, putative  32.73 
 
 
154 aa  66.6  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2386  cytochrome c nitrite reductase small subunit  32.37 
 
 
158 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3707  cytochrome c nitrite reductase, small subunit NrfH, putative  28.68 
 
 
152 aa  63.2  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.741906  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0664  hypothetical protein  29.45 
 
 
154 aa  62.4  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0192323  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0295  respiratory nitrite reductase specific menaquinol--cytochrome-c reductase (NrfH) precursor  26.85 
 
 
153 aa  61.2  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000597678  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2334  NapC/NirT cytochrome c family protein  31.21 
 
 
159 aa  61.2  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000913356 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3155  cytochrome c nitrite reductase, small subunit NrfH, putative  31.45 
 
 
134 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1875  NapC/NirT cytochrome c-like  26.97 
 
 
391 aa  58.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0700  cytochrome c nitrite reductase small subunit NrfH  27.78 
 
 
153 aa  58.2  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1043  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  28.1 
 
 
161 aa  58.2  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00711927  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1491  cytochrome c nitrite reductase small subunit  30.72 
 
 
159 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1522  cytochrome c nitrite reductase small subunit NrfH  30.56 
 
 
125 aa  55.1  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0082  NapC/NirT cytochrome c family protein  29.5 
 
 
155 aa  55.5  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.2818  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2096  NapC/NirT cytochrome c family protein  29.41 
 
 
158 aa  54.7  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.999464  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0799  putative tetraheme cytochrome c  26.01 
 
 
183 aa  52  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  unclonable  0.000000000000122582  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003774  putative cytochrome c-type protein  30.11 
 
 
194 aa  50.4  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1635  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  27.63 
 
 
180 aa  47  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000671983  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2609  trimethylamine N-oxide reductase III, c-type cytochrome subunit TorY  25.56 
 
 
366 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.637408  hitchhiker  0.00703853 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0299  trimethylamine N-oxide reductase, cytochrome c-type subunit  26.09 
 
 
188 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.649247  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3339  cytochrome c-type protein NapC  26.29 
 
 
200 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02088  hypothetical protein  26.29 
 
 
200 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.254061  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0739  cytochrome c-type protein NapC  26.29 
 
 
200 aa  44.7  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1457  periplasmic nitrate (or nitrite) reductase c-type cytochrome, NapC/NirT family  26.29 
 
 
200 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02129  nitrate reductase, cytochrome c-type, periplasmic  26.29 
 
 
200 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.268616  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1678  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  28.02 
 
 
196 aa  44.7  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.184526  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2340  cytochrome c-type protein NapC  26.29 
 
 
200 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2350  cytochrome c-type protein NapC  26.29 
 
 
200 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2501  cytochrome c-type protein NapC  26.29 
 
 
200 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1448  cytochrome c-type protein NapC  26.29 
 
 
200 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06847  cytochrome c protein, subunit of nitrate reductase  24.7 
 
 
364 aa  44.3  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000872  cytochrome c-type protein TorY  23.39 
 
 
364 aa  44.3  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1313  trimethylamine N-oxide reductase III, c-type cytochrome subunit TorY  26.76 
 
 
366 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.563249 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1860  periplasmic nitrate reductase subunit NapC  25.28 
 
 
220 aa  43.9  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.791611  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1749  NapC/NirT cytochrome c-like  27.39 
 
 
385 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.154925 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4756  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  27.59 
 
 
188 aa  42.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.540179  unclonable  0.0000000129737 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4367  putative cytochrome c-type protein  30 
 
 
160 aa  42.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1831  NapC/NirT cytochrome c family, N- region  23.76 
 
 
234 aa  42.7  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3218  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.14 
 
 
234 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2384  NapC/NirT cytochrome c domain protein  25.62 
 
 
185 aa  42  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2495  cytochrome c-type protein NapC  23.6 
 
 
200 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00306548 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2439  cytochrome c-type protein NapC  23.6 
 
 
200 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.119993  normal  0.568439 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4118  periplasmic nitrate reductase subunit NapC  25.14 
 
 
227 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2598  cytochrome c-type protein NapC  23.6 
 
 
200 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.374466 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2481  cytochrome c-type protein NapC  23.6 
 
 
200 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2390  cytochrome c-type protein NapC  23.6 
 
 
200 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1587  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  27.98 
 
 
196 aa  40.8  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2180  hypothetical protein  26.89 
 
 
346 aa  40.8  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2415  cytochrome c-type protein NapC  24.43 
 
 
200 aa  40.8  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2719  cytochrome c-type protein NapC  24.43 
 
 
200 aa  40.8  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0807  cytochrome c-type protein  25.9 
 
 
378 aa  40.4  0.008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1767  NapC/NirT cytochrome c domain protein  25.35 
 
 
366 aa  40.4  0.008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.936098  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3513  periplasmic nitrate reductase subunit NapC  26.47 
 
 
215 aa  40.4  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.654609  normal  0.0192355 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>