61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2867 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2867  cytochrome c nitrite reductase  100 
 
 		 177 aa  370  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4607  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  57.53 
 
 		 158 aa  184  6e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1979  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  46.71 
 
 		 172 aa  162  3e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.257844 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0956  cytochrome c-type protein  45.93 
 
 		 150 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.394996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3093  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  44.29 
 
 		 151 aa  134  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2988  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  44.29 
 
 		 151 aa  134  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2903  respiratory nitrite reductase specific menaquinol--cytochrome-c reductase (NrfH) precursor  44.29 
 
 		 151 aa  134  9e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0130  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  41.55 
 
 		 180 aa  130  1.0000000000000001e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0961  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  45.24 
 
 		 151 aa  128  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.176798  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0964  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  45.24 
 
 		 151 aa  128  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0911  respiratory nitrite reductase specific menaquinol--cytochrome-c reductase (NrfH) precursor  44.44 
 
 		 151 aa  127  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.890022  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0706  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  40 
 
 		 177 aa  124  8.000000000000001e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000199981  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1100  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  38.41 
 
 		 205 aa  120  9e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1243  cytochrome c-type protein NrfH  39.1 
 
 		 166 aa  114  7.999999999999999e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1821  cytochrome c nitrite reductase, small subunit NrfH  35.58 
 
 		 203 aa  111  4.0000000000000004e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1023  cytochrome c nitrite reductase, small subunit NrfH  40.26 
 
 		 164 aa  108  5e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.127457  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0340  cytochrome c-type protein nrfH  40.54 
 
 		 171 aa  107  7.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.349319  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1547  cytochrome c-type protein nrfH  40.54 
 
 		 171 aa  107  9.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1360  cytochrome c-type protein nrfH  40.54 
 
 		 171 aa  107  9.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4235  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  31.65 
 
 		 161 aa  87.8  8e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1893  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  34.19 
 
 		 174 aa  83.6  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0693886  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2399  cytochrome c nitrite reductase, small subunit NrfH, putative  31.16 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.524559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3707  cytochrome c nitrite reductase, small subunit NrfH, putative  29.11 
 
 		 152 aa  72.8  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.741906  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0664  hypothetical protein  31.29 
 
 		 154 aa  72  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0192323  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1043  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  32.92 
 
 		 161 aa  71.2  0.000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00711927  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3155  cytochrome c nitrite reductase, small subunit NrfH, putative  30.99 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0700  cytochrome c nitrite reductase small subunit NrfH  31.82 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0295  respiratory nitrite reductase specific menaquinol--cytochrome-c reductase (NrfH) precursor  28.68 
 
 		 153 aa  65.9  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000597678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1199  cytochrome c nitrite reductase, small subunit NrfH, putative  32.17 
 
 		 154 aa  65.5  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3630  cytochrome c nitrite reductase, small subunit NrfH  26.59 
 
 		 166 aa  64.7  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000885954  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0799  putative tetraheme cytochrome c  30.54 
 
 		 183 aa  62  0.000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  unclonable  0.000000000000122582  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1446  NapC/NirT cytochrome c domain protein  28.75 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.148629  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003774  putative cytochrome c-type protein  28.93 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1522  cytochrome c nitrite reductase small subunit NrfH  30.91 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1635  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  22.7 
 
 		 180 aa  53.5  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000671983  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0299  trimethylamine N-oxide reductase, cytochrome c-type subunit  28.57 
 
 		 188 aa  53.1  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.649247  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2096  NapC/NirT cytochrome c family protein  27.59 
 
 		 158 aa  51.2  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.999464  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1831  NapC/NirT cytochrome c family, N- region  26.95 
 
 		 234 aa  49.7  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0082  NapC/NirT cytochrome c family protein  27.89 
 
 		 155 aa  48.9  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.2818  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1678  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  26.83 
 
 		 196 aa  48.1  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.184526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1875  NapC/NirT cytochrome c-like  31.37 
 
 		 391 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2063  hypothetical protein  29.09 
 
 		 615 aa  47  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.97808  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2386  cytochrome c nitrite reductase small subunit  29.41 
 
 		 158 aa  46.6  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4756  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  29.51 
 
 		 188 aa  46.2  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.540179  unclonable  0.0000000129737 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2384  NapC/NirT cytochrome c domain protein  26.32 
 
 		 185 aa  44.7  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0138  putative tetraheme cytochrome c  27.33 
 
 		 190 aa  44.7  0.0007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0617458  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1551  acetyl-coenzyme A carboxylase carboxyl transferase subunit alpha  26.37 
 
 		 190 aa  44.3  0.0008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1491  cytochrome c nitrite reductase small subunit  29.58 
 
 		 159 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2334  NapC/NirT cytochrome c family protein  29.93 
 
 		 159 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000913356 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1947  nitrate/TMAO reductase  23.72 
 
 		 192 aa  42.7  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.674395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0435  putative tetraheme cytochrome c  25.84 
 
 		 190 aa  42.7  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0127552  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0100  cytochrome c family protein  27.68 
 
 		 618 aa  42.7  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000214934  normal  0.444755 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1232  cytochrome c-type protein torC  22.96 
 
 		 390 aa  41.6  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1113  cytochrome c-type protein torC  22.96 
 
 		 390 aa  41.6  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.444567  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2128  cytochrome c-type protein torC  22.96 
 
 		 390 aa  41.6  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2599  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  22.96 
 
 		 390 aa  41.6  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.426905 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2646  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  22.96 
 
 		 390 aa  41.6  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1107  cytochrome c-type protein torC  22.96 
 
 		 390 aa  41.6  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2086  NapC/NirT cytochrome c domain protein  30.06 
 
 		 210 aa  41.6  0.006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0414  hypothetical protein  25.31 
 
 		 242 aa  40.8  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.63089  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0274  cytochrome c family protein  25.89 
 
 		 619 aa  40.8  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00552346  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>