53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1522 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1522  cytochrome c nitrite reductase small subunit NrfH  100 
 
 		 125 aa  261  2e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0700  cytochrome c nitrite reductase small subunit NrfH  38.89 
 
 		 153 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1893  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  40.54 
 
 		 174 aa  91.7  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0693886  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3630  cytochrome c nitrite reductase, small subunit NrfH  32.61 
 
 		 166 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000885954  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2096  NapC/NirT cytochrome c family protein  36.36 
 
 		 158 aa  76.6  0.00000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.999464  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2386  cytochrome c nitrite reductase small subunit  35.45 
 
 		 158 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1199  cytochrome c nitrite reductase, small subunit NrfH, putative  35.14 
 
 		 154 aa  73.6  0.0000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1100  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  31.9 
 
 		 205 aa  70.9  0.000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4235  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  33.63 
 
 		 161 aa  70.5  0.000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1043  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  32.28 
 
 		 161 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00711927  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2903  respiratory nitrite reductase specific menaquinol--cytochrome-c reductase (NrfH) precursor  33.33 
 
 		 151 aa  67.4  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2334  NapC/NirT cytochrome c family protein  34.17 
 
 		 159 aa  67.4  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000913356 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2399  cytochrome c nitrite reductase, small subunit NrfH, putative  29.09 
 
 		 153 aa  67  0.00000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.524559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2988  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  32.41 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3093  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  31.48 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1491  cytochrome c nitrite reductase small subunit  33.03 
 
 		 159 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0082  NapC/NirT cytochrome c family protein  33.04 
 
 		 155 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.2818  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4607  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  33.64 
 
 		 158 aa  64.3  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1547  cytochrome c-type protein nrfH  31.09 
 
 		 171 aa  63.9  0.0000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1360  cytochrome c-type protein nrfH  31.09 
 
 		 171 aa  63.9  0.0000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0130  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  32.94 
 
 		 180 aa  63.9  0.0000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3707  cytochrome c nitrite reductase, small subunit NrfH, putative  29.75 
 
 		 152 aa  63.9  0.0000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.741906  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0295  respiratory nitrite reductase specific menaquinol--cytochrome-c reductase (NrfH) precursor  30.63 
 
 		 153 aa  63.5  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000597678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1243  cytochrome c-type protein NrfH  28.33 
 
 		 166 aa  62  0.000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1821  cytochrome c nitrite reductase, small subunit NrfH  28.7 
 
 		 203 aa  61.2  0.000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0664  hypothetical protein  30.91 
 
 		 154 aa  60.5  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0192323  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0340  cytochrome c-type protein nrfH  30.25 
 
 		 171 aa  60.5  0.000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.349319  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1023  cytochrome c nitrite reductase, small subunit NrfH  30 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.127457  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3155  cytochrome c nitrite reductase, small subunit NrfH, putative  28.44 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2867  cytochrome c nitrite reductase  30.91 
 
 		 177 aa  55.1  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0961  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  30.56 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.176798  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0911  respiratory nitrite reductase specific menaquinol--cytochrome-c reductase (NrfH) precursor  30.56 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.890022  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0964  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  30.56 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0956  cytochrome c-type protein  29.36 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.394996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0706  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  28.57 
 
 		 177 aa  52.4  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000199981  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1979  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  24.37 
 
 		 172 aa  48.1  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.257844 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1875  NapC/NirT cytochrome c-like  28.15 
 
 		 391 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4367  putative cytochrome c-type protein  28.26 
 
 		 160 aa  44.7  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0799  putative tetraheme cytochrome c  29.09 
 
 		 183 aa  44.7  0.0004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  unclonable  0.000000000000122582  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2494  cytochrome c family protein  26.79 
 
 		 434 aa  43.5  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4756  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  26.67 
 
 		 188 aa  42.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.540179  unclonable  0.0000000129737 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1283  membrane-bound tetrahaem cytochrome TorC/YecK  27.21 
 
 		 392 aa  42.4  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0452  cytochrome c family protein  30.95 
 
 		 478 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.395423  normal  0.353435 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2712  cytochrome c family protein  33.33 
 
 		 501 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.627653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1659  cytochrome c family protein  31.03 
 
 		 468 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228643  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2287  cytochrome c family protein  33.7 
 
 		 468 aa  41.6  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2199  cytochrome c family protein  33.7 
 
 		 468 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0994812  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1678  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  27.74 
 
 		 196 aa  41.6  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.184526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1635  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  25 
 
 		 180 aa  40.8  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000671983  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3232  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  27.74 
 
 		 386 aa  40.4  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000448194 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1968  trimethylamine N-oxide reductase III, c-type cytochrome subunit TorY  26.12 
 
 		 366 aa  40  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2166  trimethylamine N-oxide reductase III, c-type cytochrome subunit TorY  26.12 
 
 		 366 aa  40  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1759  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  26.12 
 
 		 366 aa  40  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>