31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_1659 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_2199  cytochrome c family protein  95.73 
 
 
468 aa  822    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0994812  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1659  cytochrome c family protein  100 
 
 
468 aa  931    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228643  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2287  cytochrome c family protein  95.73 
 
 
468 aa  831    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2712  cytochrome c family protein  40.81 
 
 
501 aa  398  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.627653  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3174  cytochrome c family protein  40.6 
 
 
504 aa  389  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.000000000000139741  normal  0.372287 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3259  cytochrome c family protein  41.56 
 
 
507 aa  385  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00302296  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1063  hypothetical protein  40.52 
 
 
507 aa  375  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.27837e-22 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3199  hypothetical protein  40.96 
 
 
507 aa  377  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00139796  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0861  hypothetical protein  40.77 
 
 
507 aa  377  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000162424  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0452  cytochrome c family protein  39.53 
 
 
478 aa  330  4e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.395423  normal  0.353435 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2584  cytochrome c family protein  38.46 
 
 
496 aa  289  7e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3707  cytochrome c nitrite reductase, small subunit NrfH, putative  27.83 
 
 
152 aa  52.4  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.741906  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3155  cytochrome c nitrite reductase, small subunit NrfH, putative  30 
 
 
134 aa  52  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2334  NapC/NirT cytochrome c family protein  27.87 
 
 
159 aa  50.8  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000913356 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0664  hypothetical protein  31.93 
 
 
154 aa  50.4  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0192323  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1491  cytochrome c nitrite reductase small subunit  29.77 
 
 
159 aa  48.9  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4607  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  28.57 
 
 
158 aa  48.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01006  hypothetical protein  28.44 
 
 
390 aa  47  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00999  trimethylamine N-oxide (TMAO) reductase I, cytochrome c-type subunit  28.44 
 
 
390 aa  47  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2096  NapC/NirT cytochrome c family protein  30.39 
 
 
158 aa  47  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.999464  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2386  cytochrome c nitrite reductase small subunit  32.29 
 
 
158 aa  46.2  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2646  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  28.44 
 
 
390 aa  45.8  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1232  cytochrome c-type protein torC  28.44 
 
 
390 aa  45.8  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2128  cytochrome c-type protein torC  28.44 
 
 
390 aa  45.8  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2599  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  28.44 
 
 
390 aa  45.8  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.426905 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1113  cytochrome c-type protein torC  28.44 
 
 
390 aa  45.8  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.444567  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1107  cytochrome c-type protein torC  28.44 
 
 
390 aa  45.8  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1635  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  25.98 
 
 
180 aa  44.7  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000671983  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1446  NapC/NirT cytochrome c domain protein  27.78 
 
 
206 aa  44.7  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.148629  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1375  hypothetical protein  25.76 
 
 
151 aa  43.9  0.006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.839605  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1199  cytochrome c nitrite reductase, small subunit NrfH, putative  33.33 
 
 
154 aa  43.5  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>