24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2712 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_2712  cytochrome c family protein  100 
 
 		 501 aa  1058    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.627653  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3259  cytochrome c family protein  47.76 
 
 		 507 aa  505  9.999999999999999e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00302296  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3174  cytochrome c family protein  47.76 
 
 		 504 aa  507  9.999999999999999e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.000000000000139741  normal  0.372287 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3199  hypothetical protein  47.76 
 
 		 507 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00139796  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1063  hypothetical protein  47.35 
 
 		 507 aa  501  1e-141  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.27837e-22 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0861  hypothetical protein  47.96 
 
 		 507 aa  491  1e-137  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000162424  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2584  cytochrome c family protein  38.42 
 
 		 496 aa  367  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2287  cytochrome c family protein  40.35 
 
 		 468 aa  358  9e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2199  cytochrome c family protein  40.35 
 
 		 468 aa  354  2e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0994812  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1659  cytochrome c family protein  40.6 
 
 		 468 aa  345  1e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228643  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0452  cytochrome c family protein  37.04 
 
 		 478 aa  315  1.9999999999999998e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.395423  normal  0.353435 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2386  cytochrome c nitrite reductase small subunit  38.14 
 
 		 158 aa  53.9  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00999  trimethylamine N-oxide (TMAO) reductase I, cytochrome c-type subunit  28.99 
 
 		 390 aa  47.4  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01006  hypothetical protein  28.99 
 
 		 390 aa  47.4  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2646  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  28.99 
 
 		 390 aa  46.2  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1232  cytochrome c-type protein torC  28.99 
 
 		 390 aa  46.2  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2128  cytochrome c-type protein torC  28.99 
 
 		 390 aa  46.2  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2599  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  28.99 
 
 		 390 aa  46.2  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.426905 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1113  cytochrome c-type protein torC  28.99 
 
 		 390 aa  46.2  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.444567  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1107  cytochrome c-type protein torC  28.99 
 
 		 390 aa  46.2  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0706  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  28.57 
 
 		 177 aa  45.8  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000199981  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1283  membrane-bound tetrahaem cytochrome TorC/YecK  30.19 
 
 		 392 aa  44.7  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2096  NapC/NirT cytochrome c family protein  33.33 
 
 		 158 aa  44.3  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.999464  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1375  hypothetical protein  28.32 
 
 		 151 aa  43.9  0.007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.839605  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>