69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3155 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3155  cytochrome c nitrite reductase, small subunit NrfH, putative  100 
 
 		 134 aa  280  5.000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0664  hypothetical protein  75.37 
 
 		 154 aa  224  4e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0192323  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3707  cytochrome c nitrite reductase, small subunit NrfH, putative  75.37 
 
 		 152 aa  223  8e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.741906  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0295  respiratory nitrite reductase specific menaquinol--cytochrome-c reductase (NrfH) precursor  62.12 
 
 		 153 aa  189  1e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000597678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1043  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  62.12 
 
 		 161 aa  186  8e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00711927  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2399  cytochrome c nitrite reductase, small subunit NrfH, putative  63.16 
 
 		 153 aa  183  8e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.524559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1199  cytochrome c nitrite reductase, small subunit NrfH, putative  60.68 
 
 		 154 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1893  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  43.36 
 
 		 174 aa  107  5e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0693886  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0706  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  34.72 
 
 		 177 aa  93.2  1e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000199981  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1100  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  34.17 
 
 		 205 aa  87.4  7e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4235  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  32.03 
 
 		 161 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1821  cytochrome c nitrite reductase, small subunit NrfH  31.4 
 
 		 203 aa  75.5  0.0000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0700  cytochrome c nitrite reductase small subunit NrfH  30.25 
 
 		 153 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2386  cytochrome c nitrite reductase small subunit  35.61 
 
 		 158 aa  70.5  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2096  NapC/NirT cytochrome c family protein  32.56 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.999464  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2334  NapC/NirT cytochrome c family protein  33.33 
 
 		 159 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000913356 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2903  respiratory nitrite reductase specific menaquinol--cytochrome-c reductase (NrfH) precursor  34.65 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0082  NapC/NirT cytochrome c family protein  32.61 
 
 		 155 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.2818  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2867  cytochrome c nitrite reductase  31.16 
 
 		 177 aa  66.2  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2988  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  33.86 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0956  cytochrome c-type protein  34.15 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.394996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4607  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  27.48 
 
 		 158 aa  64.7  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1979  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  36.67 
 
 		 172 aa  64.7  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.257844 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1491  cytochrome c nitrite reductase small subunit  36.21 
 
 		 159 aa  64.3  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0340  cytochrome c-type protein nrfH  32.59 
 
 		 171 aa  63.9  0.0000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.349319  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3093  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  33.07 
 
 		 151 aa  63.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3630  cytochrome c nitrite reductase, small subunit NrfH  34.17 
 
 		 166 aa  63.5  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000885954  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1547  cytochrome c-type protein nrfH  32.59 
 
 		 171 aa  62.8  0.000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1360  cytochrome c-type protein nrfH  32.59 
 
 		 171 aa  62.8  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0961  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  31.45 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.176798  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0911  respiratory nitrite reductase specific menaquinol--cytochrome-c reductase (NrfH) precursor  31.45 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.890022  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0964  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  31.45 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1522  cytochrome c nitrite reductase small subunit NrfH  28.44 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0130  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  26.43 
 
 		 180 aa  58.2  0.00000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3174  cytochrome c family protein  34.07 
 
 		 504 aa  53.9  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.000000000000139741  normal  0.372287 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1243  cytochrome c-type protein NrfH  22.38 
 
 		 166 aa  52.4  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1659  cytochrome c family protein  30 
 
 		 468 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228643  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2199  cytochrome c family protein  30 
 
 		 468 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0994812  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2287  cytochrome c family protein  30 
 
 		 468 aa  51.6  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0861  hypothetical protein  31.87 
 
 		 507 aa  50.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000162424  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1635  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  26.32 
 
 		 180 aa  48.9  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000671983  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1023  cytochrome c nitrite reductase, small subunit NrfH  26.19 
 
 		 164 aa  48.5  0.00003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.127457  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1063  hypothetical protein  34.44 
 
 		 507 aa  48.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.27837e-22 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3199  hypothetical protein  34.44 
 
 		 507 aa  47.8  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00139796  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0452  cytochrome c family protein  30.85 
 
 		 478 aa  47.4  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.395423  normal  0.353435 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0807  cytochrome c-type protein  28.7 
 
 		 378 aa  46.6  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05451  cytochrome c protein, subunit of nitrate reductase  29.25 
 
 		 361 aa  45.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1539  cytochrome c-type protein YecK  26.47 
 
 		 368 aa  45.1  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3259  cytochrome c family protein  31.87 
 
 		 507 aa  44.3  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00302296  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1582  NapC/NirT cytochrome c, N-terminal  23.81 
 
 		 195 aa  43.9  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.220778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0299  trimethylamine N-oxide reductase, cytochrome c-type subunit  25.81 
 
 		 188 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.649247  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1875  NapC/NirT cytochrome c-like  27.19 
 
 		 391 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2584  cytochrome c family protein  26.92 
 
 		 496 aa  43.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2712  cytochrome c family protein  30.93 
 
 		 501 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.627653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3232  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  29.76 
 
 		 386 aa  42.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000448194 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1947  nitrate/TMAO reductase  19.88 
 
 		 192 aa  42.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.674395  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1767  NapC/NirT cytochrome c domain protein  26.67 
 
 		 366 aa  42  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.936098  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1313  trimethylamine N-oxide reductase III, c-type cytochrome subunit TorY  26.67 
 
 		 366 aa  42  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.563249 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4219  denitrification system component NirT/cytochrome c552  26.79 
 
 		 603 aa  42  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.50309  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2384  NapC/NirT cytochrome c domain protein  27.68 
 
 		 185 aa  41.6  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2105  trimethylamine N-oxide reductase III, c-type cytochrome subunit TorY  26.67 
 
 		 366 aa  41.6  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2166  trimethylamine N-oxide reductase III, c-type cytochrome subunit TorY  26.67 
 
 		 366 aa  41.2  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1968  trimethylamine N-oxide reductase III, c-type cytochrome subunit TorY  26.67 
 
 		 366 aa  41.2  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4219  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  29.09 
 
 		 359 aa  41.2  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0284374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1759  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  26.67 
 
 		 366 aa  41.2  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1672  cytochrome c-type protein  22.76 
 
 		 389 aa  40.8  0.006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2609  trimethylamine N-oxide reductase III, c-type cytochrome subunit TorY  28.57 
 
 		 366 aa  40.8  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.637408  hitchhiker  0.00703853 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1831  NapC/NirT cytochrome c family, N- region  24.09 
 
 		 234 aa  40.4  0.009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2086  NapC/NirT cytochrome c domain protein  25.38 
 
 		 210 aa  40.4  0.009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>