68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3707 on replicon NC_008607
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008607  Ppro_3707  cytochrome c nitrite reductase, small subunit NrfH, putative  100 
 
 		 152 aa  317  5e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.741906  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0664  hypothetical protein  70.39 
 
 		 154 aa  237  4e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0192323  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3155  cytochrome c nitrite reductase, small subunit NrfH, putative  75.37 
 
 		 134 aa  223  8e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1043  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  71.32 
 
 		 161 aa  204  3e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00711927  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2399  cytochrome c nitrite reductase, small subunit NrfH, putative  63.91 
 
 		 153 aa  187  4e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.524559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0295  respiratory nitrite reductase specific menaquinol--cytochrome-c reductase (NrfH) precursor  55.1 
 
 		 153 aa  184  3e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000597678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1199  cytochrome c nitrite reductase, small subunit NrfH, putative  65.55 
 
 		 154 aa  172  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1893  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  38.94 
 
 		 174 aa  101  5e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0693886  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0706  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  33.55 
 
 		 177 aa  98.6  3e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000199981  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1100  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  32.91 
 
 		 205 aa  97.1  8e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4235  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  31.69 
 
 		 161 aa  85.1  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1821  cytochrome c nitrite reductase, small subunit NrfH  27.52 
 
 		 203 aa  81.6  0.000000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0700  cytochrome c nitrite reductase small subunit NrfH  28.57 
 
 		 153 aa  72.8  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2386  cytochrome c nitrite reductase small subunit  30.63 
 
 		 158 aa  72.8  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2903  respiratory nitrite reductase specific menaquinol--cytochrome-c reductase (NrfH) precursor  34.38 
 
 		 151 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2988  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  35.16 
 
 		 151 aa  72.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1491  cytochrome c nitrite reductase small subunit  34.03 
 
 		 159 aa  71.6  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3093  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  33.59 
 
 		 151 aa  70.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2867  cytochrome c nitrite reductase  33.61 
 
 		 177 aa  69.3  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0082  NapC/NirT cytochrome c family protein  30.28 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.2818  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1547  cytochrome c-type protein nrfH  27.74 
 
 		 171 aa  68.2  0.00000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1360  cytochrome c-type protein nrfH  27.74 
 
 		 171 aa  68.2  0.00000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0340  cytochrome c-type protein nrfH  27.1 
 
 		 171 aa  67  0.00000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.349319  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2096  NapC/NirT cytochrome c family protein  30.28 
 
 		 158 aa  66.6  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.999464  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2334  NapC/NirT cytochrome c family protein  33.09 
 
 		 159 aa  65.5  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000913356 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3630  cytochrome c nitrite reductase, small subunit NrfH  30.2 
 
 		 166 aa  64.3  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000885954  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1522  cytochrome c nitrite reductase small subunit NrfH  29.75 
 
 		 125 aa  63.9  0.0000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0956  cytochrome c-type protein  28.36 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.394996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4607  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  26.75 
 
 		 158 aa  63.2  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0961  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  28.8 
 
 		 151 aa  61.2  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.176798  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0964  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  28.8 
 
 		 151 aa  61.2  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0911  respiratory nitrite reductase specific menaquinol--cytochrome-c reductase (NrfH) precursor  28.8 
 
 		 151 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.890022  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1243  cytochrome c-type protein NrfH  25.49 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0799  putative tetraheme cytochrome c  27.78 
 
 		 183 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  unclonable  0.000000000000122582  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1023  cytochrome c nitrite reductase, small subunit NrfH  25.49 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.127457  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1979  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  36.05 
 
 		 172 aa  57  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.257844 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2199  cytochrome c family protein  28.7 
 
 		 468 aa  53.9  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0994812  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2287  cytochrome c family protein  28.7 
 
 		 468 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1063  hypothetical protein  34.09 
 
 		 507 aa  52.4  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.27837e-22 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1659  cytochrome c family protein  27.83 
 
 		 468 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228643  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0807  cytochrome c-type protein  26.22 
 
 		 378 aa  52.4  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3199  hypothetical protein  34.09 
 
 		 507 aa  52  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00139796  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0130  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  27.27 
 
 		 180 aa  51.6  0.000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1635  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  24.68 
 
 		 180 aa  50.4  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000671983  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0861  hypothetical protein  31.82 
 
 		 507 aa  50.4  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000162424  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3174  cytochrome c family protein  28.45 
 
 		 504 aa  50.1  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.000000000000139741  normal  0.372287 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1947  nitrate/TMAO reductase  25.29 
 
 		 192 aa  49.3  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.674395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0299  trimethylamine N-oxide reductase, cytochrome c-type subunit  23.21 
 
 		 188 aa  49.7  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.649247  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1446  NapC/NirT cytochrome c domain protein  28.77 
 
 		 206 aa  47.4  0.00007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.148629  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3259  cytochrome c family protein  29.66 
 
 		 507 aa  46.6  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00302296  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2384  NapC/NirT cytochrome c domain protein  26.43 
 
 		 185 aa  46.6  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1831  NapC/NirT cytochrome c family, N- region  26.49 
 
 		 234 aa  47  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2086  NapC/NirT cytochrome c domain protein  23.84 
 
 		 210 aa  45.4  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2609  trimethylamine N-oxide reductase III, c-type cytochrome subunit TorY  23.21 
 
 		 366 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.637408  hitchhiker  0.00703853 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1504  periplasmic nitrate reductase subunit NapC  22.73 
 
 		 203 aa  43.5  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1313  trimethylamine N-oxide reductase III, c-type cytochrome subunit TorY  24.14 
 
 		 366 aa  43.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.563249 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05451  cytochrome c protein, subunit of nitrate reductase  32 
 
 		 361 aa  43.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1767  NapC/NirT cytochrome c domain protein  24.14 
 
 		 366 aa  42.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.936098  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3232  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  27.83 
 
 		 386 aa  43.1  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000448194 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1539  cytochrome c-type protein YecK  28.44 
 
 		 368 aa  42.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4219  denitrification system component NirT/cytochrome c552  21.68 
 
 		 603 aa  43.1  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.50309  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2105  trimethylamine N-oxide reductase III, c-type cytochrome subunit TorY  24.14 
 
 		 366 aa  41.2  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2166  trimethylamine N-oxide reductase III, c-type cytochrome subunit TorY  24.14 
 
 		 366 aa  41.2  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1759  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  24.14 
 
 		 366 aa  40.8  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1968  trimethylamine N-oxide reductase III, c-type cytochrome subunit TorY  24.14 
 
 		 366 aa  40.8  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01833  hypothetical protein  24.14 
 
 		 366 aa  40.8  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01844  TMAO reductase III (TorYZ), cytochrome c-type subunit  24.14 
 
 		 366 aa  40.8  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4076  NapC/NirT cytochrome c-like  24.03 
 
 		 206 aa  40.4  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0547067  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>