72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1043 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1043  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  100 
 
 		 161 aa  338  2e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00711927  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3707  cytochrome c nitrite reductase, small subunit NrfH, putative  71.32 
 
 		 152 aa  204  4e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.741906  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0295  respiratory nitrite reductase specific menaquinol--cytochrome-c reductase (NrfH) precursor  59.6 
 
 		 153 aa  203  7e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000597678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2399  cytochrome c nitrite reductase, small subunit NrfH, putative  61.27 
 
 		 153 aa  202  2e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.524559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1199  cytochrome c nitrite reductase, small subunit NrfH, putative  66.67 
 
 		 154 aa  199  9.999999999999999e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0664  hypothetical protein  60.96 
 
 		 154 aa  197  7e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0192323  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3155  cytochrome c nitrite reductase, small subunit NrfH, putative  62.12 
 
 		 134 aa  186  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1893  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  41.59 
 
 		 174 aa  112  3e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0693886  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0706  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  33.73 
 
 		 177 aa  103  1e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000199981  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1100  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  33.76 
 
 		 205 aa  100  9e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1821  cytochrome c nitrite reductase, small subunit NrfH  28.22 
 
 		 203 aa  83.2  0.000000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0700  cytochrome c nitrite reductase small subunit NrfH  28.24 
 
 		 153 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2386  cytochrome c nitrite reductase small subunit  34.88 
 
 		 158 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1491  cytochrome c nitrite reductase small subunit  36.09 
 
 		 159 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4235  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  28.17 
 
 		 161 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2096  NapC/NirT cytochrome c family protein  32.56 
 
 		 158 aa  73.9  0.0000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.999464  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2988  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  33.81 
 
 		 151 aa  70.5  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2903  respiratory nitrite reductase specific menaquinol--cytochrome-c reductase (NrfH) precursor  33.09 
 
 		 151 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1522  cytochrome c nitrite reductase small subunit NrfH  32.28 
 
 		 125 aa  68.6  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0340  cytochrome c-type protein nrfH  31.79 
 
 		 171 aa  68.9  0.00000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.349319  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1360  cytochrome c-type protein nrfH  31.79 
 
 		 171 aa  68.2  0.00000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1547  cytochrome c-type protein nrfH  31.79 
 
 		 171 aa  68.2  0.00000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3093  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  32.37 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2867  cytochrome c nitrite reductase  32.59 
 
 		 177 aa  67.4  0.00000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1979  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  30.32 
 
 		 172 aa  64.3  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.257844 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3630  cytochrome c nitrite reductase, small subunit NrfH  29.86 
 
 		 166 aa  63.2  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000885954  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0082  NapC/NirT cytochrome c family protein  35.59 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.2818  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0799  putative tetraheme cytochrome c  26.35 
 
 		 183 aa  61.2  0.000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  unclonable  0.000000000000122582  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2334  NapC/NirT cytochrome c family protein  34.91 
 
 		 159 aa  60.5  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000913356 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4607  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  29.57 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0807  cytochrome c-type protein  25.14 
 
 		 378 aa  59.7  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1446  NapC/NirT cytochrome c domain protein  31.21 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.148629  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1243  cytochrome c-type protein NrfH  26.49 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0964  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  29.63 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0961  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  29.63 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.176798  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0911  respiratory nitrite reductase specific menaquinol--cytochrome-c reductase (NrfH) precursor  28.83 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.890022  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0956  cytochrome c-type protein  29.09 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.394996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2086  NapC/NirT cytochrome c domain protein  25.57 
 
 		 210 aa  54.3  0.0000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1023  cytochrome c nitrite reductase, small subunit NrfH  25.33 
 
 		 164 aa  53.5  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.127457  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1831  NapC/NirT cytochrome c family, N- region  24.82 
 
 		 234 aa  52.4  0.000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1635  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  24.84 
 
 		 180 aa  51.2  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000671983  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0130  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  26.21 
 
 		 180 aa  50.4  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2384  NapC/NirT cytochrome c domain protein  26.17 
 
 		 185 aa  48.1  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4219  denitrification system component NirT/cytochrome c552  22.38 
 
 		 603 aa  46.2  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.50309  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0138  putative tetraheme cytochrome c  23.23 
 
 		 190 aa  45.8  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0617458  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1063  hypothetical protein  27.97 
 
 		 507 aa  45.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.27837e-22 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0861  hypothetical protein  32.58 
 
 		 507 aa  45.1  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000162424  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3232  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  27.14 
 
 		 386 aa  45.1  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000448194 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1672  cytochrome c-type protein  23.67 
 
 		 389 aa  44.7  0.0005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05451  cytochrome c protein, subunit of nitrate reductase  25.66 
 
 		 361 aa  44.7  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3199  hypothetical protein  32.58 
 
 		 507 aa  44.7  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00139796  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1678  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  26.35 
 
 		 196 aa  44.7  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.184526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1539  cytochrome c-type protein YecK  28.78 
 
 		 368 aa  44.3  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1582  NapC/NirT cytochrome c, N-terminal  25.37 
 
 		 195 aa  43.9  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.220778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1504  periplasmic nitrate reductase subunit NapC  23.7 
 
 		 203 aa  44.3  0.0008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2609  trimethylamine N-oxide reductase III, c-type cytochrome subunit TorY  26.06 
 
 		 366 aa  43.9  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.637408  hitchhiker  0.00703853 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000872  cytochrome c-type protein TorY  25.45 
 
 		 364 aa  43.5  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1313  trimethylamine N-oxide reductase III, c-type cytochrome subunit TorY  25.17 
 
 		 366 aa  42.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.563249 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1767  NapC/NirT cytochrome c domain protein  25 
 
 		 366 aa  42.4  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.936098  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06847  cytochrome c protein, subunit of nitrate reductase  24.85 
 
 		 364 aa  42  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2199  cytochrome c family protein  28.35 
 
 		 468 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0994812  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2105  trimethylamine N-oxide reductase III, c-type cytochrome subunit TorY  24.48 
 
 		 366 aa  41.2  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3174  cytochrome c family protein  25.64 
 
 		 504 aa  41.2  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.000000000000139741  normal  0.372287 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01833  hypothetical protein  24.48 
 
 		 366 aa  40.8  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2166  trimethylamine N-oxide reductase III, c-type cytochrome subunit TorY  24.48 
 
 		 366 aa  41.2  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1759  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  24.48 
 
 		 366 aa  41.2  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3161  cytochrome c-type protein NapC  26.28 
 
 		 237 aa  40.8  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1968  trimethylamine N-oxide reductase III, c-type cytochrome subunit TorY  24.48 
 
 		 366 aa  41.2  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01844  TMAO reductase III (TorYZ), cytochrome c-type subunit  24.48 
 
 		 366 aa  40.8  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2287  cytochrome c family protein  30.23 
 
 		 468 aa  40.8  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1947  nitrate/TMAO reductase  24.11 
 
 		 192 aa  40.8  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.674395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1659  cytochrome c family protein  30.23 
 
 		 468 aa  40.8  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228643  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>