29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2354 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_2354  hypothetical protein  100 
 
 
121 aa  230  5e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.902414  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1610  VanZ family protein  72.07 
 
 
144 aa  118  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1515  VanZ family protein  72.97 
 
 
144 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.14415  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1519  VanZ family protein  56.73 
 
 
132 aa  89.4  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000017636  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3083  VanZ family protein  38.64 
 
 
159 aa  67  0.00000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11940  predicted integral membrane protein  48.24 
 
 
160 aa  65.5  0.0000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0005  VanZ family protein  39.56 
 
 
141 aa  63.5  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.391845  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0245  hypothetical protein  43.53 
 
 
110 aa  54.3  0.0000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3020  hypothetical protein  30.09 
 
 
140 aa  51.2  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3957  VanZ family protein  33.96 
 
 
138 aa  51.2  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1791  VanZ like protein  40.74 
 
 
124 aa  47.8  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23010  predicted integral membrane protein  34.09 
 
 
154 aa  47.4  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.265627  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0857  VanZ family protein  43.75 
 
 
116 aa  46.6  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.34815  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3166  VanZ family protein  34.04 
 
 
147 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3359  hypothetical protein  34.82 
 
 
203 aa  45.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2961  hypothetical protein  33.66 
 
 
153 aa  43.9  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000379885  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3336  VanZ family protein  35.37 
 
 
150 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2594  VanZ like protein  38.16 
 
 
195 aa  42.4  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4454  VanZ family protein  37.21 
 
 
155 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000015697  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5585  hypothetical protein  29.27 
 
 
161 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.252516 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1750  hypothetical protein  35.35 
 
 
126 aa  42.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0175059  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3988  VanZ family protein  29.23 
 
 
160 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0330326 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0679  VanZ family protein  53.85 
 
 
109 aa  41.6  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.48389  normal  0.15313 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5371  hypothetical protein  29.27 
 
 
161 aa  42  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0238  VanZ family protein  30.99 
 
 
157 aa  41.2  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1880  VanZ like protein  40 
 
 
136 aa  41.6  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.708248  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1801  VanZ family protein  33.02 
 
 
404 aa  41.2  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1351  acetobutylicum phosphotransbutyrylase  28.92 
 
 
159 aa  40.4  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454773  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2623  VanZ like protein  36.9 
 
 
136 aa  40.4  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>