69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_R0013 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_R0013  tRNA-Ala  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000619108  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0020  tRNA-Val  92.31 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000127781  normal  0.601367 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0054  tRNA-Ala  88.16 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0081  tRNA-Ala  88.89 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.659865  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0037  tRNA-Val  92.16 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00626142  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0046  tRNA-Val  97.44 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0006  tRNA-Ala  89.29 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0047  tRNA-Ala  88.14 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00129328  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0012  tRNA-Ala  88.14 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.453962  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0013  tRNA-Ala  88.14 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.298294  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Ala-1  tRNA-Ala  86.44 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0003  tRNA-Ala  86.44 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_62  tRNA-Ala  86.44 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0027  tRNA-Ala  88.14 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.392789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0026  tRNA-Ala  88.14 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.635837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0029  tRNA-Ala  91.3 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.180945  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0010  tRNA-Ala  89.13 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0022  tRNA-Ala  89.13 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.409471 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0049  tRNA-Ala  89.13 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0254858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0042  tRNA-Ala  91.3 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0063  tRNA-Ala  89.13 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0023  tRNA-Ala  89.13 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0933742 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0055  tRNA-Ala  91.11 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0229189  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2246  tRNA-Ala  90.24 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0012  tRNA-Ala  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0013  tRNA-Ala  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2332  tRNA-Ala  90.24 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0355369  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0079  tRNA-Ala  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.520494  normal  0.417103 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0080  tRNA-Ala  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.755627  normal  0.408373 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0020  tRNA-Ala  91.11 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000865622  hitchhiker  2.9719399999999996e-20 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tAla03  tRNA-Ala  90.24 
 
 		 79 bp  50.1  0.00007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0022  tRNA-Ala  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0994  tRNA-Ala  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0502689  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4330  tRNA-Ala  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0088  tRNA-Ala  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0089  tRNA-Ala  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0036  tRNA-Ala  91.11 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000174487 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Ala-4  tRNA-Ala  91.11 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00508313  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0016  tRNA-Ala  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0028  tRNA-Ala  91.11 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000126032  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1790  tRNA-Ala  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.215677  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0001  tRNA-Ala  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0043  tRNA-Ala  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0640693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1456  tRNA-Ala  90.24 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00170878  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0022  tRNA-Ala  90.91 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0553  replicative DNA helicase  96.43 
 
 		 1485 bp  48.1  0.0003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.78949  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0055  tRNA-Ala  90.91 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0053  tRNA-Ala  90.91 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0086  tRNA-Ala  90.91 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0087  tRNA-Ala  90.91 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.456673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0062  tRNA-Ala  90.91 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.374737  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0071  tRNA-Ala  90.91 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0552  tRNA-Pro  96.43 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.775788  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0038  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000295037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0045  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00121636  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0022  tRNA-Ala  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0028  tRNA-Ala  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0025  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.452504  normal  0.0973611 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0024  tRNA-Ala  88.37 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.746229  normal  0.0497689 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0013  tRNA-Val  93.55 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.237291 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0007  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0315655 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1169  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  44.1  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000109978  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0038  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  44.1  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0066  tRNA-Ala  90.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0285169  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0043  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.174816  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0043  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000221825  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0011  tRNA-Ala  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0062  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0906817  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Ser-4  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  44.1  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.110057  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>