25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_R0046 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_R0046  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0037  tRNA-Val  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00626142  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0020  tRNA-Val  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000127781  normal  0.601367 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0013  tRNA-Ala  97.44 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000619108  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0043  tRNA-Val  85.92 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.174816  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0043  tRNA-Val  85.92 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000221825  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0040  tRNA-Val  85.14 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000348872 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0038  tRNA-Val  85.14 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.290735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0025  tRNA-Val  84.72 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0239971 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0062  tRNA-Val  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0065  tRNA-Val  84.51 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0059636  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Val-1  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.0049359  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0045  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.218137  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0054  tRNA-Ala  91.3 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0021  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0144657  normal  0.36354 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0028  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.464795  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0042  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.288324  hitchhiker  0.00194275 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2615  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.71269  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1047  tRNA-Arg  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.249423  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1045  tRNA-Arg  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0036  tRNA-Val  83.33 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.552883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0041  tRNA-Val  83.1 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345856  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0027  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0757548  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0028  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.278514 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0008  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153849  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>