46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4610 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4610  putative mannose-1-phosphate guanyltransferase  100 
 
 
391 aa  800    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.157776  normal  0.623431 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1469  Nucleotidyl transferase  29.77 
 
 
833 aa  67  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2068  sugar transferase  27.14 
 
 
566 aa  61.2  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1463  nucleotidyl transferase  25 
 
 
828 aa  59.7  0.00000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0300765  normal  0.0105434 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5002  nucleotidyl transferase  26.67 
 
 
843 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1394  mannose-1-phosphate guanylyltransferase / phosphomannomutase  27.5 
 
 
832 aa  57  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1692  nucleotidyl transferase  26.98 
 
 
834 aa  56.6  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.230386  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1231  nucleotidyl transferase  27.05 
 
 
841 aa  56.2  0.0000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.946144 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2334  nucleotidyl transferase  25.83 
 
 
828 aa  55.1  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1123  nucleotidyl transferase  29.13 
 
 
854 aa  55.1  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1693  nucleotidyl transferase  29.79 
 
 
481 aa  54.7  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1787  nucleotidyl transferase  20.21 
 
 
348 aa  53.9  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2995  nucleotidyl transferase  26.72 
 
 
785 aa  53.1  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1427  Nucleotidyl transferase  27.97 
 
 
827 aa  53.1  0.000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2437  Nucleotidyl transferase  25.83 
 
 
827 aa  52.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00386454  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4001  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  27.5 
 
 
828 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.755788  normal  0.793292 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0724  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  23.44 
 
 
380 aa  50.4  0.00005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2952  nucleotidyl transferase  27.08 
 
 
505 aa  50.4  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0359  Nucleotidyl transferase  27.83 
 
 
347 aa  49.3  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1852  nucleotidyl transferase  28.35 
 
 
370 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4287  nucleotidyl transferase family protein  25.21 
 
 
784 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.268164 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1604  nucleotidyl transferase  23.47 
 
 
352 aa  47.8  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0798438  normal  0.128956 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4017  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  25.21 
 
 
784 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.688327  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4169  nucleotidyl transferase family protein  25.21 
 
 
784 aa  47.4  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4491  nucleotidyl transferase family protein  25.21 
 
 
784 aa  47.4  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4007  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  25.21 
 
 
784 aa  47.8  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1016  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  23.98 
 
 
458 aa  47.4  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000175531  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4347  nucleotidyl transferase family protein  25.42 
 
 
784 aa  46.6  0.0009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.114462  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4400  nucleotidyl transferase family protein  25.42 
 
 
784 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1239  Nucleotidyl transferase  40.58 
 
 
347 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4381  nucleotidyl transferase family protein  25.21 
 
 
784 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0853  nucleotidyl transferase family protein  25.21 
 
 
784 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3282  nucleotidyl transferase  25.95 
 
 
370 aa  46.2  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.404178 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1961  nucleotidyl transferase  29.79 
 
 
816 aa  46.2  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0348  Nucleotidyl transferase  27.78 
 
 
810 aa  46.2  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1501  Nucleotidyl transferase  26.23 
 
 
842 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0900904  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1436  nucleotidyl transferase  27.59 
 
 
833 aa  45.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.510504  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0740  nucleotidyl transferase  23.73 
 
 
832 aa  44.7  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.2195  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4120  nucleotidyl transferase  26.53 
 
 
784 aa  44.7  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1356  Nucleotidyl transferase  23.36 
 
 
360 aa  43.9  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1423  nucleotidyl transferase  20.75 
 
 
475 aa  43.5  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1837  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  25.96 
 
 
440 aa  43.9  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.727944  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1777  nucleotidyl transferase  31.53 
 
 
363 aa  43.5  0.007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.13003  normal  0.0200486 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3774  Nucleotidyl transferase  25.86 
 
 
830 aa  43.1  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2004  nucleotidyl transferase  24.47 
 
 
497 aa  43.1  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.130422 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1040  nucleotidyl transferase  24.58 
 
 
818 aa  43.1  0.008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.189081  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>