More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1310 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_1310  aspartate carbamoyltransferase  100 
 
 
353 aa  717    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1157  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  39.53 
 
 
315 aa  226  4e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.111076  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1066  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  36.27 
 
 
304 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1285  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  41.25 
 
 
313 aa  216  4e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0520  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  39.22 
 
 
305 aa  213  3.9999999999999995e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2154  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  38.64 
 
 
305 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1964  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  38.67 
 
 
298 aa  212  7e-54  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0028  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  36.61 
 
 
305 aa  211  1e-53  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0024  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  37.97 
 
 
304 aa  210  2e-53  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  decreased coverage  0.00458204 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2301  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  39.09 
 
 
304 aa  210  3e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.485741  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2536  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  38 
 
 
298 aa  207  2e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2668  aspartate carbamoyltransferase  37.22 
 
 
311 aa  206  4e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0792  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  37.75 
 
 
303 aa  206  6e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.311854  hitchhiker  0.000000216134 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1681  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  36.36 
 
 
306 aa  205  9e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.947755  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1689  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  38.54 
 
 
298 aa  205  1e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.417019  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3465  aspartate carbamoyltransferase  37.79 
 
 
308 aa  203  4e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0927  aspartate carbamoyltransferase  38.61 
 
 
411 aa  202  7e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1664  aspartate carbamoyltransferase  37.87 
 
 
317 aa  202  8e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0357  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  37.01 
 
 
304 aa  201  1.9999999999999998e-50  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.127039 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0534  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  37.82 
 
 
320 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.726764  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0780  aspartate carbamoyltransferase  34.75 
 
 
312 aa  199  5e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0447  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  36.39 
 
 
310 aa  199  9e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.015516 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1168  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  36.24 
 
 
308 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0959  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  35.67 
 
 
302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1121  aspartate carbamoyltransferase  37.25 
 
 
304 aa  197  3e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00702877  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0436  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  36.63 
 
 
311 aa  194  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0500  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  36.63 
 
 
311 aa  194  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.879834  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0618  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  35.6 
 
 
298 aa  193  3e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.934778  normal  0.417174 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1201  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  31.41 
 
 
307 aa  193  4e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0733416  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1256  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  36 
 
 
304 aa  193  4e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0545  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  36.88 
 
 
311 aa  192  6e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1387  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  31.41 
 
 
307 aa  192  6e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1158  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  36.3 
 
 
311 aa  191  1e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0420  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  36.16 
 
 
311 aa  192  1e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0367  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  36.16 
 
 
311 aa  190  2e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04113  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  36.39 
 
 
311 aa  189  5e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3749  aspartate carbamoyltransferase  36.39 
 
 
311 aa  189  5e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4726  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  36.39 
 
 
311 aa  189  5e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3766  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  36.39 
 
 
311 aa  189  5e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4501  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  36.39 
 
 
311 aa  189  5e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.495681  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04077  hypothetical protein  36.39 
 
 
311 aa  189  5e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4818  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  36.39 
 
 
311 aa  189  5e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5767  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  36.39 
 
 
311 aa  189  5e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4838  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  36.39 
 
 
311 aa  189  5e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3735  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  36.24 
 
 
311 aa  189  8e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3570  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  37.09 
 
 
311 aa  187  2e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1678  aspartate carbamoyltransferase  35 
 
 
303 aa  187  3e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.599622  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1750  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  34.11 
 
 
302 aa  186  5e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.667028  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4713  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  36.45 
 
 
311 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0465159  normal  0.503646 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4863  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  36.45 
 
 
311 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4744  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  36.45 
 
 
311 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4807  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  36.45 
 
 
311 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4842  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  35.86 
 
 
311 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_19816  aspartate carbamoyltransferase  38.49 
 
 
355 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.904682  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2750  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  33.66 
 
 
307 aa  182  6e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2603  aspartate carbamoyltransferase  33.56 
 
 
359 aa  182  6e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0258  aspartate carbamoyltransferase  33.55 
 
 
341 aa  181  1e-44  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0931  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  34.33 
 
 
302 aa  181  1e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.189832  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1014  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  34.67 
 
 
302 aa  181  2e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.13562  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1686  aspartate carbamoyltransferase  35 
 
 
309 aa  181  2e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.467419 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002419  aspartate carbamoyltransferase  36.39 
 
 
309 aa  181  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03647  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  35.78 
 
 
321 aa  179  4e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0065  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  33.87 
 
 
308 aa  180  4e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1339  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  31.17 
 
 
314 aa  180  4e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3294  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  33.89 
 
 
311 aa  179  4e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.773416  normal  0.168026 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00565  Protein pyrABCN [Includes Glutamine-dependent carbamoyl-phosphate(EC 6.3.5.5);Aspartate carbamoyltransferase(EC 2.1.3.2)] [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:O93937]  37.04 
 
 
2275 aa  176  8e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90563  multifunctional pyrimidine biosynthesis protein (PYR1)  34.31 
 
 
2211 aa  175  9.999999999999999e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0682407 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06000  aspartate carbamoyltransferase, putative  34.27 
 
 
2333 aa  171  2e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00636164  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2092  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  34.08 
 
 
330 aa  169  8e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2385  aspartate carbamoyltransferase  33.44 
 
 
337 aa  168  1e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000797149 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0519  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  34.43 
 
 
309 aa  167  2.9999999999999998e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0496  aspartate carbamoyltransferase  32.05 
 
 
334 aa  162  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1204  aspartate carbamoyltransferase  34.59 
 
 
431 aa  160  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4709  aspartate carbamoyltransferase  33.33 
 
 
431 aa  160  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.916091 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4187  aspartate carbamoyltransferase  33.33 
 
 
431 aa  160  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1821  aspartate carbamoyltransferase  37.92 
 
 
319 aa  159  5e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1687  aspartate carbamoyltransferase  34.28 
 
 
431 aa  159  7e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0197  aspartate carbamoyltransferase  34.28 
 
 
431 aa  159  8e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0823567  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1605  aspartate carbamoyltransferase  34.28 
 
 
431 aa  159  8e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5513  aspartate carbamoyltransferase  33.02 
 
 
431 aa  159  8e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4730  aspartate carbamoyltransferase  32.92 
 
 
430 aa  158  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.387531  normal  0.148121 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3798  aspartate carbamoyltransferase  33.33 
 
 
431 aa  158  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181343 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0897  aspartate carbamoyltransferase  33.65 
 
 
431 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3560  aspartate carbamoyltransferase  33.33 
 
 
431 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.79735  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5476  aspartate carbamoyltransferase  33.33 
 
 
431 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.147289 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4807  aspartate carbamoyltransferase  33.33 
 
 
431 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.496224  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1641  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  38.34 
 
 
321 aa  157  3e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.452041 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0063  aspartate carbamoyltransferase  33.12 
 
 
343 aa  156  5.0000000000000005e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.631606  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00485  aspartate carbamoyltransferase  31.13 
 
 
354 aa  155  8e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0184  aspartate/ornithine carbamoyltransferase carbamoyl-P binding domain protein  32.76 
 
 
362 aa  155  1e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0031  aspartate/ornithine carbamoyltransferase carbamoyl-P binding domain protein  34.19 
 
 
360 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.436716 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1301  aspartate carbamoyltransferase  32.25 
 
 
339 aa  151  1e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0778  aspartate/ornithine carbamoyltransferase  34.83 
 
 
360 aa  151  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.154324  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1172  aspartate carbamoyltransferase  34.16 
 
 
339 aa  152  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.868394  hitchhiker  0.00000909543 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2108  aspartate carbamoyltransferase  31.34 
 
 
430 aa  151  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0801752  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0975  aspartate carbamoyltransferase  33.21 
 
 
339 aa  150  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0879  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  35.31 
 
 
307 aa  151  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1305  aspartate carbamoyltransferase  38.38 
 
 
310 aa  150  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3070  aspartate carbamoyltransferase  32.25 
 
 
339 aa  151  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.177283  hitchhiker  0.000000231142 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0840  aspartate carbamoyltransferase  30.79 
 
 
339 aa  150  3e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.591266 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>