More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0144 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_0317  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  100 
 
 
291 aa  570  1e-161  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.25178  normal  0.0112148 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0144  tetrapyrrole methylase family protein  100 
 
 
291 aa  570  1e-161  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1676  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  48.13 
 
 
273 aa  240  2e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1750  hypothetical protein  48.13 
 
 
273 aa  239  2.9999999999999997e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4683  hypothetical protein  48.2 
 
 
293 aa  239  4e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0561705 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0591  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  47.78 
 
 
272 aa  238  1e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.4731  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0758  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  46.44 
 
 
287 aa  238  1e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.289168  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4418  tetrapyrrole methylase family protein  47.48 
 
 
289 aa  237  2e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00450007  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0357  hypothetical protein  48.2 
 
 
281 aa  235  8e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4112  hypothetical protein  47.25 
 
 
304 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.796343  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0912  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  49.08 
 
 
299 aa  232  6e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.538896  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13150  tetrapyrrole methylase family protein  47.99 
 
 
287 aa  231  7.000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0262  hypothetical protein  46.49 
 
 
281 aa  229  3e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4522  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  49.12 
 
 
291 aa  229  3e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1987  hypothetical protein  46.01 
 
 
285 aa  229  5e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.582939 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4398  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  49.12 
 
 
291 aa  229  6e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.258286 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3683  hypothetical protein  46.13 
 
 
281 aa  228  1e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3353  hypothetical protein  44.28 
 
 
281 aa  228  1e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4186  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  49.77 
 
 
280 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0301  methyltransferase  46.49 
 
 
281 aa  227  2e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3691  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  46.3 
 
 
280 aa  227  2e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4068  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  49.32 
 
 
280 aa  226  3e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3988  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  49.32 
 
 
280 aa  226  3e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1326  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  48.42 
 
 
294 aa  225  6e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0934  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  48.07 
 
 
291 aa  225  7e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3879  hypothetical protein  45.42 
 
 
281 aa  224  1e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.071503 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4994  hypothetical protein  47.92 
 
 
320 aa  223  4e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.430559  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4098  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  49.32 
 
 
280 aa  221  9e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2203  hypothetical protein  44.44 
 
 
282 aa  221  9e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.826131  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04378  hypothetical protein  44.7 
 
 
265 aa  221  9.999999999999999e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.445875  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4431  hypothetical protein  44.65 
 
 
282 aa  220  1.9999999999999999e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.462421  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3626  tetrapyrrole methylase family protein  43.66 
 
 
286 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57470  hypothetical protein  49.57 
 
 
282 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0274  hypothetical protein  44.69 
 
 
280 aa  219  3e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000430645  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0228  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  42.81 
 
 
280 aa  218  1e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.330626 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0253  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  42.34 
 
 
280 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.239733  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1693  hypothetical protein  41.61 
 
 
291 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2653  putative tetrapyrrole methyltransferase  42.61 
 
 
287 aa  216  2.9999999999999998e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004500  tetrapyrrole (Corrin-Porphyrin) methylase family protein  43.33 
 
 
287 aa  216  4e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.104686  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3618  hypothetical protein  43.88 
 
 
287 aa  215  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3450  hypothetical protein  43.88 
 
 
287 aa  215  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3558  hypothetical protein  43.88 
 
 
287 aa  215  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3497  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  47.27 
 
 
306 aa  215  9e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.232501 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3521  hypothetical protein  43.88 
 
 
287 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0114  hypothetical protein  42.81 
 
 
288 aa  214  9.999999999999999e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03013  predicted methyltransferase  44.01 
 
 
286 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0559  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  44.01 
 
 
286 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3441  tetrapyrrole methylase family protein  44.01 
 
 
287 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02964  hypothetical protein  44.01 
 
 
286 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4465  tetrapyrrole methylase family protein  44.01 
 
 
286 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3338  tetrapyrrole methylase family protein  44.01 
 
 
286 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.725254  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3628  tetrapyrrole methylase family protein  43.66 
 
 
286 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2199  hypothetical protein  47.41 
 
 
286 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0552  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  43.66 
 
 
286 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.202744  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2211  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  45.36 
 
 
293 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.165354 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1206  hypothetical protein  48.52 
 
 
337 aa  213  3.9999999999999995e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.320326  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3240  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  44.8 
 
 
283 aa  212  4.9999999999999996e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03354  putative methyltransferase  42.96 
 
 
292 aa  211  9e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00892  corrin/porphyrin methyltransferase  43.54 
 
 
287 aa  209  3e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0025  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  45.09 
 
 
317 aa  210  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.076683  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0390  hypothetical protein  43.38 
 
 
280 aa  209  4e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.83739  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0021  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  39.71 
 
 
289 aa  209  4e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0023  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  39.71 
 
 
289 aa  209  4e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0741  methyltransferase  41.39 
 
 
281 aa  209  6e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.403402  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3583  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  44.37 
 
 
288 aa  208  7e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.200814 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0405  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  45.16 
 
 
316 aa  207  1e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.477663 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1545  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  42.39 
 
 
284 aa  207  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.338638 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0022  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  45.26 
 
 
347 aa  207  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0674688 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3781  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  42.71 
 
 
295 aa  206  3e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.160804  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1276  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  44.36 
 
 
291 aa  206  4e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000199857 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3452  hypothetical protein  44.24 
 
 
287 aa  206  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2101  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  43.17 
 
 
307 aa  206  5e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0174  hypothetical protein  49.78 
 
 
242 aa  206  5e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.95251 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03300  conserved hypothetical protein TIGR00096  43.64 
 
 
278 aa  204  1e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0352  tetrapyrrole methylase family protein  44.36 
 
 
306 aa  204  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30400  conserved hypothetical protein TIGR00096  44.6 
 
 
277 aa  204  1e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.295543  normal  0.306388 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0476  putative tetrapyrrole methylase  42.91 
 
 
299 aa  204  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1119  putative tetrapyrrole methylase  42.91 
 
 
299 aa  204  1e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0353  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  41.85 
 
 
280 aa  204  1e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0540  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  42.91 
 
 
299 aa  204  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0242  hypothetical protein  48.66 
 
 
233 aa  203  3e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0186  hypothetical protein  41.67 
 
 
291 aa  203  3e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4250  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (corrin/porphyrin) methyltransferase  40.59 
 
 
280 aa  203  3e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.150216  hitchhiker  0.00000000249407 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0473  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  45.15 
 
 
316 aa  203  3e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2393  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  38.63 
 
 
293 aa  203  3e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.957737  normal  0.200288 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1043  tetrapyrrole methylase family protein  40.36 
 
 
301 aa  202  5e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.210407  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0496  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  41.09 
 
 
309 aa  202  5e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.792442  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2215  putative tetrapyrrole methylase family protein  42.18 
 
 
285 aa  202  6e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111708  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5133  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  48.23 
 
 
288 aa  202  6e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.120783  normal  0.310968 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2462  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  45.62 
 
 
287 aa  202  7e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3666  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  45.09 
 
 
323 aa  201  8e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.502809 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0174  hypothetical protein  45.22 
 
 
292 aa  201  9e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5229  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  42.39 
 
 
293 aa  201  9e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.291092  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0035  hypothetical protein  44.05 
 
 
287 aa  201  9.999999999999999e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0515864  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3623  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  42.36 
 
 
292 aa  201  9.999999999999999e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2939  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  43.01 
 
 
323 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0172  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  37.13 
 
 
285 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000123849  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0568  hypothetical protein  45.34 
 
 
285 aa  200  1.9999999999999998e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.104446  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0844  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  46.21 
 
 
307 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3544  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  45.09 
 
 
320 aa  199  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>