3198 genes were found for organism Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 32    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Nwi_0001  CDS  NC_007406  567  1994  +  1428  chromosomal replication initiation protein  YP_316621  normal  1  normal  0.216398  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria 
 
 
-
 
Nwi_0002  CDS  NC_007406  2211  3329  +  1119  DNA polymerase III subunit beta  YP_316622  normal  1  normal  0.205747  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria 
 
 
-
 
Nwi_0003  CDS  NC_007406  3391  4548  +  1158  recombination protein F  YP_316623  normal  1  normal  0.323939  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria 
 
 
-
 
Nwi_0004  CDS  NC_007406  4812  7253  +  2442  DNA gyrase subunit B  YP_316624  normal  1  normal  0.0791906  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria 
 
 
-
 
Nwi_0005  CDS  NC_007406  7303  7923  -  621  hypothetical protein  YP_316625  normal  0.535943  normal  0.105753  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria 
 
 
-
 
Nwi_0006  CDS  NC_007406  8214  8582  -  369  transposase, IS4  YP_316626  normal  0.345636  normal  0.178212  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria 
 
 
-
 
Nwi_0007  CDS  NC_007406  8597  8995  -  399  transposase  YP_316627  normal  0.272336  normal  0.178212  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria 
 
 
-
 
Nwi_0008  CDS  NC_007406  9288  9782  +  495  hypothetical protein  YP_316628  normal  0.664621  normal  0.18728  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria 
 
 
-
 
Nwi_0009  CDS  NC_007406  10086  10658  +  573  nitrogen-fixing NifU  YP_316629  normal  0.964123  normal  0.198527  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria 
 
 
-
 
Nwi_0010  CDS  NC_007406  10655  11857  -  1203  hypothetical protein  YP_316630  normal  1  normal  0.215513  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria 
 
 
-
 
Nwi_0011  CDS  NC_007406  12141  12839  +  699  peptidase M22, glycoprotease  YP_316631  normal  1  normal  0.202985  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria 
 
 
-
 
Nwi_0012  CDS  NC_007406  12836  13318  +  483  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  YP_316632  normal  1  normal  0.193132  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria 
 
 
-
 
Nwi_0013  CDS  NC_007406  13439  13909  +  471  ferric-uptake regulator  YP_316633  normal  1  normal  0.0292053  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria 
 
 
-
 
Nwi_0014  CDS  NC_007406  13929  15362  +  1434  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  YP_316634  normal  0.581004  normal  0.0355743  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria 
 
 
-
 
Nwi_0015  CDS  NC_007406  15367  16416  +  1050  PhoH-like protein  YP_316635  normal  0.945712  normal  0.0639944  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria 
 
 
-
 
Nwi_0016  CDS  NC_007406  16416  16988  +  573  hypothetical protein  YP_316636  normal  1  normal  0.0297149  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria 
 
 
-
 
Nwi_0017  CDS  NC_007406  16989  18116  +  1128  ctransporter-associated region  YP_316637  normal  1  normal  0.0674373  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria 
 
 
-
 
Nwi_0018  CDS  NC_007406  18113  19720  +  1608  apolipoprotein N-acyltransferase  YP_316638  normal  1  normal  0.06922  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria 
 
 
-
 
Nwi_0019  CDS  NC_007406  19954  20373  +  420  XRE family transcriptional regulator  YP_316639  normal  1  normal  0.0558597  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria 
 
 
-
 
Nwi_0020  CDS  NC_007406  20396  21169  +  774  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  YP_316640  normal  1  normal  0.0594779  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria 
 
 
-
 
Nwi_0021  CDS  NC_007406  21460  22242  +  783  hypothetical protein  YP_316641  normal  1  normal  0.0581916  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria 
 
 
-
 
Nwi_0022  CDS  NC_007406  22246  23862  +  1617  transcription elongation factor NusA  YP_316642  normal  1  normal  0.0361846  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria 
 
 
-
 
Nwi_0023  CDS  NC_007406  24107  24772  +  666  hypothetical protein  YP_316643  normal  0.488276  normal  0.0323771  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria 
 
 
-
 
Nwi_0024  CDS  NC_007406  24841  27456  +  2616  translation initiation factor IF-2  YP_316644  normal  1  normal  0.0480379  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria 
 
 
-
 
Nwi_0025  CDS  NC_007406  27584  28024  +  441  ribosome-binding factor A  YP_316645  normal  1  normal  0.129398  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria 
 
 
-
 
Nwi_0026  CDS  NC_007406  28031  29107  +  1077  tRNA pseudouridine synthase B  YP_316646  normal  1  normal  0.148493  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria 
 
 
-
 
Nwi_0027  CDS  NC_007406  29114  29383  +  270  30S ribosomal protein S15  YP_316647  normal  1  normal  0.134975  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria 
 
 
-
 
Nwi_0028  CDS  NC_007406  29730  31886  +  2157  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  YP_316648  normal  1  normal  0.171141  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria 
 
 
-
 
Nwi_0029  CDS  NC_007406  32072  32986  -  915  regulatory protein, LysR  YP_316649  normal  1  normal  0.242113  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria 
 
 
-
 
Nwi_0030  CDS  NC_007406  33243  35432  +  2190  haem catalase/peroxidase  YP_316650  normal  1  normal  0.187858  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria 
 
 
-
 
Nwi_0031  CDS  NC_007406  35623  36219  +  597  glutathione S-transferase  YP_316651  normal  1  normal  0.243263  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria 
 
 
-
 
Nwi_0032  CDS  NC_007406  36277  37110  -  834  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  YP_316652  normal  1  normal  0.236001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria 
 
 
-
 
Nwi_0033  CDS  NC_007406  37283  38506  -  1224  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  YP_316653  normal  1  normal  0.251617  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria 
 
 
-
 
Nwi_0034  CDS  NC_007406  38590  39114  -  525  3-hydroxydecanoyl-(acyl carrier protein) dehydratase  YP_316654  normal  1  normal  0.234021  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria 
 
 
-
 
Nwi_0035  CDS  NC_007406  39551  40057  +  507  ferric-uptake regulator  YP_316655  normal  1  normal  0.232993  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria 
 
 
-
 
Nwi_0036  CDS  NC_007406  40312  40842  -  531  hypothetical protein  YP_316656  normal  1  normal  0.239823  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria 
 
 
-
 
Nwi_0037  CDS  NC_007406  41197  42198  +  1002  2-hydroxyacid dehydrogenase  YP_316657  normal  1  normal  0.256698  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria 
 
 
-
 
Nwi_0038  CDS  NC_007406  42286  43122  -  837  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  YP_316658  normal  0.969035  normal  0.260889  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria 
 
 
-
 
Nwi_0039  CDS  NC_007406  43206  44549  +  1344  hypothetical protein  YP_316659  normal  0.304092  normal  0.27217  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria 
 
 
-
 
Nwi_0040  CDS  NC_007406  44680  45561  -  882  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  YP_316660  normal  0.733521  normal  0.608589  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria 
 
 
-
 
Nwi_0041  CDS  NC_007406  45682  46479  +  798  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  YP_316661  normal  1  normal  0.921804  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria 
 
 
-
 
Nwi_0042  CDS  NC_007406  46476  48056  +  1581  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  YP_316662  normal  1  normal  1  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria 
 
 
-
 
Nwi_0043  CDS  NC_007406  48119  49558  +  1440  bifunctional SbtC-like/phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate synthase  YP_316663  normal  1  normal  0.658054  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria 
 
 
-
 
Nwi_0044  CDS  NC_007406  49555  50013  +  459  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase  YP_316664  normal  1  normal  0.239823  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria 
 
 
-
 
Nwi_0045  CDS  NC_007406  50291  52807  +  2517  histidine kinase  YP_316665  normal  1  normal  0.327934  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria 
 
 
-
 
Nwi_0046  CDS  NC_007406  52804  54327  +  1524  hypothetical protein  YP_316666  normal  0.810658  normal  0.280558  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria 
 
 
-
 
Nwi_0047  CDS  NC_007406  54432  54752  +  321  hypothetical protein  YP_316667  normal  0.090381  normal  0.242113  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria 
 
 
-
 
Nwi_0048  CDS  NC_007406  55254  55979  +  726  nucleotidyl transferase  YP_316668  normal  0.413317  normal  0.396027  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria 
 
 
-
 
Nwi_0049  CDS  NC_007406  56100  59261  +  3162  hypothetical protein  YP_316669  normal  0.258638  normal  0.374652  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria 
 
 
-
 
Nwi_0050  CDS  NC_007406  59255  62863  +  3609  UvrD/REP helicase  YP_316670  normal  1  normal  0.253682  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria 
 
 
-
 
Nwi_0051  CDS  NC_007406  62959  63279  +  321  thioredoxin  YP_316671  normal  1  normal  0.155345  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria 
 
 
-
 
Nwi_0052  CDS  NC_007406  63475  64803  -  1329  folylpolyglutamate synthetase  YP_316672  normal  1  normal  0.170324  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria 
 
 
-
 
Nwi_0053  CDS  NC_007406  64800  65759  -  960  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  YP_316673  normal  1  normal  0.149167  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria 
 
 
-
 
Nwi_0054  CDS  NC_007406  66066  66902  -  837  tryptophan synthase subunit alpha  YP_316674  normal  1  normal  0.130781  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria 
 
 
-
 
Nwi_0055  CDS  NC_007406  66899  68143  -  1245  tryptophan synthase subunit beta  YP_316675  normal  0.660106  normal  0.224738  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria 
 
 
-
 
Nwi_0056  CDS  NC_007406  68285  68962  -  678  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  YP_316676  normal  0.185509  normal  0.202985  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria 
 
 
-
 
Nwi_0057  CDS  NC_007406  69176  69523  -  348  hypothetical protein  YP_316677  normal  0.0688215  normal  0.189788  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria 
 
 
-
 
Nwi_0058  CDS  NC_007406  69770  70075  -  306  integration host factor subunit beta  YP_316678  normal  0.0950435  normal  0.185512  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria 
 
 
-
 
Nwi_0059  CDS  NC_007406  70241  71224  -  984  peptidase S49, SppA  YP_316679  normal  0.0430254  normal  0.117031  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria 
 
 
-
 
Nwi_0060  CDS  NC_007406  71498  72238  -  741  CysZ-like protein  YP_316680  normal  0.29129  normal  0.117031  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria 
 
 
-
 
Nwi_0061  CDS  NC_007406  72425  72910  -  486  hypothetical protein  YP_316681  normal  0.861882  normal  0.105753  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria 
 
 
-
 
Nwi_0062  CDS  NC_007406  73016  74020  -  1005  hypothetical protein  YP_316682  normal  0.854831  normal  0.19763  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria 
 
 
-
 
Nwi_0063  CDS  NC_007406  74260  75702  +  1443  amine oxidase  YP_316683  normal  1  normal  0.203976  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria 
 
 
-
 
Nwi_0064  CDS  NC_007406  75699  76367  +  669  hypothetical protein  YP_316684  normal  0.677678  normal  0.181447  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria 
 
 
-
 
Nwi_0065  CDS  NC_007406  76495  78933  -  2439  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  YP_316685  normal  1  normal  0.145265  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria 
 
 
-
 
Nwi_0066  CDS  NC_007406  78930  80039  -  1110  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit alpha  YP_316686  normal  0.179145  normal  0.118217  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria 
 
 
-
 
Nwi_0067  CDS  NC_007406  80156  80515  -  360  50S ribosomal protein L20  YP_316687  normal  0.693382  normal  0.10017  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria 
 
 
-
 
Nwi_0068  CDS  NC_007406  80581  80781  -  201  50S ribosomal protein L35  YP_316688  normal  0.5109  normal  0.097761  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria 
 
 
-
 
Nwi_0069  CDS  NC_007406  81110  81625  -  516  translation initiation factor IF-3  YP_316689  normal  1  normal  0.097761  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria 
 
 
-
 
Nwi_0070  CDS  NC_007406  81853  82626  +  774  hypothetical protein  YP_316690  normal  1  normal  0.105753  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria 
 
 
-
 
Nwi_0071  CDS  NC_007406  82679  85012  -  2334  hypothetical protein  YP_316691  normal  0.303295  normal  0.035165  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria 
 
 
-
 
Nwi_0072  CDS  NC_007406  85217  86920  -  1704  PAS sensor protein  YP_316692  normal  0.587955  normal  0.109403  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria 
 
 
-
 
Nwi_0073  CDS  NC_007406  87836  88846  +  1011  thioredoxin-related  YP_316693  normal  1  normal  0.0246134  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria 
 
 
-
 
Nwi_0074  CDS  NC_007406  88990  89664  +  675  peptidase S16  YP_316694  normal  1  normal  0.0481573  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria 
 
 
-
 
Nwi_0075  CDS  NC_007406  89704  89904  +  201  hypothetical protein  YP_316695  normal  1  normal  0.0456158  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria 
 
 
-
 
Nwi_0076  CDS  NC_007406  89965  90303  -  339  nitrogen regulatory protein P-II  YP_316696  normal  1  normal  0.0461291  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria 
 
 
-
 
Nwi_0077  CDS  NC_007406  90530  91414  +  885  hypothetical protein  YP_316697  normal  1  normal  0.0521251  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria 
 
 
-
 
Nwi_0078  CDS  NC_007406  91510  92412  -  903  acyl-CoA thioesterase  YP_316698  normal  1  normal  0.0521251  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria 
 
 
-
 
Nwi_0079  CDS  NC_007406  92582  93802  +  1221  2-octaprenyl-6-methoxyphenyl hydroxylase  YP_316699  normal  1  normal  0.0535408  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria 
 
 
-
 
Nwi_0080  CDS  NC_007406  94175  94603  -  429  hypothetical protein  YP_316700  normal  1  normal  0.0466173  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria 
 
 
-
 
Nwi_0081  CDS  NC_007406  96113  97084  -  972  ISSpo8, transposase  YP_316701  normal  0.462993  normal  0.0895527  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria 
 
 
-
 
Nwi_0082  CDS  NC_007406  97354  98625  +  1272  aminotransferase, class I and II  YP_316702  normal  1  normal  0.0909898  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria 
 
 
-
 
Nwi_0083  CDS  NC_007406  98638  101139  +  2502  cell division protein FtsK/SpoIIIE  YP_316703  normal  1  normal  0.104146  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria 
 
 
-
 
Nwi_0084  CDS  NC_007406  101475  102251  +  777  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  YP_316704  normal  1  normal  0.0818275  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria 
 
 
-
 
Nwi_0085  CDS  NC_007406  102283  103170  +  888  exodeoxyribonuclease III xth  YP_316705  normal  0.780104  normal  0.0810533  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria 
 
 
-
 
Nwi_0086  CDS  NC_007406  103274  103756  -  483  cyclic nucleotide-binding protein  YP_316706  normal  0.929528  normal  0.0740226  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria 
 
 
-
 
Nwi_0087  CDS  NC_007406  103980  104666  -  687  transcriptional regulatory protein  YP_316707  normal  0.701272  normal  0.0818275  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria 
 
 
-
 
Nwi_0088  CDS  NC_007406  104886  105455  +  570  hypothetical protein  YP_316708  normal  0.600446  normal  0.0826635  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria 
 
 
-
 
Nwi_0089  CDS  NC_007406  105622  106296  -  675  hypothetical protein  YP_316709  normal  0.937473  normal  0.0909898  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria 
 
 
-
 
Nwi_0090  CDS  NC_007406  106293  106997  -  705  glutathione S-transferase  YP_316710  normal  0.162685  normal  0.0936415  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria 
 
 
-
 
Nwi_0091  CDS  NC_007406  107151  109802  +  2652  leucyl-tRNA synthetase  YP_316711  normal  1  normal  0.124322  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria 
 
 
-
 
Nwi_0092  CDS  NC_007406  109789  110373  +  585  hypothetical protein  YP_316712  normal  1  normal  0.101272  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria 
 
 
-
 
Nwi_0093  CDS  NC_007406  110384  111412  +  1029  DNA polymerase III subunit delta  YP_316713  normal  1  normal  0.194892  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria 
 
 
-
 
Nwi_0094  CDS  NC_007406  111481  112362  -  882  ParB-like partition protein  YP_316714  normal  1  normal  0.0639944  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria 
 
 
-
 
Nwi_0095  CDS  NC_007406  112660  113529  -  870  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  YP_316715  normal  1  normal  0.0663654  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria 
 
 
-
 
Nwi_0096  CDS  NC_007406  113514  114347  -  834  16S rRNA methyltransferase GidB  YP_316716  normal  1  normal  0.118813  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria 
 
 
-
 
Nwi_0097  CDS  NC_007406  114370  116241  -  1872  tRNA uridine 5-carboxymethylaminomethyl modification enzyme GidA  YP_316717  normal  1  normal  0.0795977  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria 
 
 
-
 
Nwi_0098  CDS  NC_007406  116402  117772  -  1371  tRNA modification GTPase TrmE  YP_316718  normal  1  normal  0.0727899  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria 
 
 
-
 
Nwi_0099  CDS  NC_007406  118015  120045  +  2031  hypothetical protein  YP_316719  normal  1  normal  0.0429958  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria 
 
 
-
 
Nwi_0100  CDS  NC_007406  120114  121379  -  1266  transcription termination factor Rho  YP_316720  normal  0.581004  normal  0.035165  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 32    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>