29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0010 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_0010  hypothetical protein  100 
 
 
400 aa  799    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.215513 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0017  hypothetical protein  69.4 
 
 
376 aa  511  1e-143  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0357647  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2219  hypothetical protein  41.52 
 
 
389 aa  242  7.999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.576507  normal  0.180299 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2316  hypothetical protein  51.84 
 
 
355 aa  228  2e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00383771 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2450  hypothetical protein  41.5 
 
 
398 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3244  hypothetical protein  53.74 
 
 
398 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3188  hypothetical protein  66.27 
 
 
409 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.424525  normal  0.946732 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3254  hypothetical protein  49.8 
 
 
353 aa  210  3e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0583946 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4439  hypothetical protein  52.68 
 
 
365 aa  206  4e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.729607  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0421  hypothetical protein  48.44 
 
 
377 aa  203  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.775232  normal  0.849447 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1193  hypothetical protein  46.64 
 
 
343 aa  202  7e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.116788 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1353  hypothetical protein  47.04 
 
 
347 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.986887  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5294  hypothetical protein  58.58 
 
 
404 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.479144  normal  0.193675 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1132  hypothetical protein  48.88 
 
 
352 aa  192  8e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.201037  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2080  hypothetical protein  58.58 
 
 
417 aa  192  8e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0327018 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0430  hypothetical protein  54.79 
 
 
426 aa  190  4e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.512543  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0347  hypothetical protein  41.49 
 
 
373 aa  190  4e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.917981  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1541  hypothetical protein  53.04 
 
 
446 aa  189  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1735  hypothetical protein  56.88 
 
 
446 aa  187  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.135244 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1649  hypothetical protein  47.53 
 
 
447 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.633116  normal  0.21923 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1142  hypothetical protein  44.86 
 
 
401 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1363  hypothetical protein  45.15 
 
 
396 aa  176  5e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178999  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1203  hypothetical protein  45.15 
 
 
396 aa  176  7e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.403327  normal  0.0837257 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1297  hypothetical protein  46.08 
 
 
424 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.841303  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1003  hypothetical protein  45.1 
 
 
433 aa  172  1e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.123613  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3572  hypothetical protein  59.84 
 
 
396 aa  171  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.159319  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0945  hypothetical protein  45.1 
 
 
433 aa  171  2e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4302  hypothetical protein  46.6 
 
 
347 aa  169  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.301475  hitchhiker  0.0071391 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0791  hypothetical protein  41.59 
 
 
461 aa  147  4.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>