26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0057 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_0057  hypothetical protein  100 
 
 
115 aa  229  7.000000000000001e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0688215  normal  0.189788 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0065  hypothetical protein  81.74 
 
 
115 aa  193  5.000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0394  hypothetical protein  54.46 
 
 
130 aa  134  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.906344  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0195  hypothetical protein  61.86 
 
 
137 aa  107  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119963  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0637  hypothetical protein  60.82 
 
 
138 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0609514 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0070  hypothetical protein  54.64 
 
 
128 aa  98.2  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0131159  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0099  hypothetical protein  54.37 
 
 
130 aa  82  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0022  hypothetical protein  37 
 
 
114 aa  77.8  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00013194 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2927  hypothetical protein  47.06 
 
 
98 aa  74.3  0.0000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.142227  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0042  hypothetical protein  40 
 
 
110 aa  74.3  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.260618 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0058  hypothetical protein  39 
 
 
110 aa  73.9  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.772862  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0152  hypothetical protein  37.38 
 
 
107 aa  72.4  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0147  hypothetical protein  37.38 
 
 
107 aa  71.6  0.000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.264223  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2443  hypothetical protein  34.29 
 
 
122 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0411  hypothetical protein  33.63 
 
 
116 aa  65.5  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0178  hypothetical protein  36.08 
 
 
122 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0120  hypothetical protein  36.08 
 
 
122 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.598162  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0164  hypothetical protein  31.78 
 
 
107 aa  63.5  0.0000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2199  hypothetical protein  38.46 
 
 
112 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.983186  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2218  hypothetical protein  42.25 
 
 
106 aa  61.6  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102772  normal  0.371224 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0203  hypothetical protein  35.05 
 
 
122 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.164325  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0146  hypothetical protein  32.1 
 
 
95 aa  50.8  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2502  hypothetical protein  33 
 
 
112 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.246451  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3788  hypothetical protein  30.85 
 
 
133 aa  48.5  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.149286  hitchhiker  0.00561497 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3673  hypothetical protein  34.33 
 
 
107 aa  48.5  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0145  hypothetical protein  37.5 
 
 
108 aa  48.1  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>