More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl1992 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006369  lpl1992  hypothetical protein  100 
 
 
262 aa  540  9.999999999999999e-153  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1997  hypothetical protein  93.89 
 
 
262 aa  489  1e-137  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5047  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.71 
 
 
272 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.518044  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0340  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.33 
 
 
275 aa  187  2e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0946  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.98 
 
 
276 aa  185  6e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0476  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.97 
 
 
272 aa  183  3e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2215  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.1 
 
 
274 aa  182  7e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000657284  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2189  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.1 
 
 
274 aa  181  1e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.334092  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2920  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.29 
 
 
275 aa  181  2e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.495585  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5320  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.66 
 
 
272 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3055  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.77 
 
 
274 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.145614  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4151  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.81 
 
 
273 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05150  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.66 
 
 
273 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59347  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0546  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.88 
 
 
275 aa  177  1e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0390  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.18 
 
 
272 aa  177  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0581  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.38 
 
 
271 aa  176  3e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.948649  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2947  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.55 
 
 
272 aa  176  4e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.810347  hitchhiker  0.0042807 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1837  pyrroline-5-carboxylate reductase  40 
 
 
285 aa  175  8e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000989753  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0493  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.66 
 
 
273 aa  174  9e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5145  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.92 
 
 
272 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3982  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.97 
 
 
271 aa  172  5e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.401857 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4968  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.17 
 
 
272 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1839  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.24 
 
 
282 aa  171  1e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5095  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.17 
 
 
272 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0262  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.08 
 
 
275 aa  171  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.777137  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0535  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.6 
 
 
277 aa  171  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0439  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.08 
 
 
275 aa  171  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000148938 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0716  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.93 
 
 
271 aa  170  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.796831  normal  0.766779 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3354  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.36 
 
 
272 aa  169  4e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0337  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.75 
 
 
282 aa  169  5e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000202087  hitchhiker  0.00000000614659 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1154  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.3 
 
 
272 aa  168  7e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1406  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.09 
 
 
266 aa  168  8e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.257606 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2518  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.08 
 
 
271 aa  168  9e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.554672  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2861  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.36 
 
 
272 aa  168  9e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0351901  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0929  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.12 
 
 
273 aa  167  1e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117445  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2683  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.36 
 
 
272 aa  167  1e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000101037  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1331  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.11 
 
 
272 aa  167  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00987807 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3885  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.69 
 
 
270 aa  167  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0846425  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3642  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.18 
 
 
285 aa  167  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3093  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.82 
 
 
273 aa  166  4e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0431736  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2508  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.59 
 
 
274 aa  165  5e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3002  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  36.47 
 
 
278 aa  165  5.9999999999999996e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0370  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.43 
 
 
272 aa  165  8e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0601  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.52 
 
 
280 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0177  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.31 
 
 
277 aa  164  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0311023  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2500  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.79 
 
 
267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000695337  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3106  pyrroline-5-carboxylate reductase  40 
 
 
278 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0165  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.23 
 
 
277 aa  163  3e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000543414  hitchhiker  0.0000203969 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1136  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.22 
 
 
272 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0273851  normal  0.368215 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1287  pyrroline-5-carboxylate reductase  37 
 
 
270 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1193  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.12 
 
 
272 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0154607  normal  0.507121 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2249  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.12 
 
 
274 aa  162  7e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2514  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.09 
 
 
301 aa  162  7e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.332545 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3816  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.93 
 
 
270 aa  161  9e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.495016  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3564  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.71 
 
 
271 aa  161  9e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000486618  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0012  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.36 
 
 
272 aa  160  1e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3969  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.21 
 
 
279 aa  160  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2656  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.43 
 
 
270 aa  161  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0469003 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1192  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.74 
 
 
272 aa  160  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000775485  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1263  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.74 
 
 
272 aa  161  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00228679  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0620  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.6 
 
 
270 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2833  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.33 
 
 
278 aa  160  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0646  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.6 
 
 
270 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2920  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.08 
 
 
289 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.935383  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2109  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.24 
 
 
269 aa  158  8e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.663148  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2357  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.5 
 
 
266 aa  157  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0212  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.98 
 
 
276 aa  157  1e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1231  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.71 
 
 
272 aa  157  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000109487  normal  0.438718 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0151  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.63 
 
 
269 aa  158  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.779735  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0761  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.88 
 
 
292 aa  157  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1535  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.6 
 
 
274 aa  157  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1743  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.17 
 
 
273 aa  157  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.126409 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0990  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.46 
 
 
279 aa  157  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0129  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.69 
 
 
280 aa  157  2e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000153189  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2273  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.71 
 
 
285 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.642771  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4246  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.83 
 
 
279 aa  157  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2597  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.06 
 
 
270 aa  156  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.483806  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2410  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.06 
 
 
270 aa  156  3e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3300  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.06 
 
 
270 aa  156  3e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.249402  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3347  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.06 
 
 
270 aa  156  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3334  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.06 
 
 
270 aa  156  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0327  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.06 
 
 
270 aa  156  3e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3679  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.12 
 
 
271 aa  156  3e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1188  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.06 
 
 
270 aa  156  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3018  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.17 
 
 
275 aa  156  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0150  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  36.74 
 
 
266 aa  156  4e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000260384  normal  0.627515 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2755  pyrroline-5-carboxylate reductase  40 
 
 
275 aa  156  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1387  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.06 
 
 
276 aa  155  4e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0197  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.06 
 
 
271 aa  156  4e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1126  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.09 
 
 
272 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000450771  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3168  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.12 
 
 
273 aa  155  5.0000000000000005e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.624032  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3656  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.12 
 
 
270 aa  155  6e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.443187  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0698  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.98 
 
 
270 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.362648  normal  0.291858 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2325  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.6 
 
 
282 aa  154  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.664447 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0246  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.98 
 
 
270 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1285  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.88 
 
 
271 aa  154  1e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0730  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.98 
 
 
270 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.370104  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03070  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.8 
 
 
272 aa  154  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0995956  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5062  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.02 
 
 
285 aa  153  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25166  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1785  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.48 
 
 
289 aa  153  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>