62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_2263 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_2365  hypothetical protein  99.47 
 
 		 376 aa  767    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0102412  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2041  hypothetical protein  99.2 
 
 		 376 aa  763    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.117906 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2263  hypothetical protein  100 
 
 		 376 aa  770    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2783  hypothetical protein  81.12 
 
 		 373 aa  614  1e-175  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2928  hypothetical protein  81.22 
 
 		 378 aa  608  1e-173  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000108571  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3144  hypothetical protein  77.93 
 
 		 374 aa  603  1.0000000000000001e-171  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2105  hypothetical protein  75.47 
 
 		 375 aa  579  1e-164  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.258925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1546  hypothetical protein  75.47 
 
 		 375 aa  580  1e-164  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.391559  normal  0.123429 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2625  conserved hypothetical protein  74.66 
 
 		 375 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0630269  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01027  hypothetical protein  74.66 
 
 		 375 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.210857  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1259  hypothetical protein  74.93 
 
 		 375 aa  577  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.285306  normal  0.564709 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2578  hypothetical protein  74.66 
 
 		 375 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0453581 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1137  hypothetical protein  74.66 
 
 		 375 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.108261  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1133  hypothetical protein  74.66 
 
 		 375 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0150694  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01020  hypothetical protein  74.66 
 
 		 375 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.154697  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1661  hypothetical protein  60.69 
 
 		 375 aa  419  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0432  hypothetical protein  60.92 
 
 		 371 aa  413  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00842747 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1957  hypothetical protein  62.98 
 
 		 275 aa  317  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.551724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1808  protein of unknown function DUF451  56.88 
 
 		 281 aa  305  9.000000000000001e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.69294 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2875  hypothetical protein  62.35 
 
 		 274 aa  298  8e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.485418  normal  0.113701 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3856  hypothetical protein  61.22 
 
 		 275 aa  298  1e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.344115  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3370  hypothetical protein  61.94 
 
 		 285 aa  298  1e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0182189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1736  hypothetical protein  60.73 
 
 		 275 aa  295  1e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.387479  normal  0.0591392 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2600  hypothetical protein  58.7 
 
 		 272 aa  293  4e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1810  protein of unknown function DUF451  41.99 
 
 		 386 aa  292  5e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.742224 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3597  hypothetical protein  42.86 
 
 		 402 aa  292  6e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3599  hypothetical protein  60.32 
 
 		 274 aa  291  1e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3858  hypothetical protein  42.42 
 
 		 396 aa  287  2e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3311  hypothetical protein  56.63 
 
 		 278 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3368  hypothetical protein  42.37 
 
 		 403 aa  276  3e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0438739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2873  hypothetical protein  42.59 
 
 		 399 aa  267  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.107096  normal  0.129995 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2598  hypothetical protein  39.89 
 
 		 395 aa  266  5e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3279  hypothetical protein  49.8 
 
 		 295 aa  252  8.000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1915  hypothetical protein  37.87 
 
 		 375 aa  251  2e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.395386 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5685  hypothetical protein  36.8 
 
 		 376 aa  224  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.421727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3351  protein of unknown function DUF451  38.9 
 
 		 385 aa  219  5e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0591139  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1734  hypothetical protein  41.67 
 
 		 385 aa  218  1e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0725409  normal  0.221375 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4774  hypothetical protein  37.43 
 
 		 387 aa  215  8e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1951  hypothetical protein  35.98 
 
 		 378 aa  211  1e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.406258 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0189  hypothetical protein  39.71 
 
 		 385 aa  210  4e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0428055 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7008  hypothetical protein  36.26 
 
 		 393 aa  208  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.926109  normal  0.546103 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4912  hypothetical protein  38.07 
 
 		 418 aa  207  2e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1955  putative lipoprotein  36.99 
 
 		 365 aa  204  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0906256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25530  predicted periplasmic lipoprotein involved in iron transport  34.85 
 
 		 406 aa  202  7e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0819691  normal  0.228645 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4328  hypothetical protein  44.44 
 
 		 309 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.924044  normal  0.20283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4621  hypothetical protein  44.44 
 
 		 309 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1567  Peptidase M75, Imelysin  36.12 
 
 		 404 aa  201  1.9999999999999998e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2353  hypothetical protein  35.67 
 
 		 396 aa  198  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3899  hypothetical protein  34.37 
 
 		 410 aa  197  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0203467 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4288  hypothetical protein  35.05 
 
 		 373 aa  195  9e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3313  hypothetical protein  36.01 
 
 		 375 aa  194  2e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0230  hypothetical protein  34.25 
 
 		 409 aa  190  4e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1024  hypothetical protein  41.91 
 
 		 292 aa  184  3e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000003997  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4242  hypothetical protein  43.86 
 
 		 228 aa  179  9e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.711551  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0391  hypothetical protein  40.95 
 
 		 284 aa  177  3e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0401  hypothetical protein  40.95 
 
 		 284 aa  177  3e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1777  iron permease FTR1  30.46 
 
 		 691 aa  117  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3403  iron permease FTR1  25.65 
 
 		 702 aa  106  8e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7481  iron permease FTR1  25.07 
 
 		 438 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6260  iron permease FTR1  23.05 
 
 		 400 aa  76.6  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.787835  normal  0.324266 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3348  iron permease FTR1  25.95 
 
 		 677 aa  65.5  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1398  hypothetical protein  35.42 
 
 		 110 aa  48.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0120742  normal  0.0453479 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>