56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1955 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1955  putative lipoprotein  100 
 
 		 365 aa  701    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0906256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2365  hypothetical protein  37.26 
 
 		 376 aa  207  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0102412  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2041  hypothetical protein  36.99 
 
 		 376 aa  207  3e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.117906 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2263  hypothetical protein  36.99 
 
 		 376 aa  206  5e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2783  hypothetical protein  36.81 
 
 		 373 aa  199  5e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1259  hypothetical protein  36.71 
 
 		 375 aa  199  6e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.285306  normal  0.564709 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2625  conserved hypothetical protein  36.71 
 
 		 375 aa  199  7e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0630269  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01027  hypothetical protein  36.71 
 
 		 375 aa  199  7e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.210857  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2578  hypothetical protein  36.71 
 
 		 375 aa  199  7e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0453581 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1133  hypothetical protein  36.71 
 
 		 375 aa  199  7e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0150694  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01020  hypothetical protein  36.71 
 
 		 375 aa  199  7e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.154697  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3144  hypothetical protein  35.64 
 
 		 374 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2105  hypothetical protein  36.44 
 
 		 375 aa  197  3e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.258925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1137  hypothetical protein  36.44 
 
 		 375 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.108261  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3858  hypothetical protein  33.33 
 
 		 396 aa  193  4e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1546  hypothetical protein  36.07 
 
 		 375 aa  193  4e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.391559  normal  0.123429 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2928  hypothetical protein  36.26 
 
 		 378 aa  191  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000108571  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3597  hypothetical protein  38.55 
 
 		 402 aa  188  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3368  hypothetical protein  38.31 
 
 		 403 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0438739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1810  protein of unknown function DUF451  38.64 
 
 		 386 aa  176  5e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.742224 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1661  hypothetical protein  38.62 
 
 		 375 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2873  hypothetical protein  39.08 
 
 		 399 aa  173  5e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.107096  normal  0.129995 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0432  hypothetical protein  37.93 
 
 		 371 aa  169  7e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00842747 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2598  hypothetical protein  35.53 
 
 		 395 aa  167  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3313  hypothetical protein  35.04 
 
 		 375 aa  157  4e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1734  hypothetical protein  38.68 
 
 		 385 aa  143  4e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0725409  normal  0.221375 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0189  hypothetical protein  27.15 
 
 		 385 aa  94  4e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0428055 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3856  hypothetical protein  27.94 
 
 		 275 aa  91.7  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.344115  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1808  protein of unknown function DUF451  25.82 
 
 		 281 aa  89  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.69294 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7008  hypothetical protein  27.38 
 
 		 393 aa  89.4  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.926109  normal  0.546103 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4912  hypothetical protein  28.03 
 
 		 418 aa  88.6  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1957  hypothetical protein  28.09 
 
 		 275 aa  86.7  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.551724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3370  hypothetical protein  26.53 
 
 		 285 aa  83.2  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0182189  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3599  hypothetical protein  26.12 
 
 		 274 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3351  protein of unknown function DUF451  27.05 
 
 		 385 aa  78.2  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0591139  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2875  hypothetical protein  25.71 
 
 		 274 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.485418  normal  0.113701 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3311  hypothetical protein  26.55 
 
 		 278 aa  74.3  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3899  hypothetical protein  21.36 
 
 		 410 aa  74.3  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0203467 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1736  hypothetical protein  28.52 
 
 		 275 aa  74.7  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.387479  normal  0.0591392 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5685  hypothetical protein  25.78 
 
 		 376 aa  73.2  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.421727  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1915  hypothetical protein  23.92 
 
 		 375 aa  73.2  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.395386 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2600  hypothetical protein  25.3 
 
 		 272 aa  71.2  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4774  hypothetical protein  29.63 
 
 		 387 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4288  hypothetical protein  29.12 
 
 		 373 aa  65.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1951  hypothetical protein  26.54 
 
 		 378 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.406258 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0230  hypothetical protein  23.55 
 
 		 409 aa  59.7  0.00000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25530  predicted periplasmic lipoprotein involved in iron transport  25.6 
 
 		 406 aa  57.4  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0819691  normal  0.228645 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6260  iron permease FTR1  32 
 
 		 400 aa  57.4  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.787835  normal  0.324266 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1567  Peptidase M75, Imelysin  26.32 
 
 		 404 aa  57.4  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2353  hypothetical protein  25.53 
 
 		 396 aa  56.6  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1024  hypothetical protein  22.5 
 
 		 292 aa  52.8  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000003997  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0391  hypothetical protein  20.82 
 
 		 284 aa  51.6  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0401  hypothetical protein  20.82 
 
 		 284 aa  51.6  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3348  iron permease FTR1  28.33 
 
 		 677 aa  50.4  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1777  iron permease FTR1  27.27 
 
 		 691 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0464  cytochrome c oxidase subunit II  33.63 
 
 		 266 aa  43.9  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>