61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2600 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2600  hypothetical protein  100 
 
 		 272 aa  544  1e-154  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1736  hypothetical protein  71.8 
 
 		 275 aa  374  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.387479  normal  0.0591392 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1808  protein of unknown function DUF451  65.12 
 
 		 281 aa  354  7.999999999999999e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.69294 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3856  hypothetical protein  67.28 
 
 		 275 aa  343  2e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.344115  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3599  hypothetical protein  65.75 
 
 		 274 aa  319  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3370  hypothetical protein  65.75 
 
 		 285 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0182189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1957  hypothetical protein  58.46 
 
 		 275 aa  309  4e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.551724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3311  hypothetical protein  54.41 
 
 		 278 aa  308  5e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2783  hypothetical protein  59.39 
 
 		 373 aa  307  1.0000000000000001e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2875  hypothetical protein  64.17 
 
 		 274 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.485418  normal  0.113701 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1546  hypothetical protein  61.85 
 
 		 375 aa  304  8.000000000000001e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.391559  normal  0.123429 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1259  hypothetical protein  60.89 
 
 		 375 aa  300  1e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.285306  normal  0.564709 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2105  hypothetical protein  60.89 
 
 		 375 aa  300  1e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.258925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2928  hypothetical protein  59.51 
 
 		 378 aa  300  2e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000108571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1137  hypothetical protein  60.98 
 
 		 375 aa  300  2e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.108261  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2578  hypothetical protein  60.48 
 
 		 375 aa  298  5e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0453581 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01027  hypothetical protein  60.48 
 
 		 375 aa  298  5e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.210857  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1133  hypothetical protein  60.48 
 
 		 375 aa  298  5e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0150694  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01020  hypothetical protein  60.48 
 
 		 375 aa  298  5e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.154697  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2625  conserved hypothetical protein  60.48 
 
 		 375 aa  298  5e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0630269  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3144  hypothetical protein  59.38 
 
 		 374 aa  297  1e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2263  hypothetical protein  58.7 
 
 		 376 aa  293  3e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2041  hypothetical protein  58.3 
 
 		 376 aa  291  9e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.117906 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2365  hypothetical protein  58.3 
 
 		 376 aa  291  1e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0102412  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1661  hypothetical protein  57.49 
 
 		 375 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0432  hypothetical protein  58.7 
 
 		 371 aa  272  6e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00842747 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3279  hypothetical protein  44.96 
 
 		 295 aa  219  3e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1915  hypothetical protein  43.57 
 
 		 375 aa  212  5.999999999999999e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.395386 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3351  protein of unknown function DUF451  44.87 
 
 		 385 aa  204  1e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0591139  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3597  hypothetical protein  40.33 
 
 		 402 aa  202  4e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2353  hypothetical protein  42.06 
 
 		 396 aa  200  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5685  hypothetical protein  42.5 
 
 		 376 aa  197  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.421727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3368  hypothetical protein  40.98 
 
 		 403 aa  196  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0438739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4774  hypothetical protein  42.98 
 
 		 387 aa  195  5.000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4288  hypothetical protein  42.05 
 
 		 373 aa  194  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1951  hypothetical protein  42.55 
 
 		 378 aa  194  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.406258 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1024  hypothetical protein  42.74 
 
 		 292 aa  192  5e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000003997  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1567  Peptidase M75, Imelysin  41.25 
 
 		 404 aa  184  1.0000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0189  hypothetical protein  40.93 
 
 		 385 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0428055 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3858  hypothetical protein  36.25 
 
 		 396 aa  182  7e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0401  hypothetical protein  38.33 
 
 		 284 aa  175  8e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0391  hypothetical protein  38.33 
 
 		 284 aa  175  8e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7008  hypothetical protein  37.45 
 
 		 393 aa  174  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.926109  normal  0.546103 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4621  hypothetical protein  42.06 
 
 		 309 aa  170  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4328  hypothetical protein  42.06 
 
 		 309 aa  170  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.924044  normal  0.20283 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2873  hypothetical protein  36.49 
 
 		 399 aa  169  5e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.107096  normal  0.129995 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25530  predicted periplasmic lipoprotein involved in iron transport  37.83 
 
 		 406 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0819691  normal  0.228645 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1810  protein of unknown function DUF451  40.41 
 
 		 386 aa  158  1e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.742224 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0230  hypothetical protein  36.86 
 
 		 409 aa  156  3e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4242  hypothetical protein  41.58 
 
 		 228 aa  155  8e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.711551  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4912  hypothetical protein  37.5 
 
 		 418 aa  154  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3899  hypothetical protein  33.87 
 
 		 410 aa  149  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0203467 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2598  hypothetical protein  34.43 
 
 		 395 aa  140  3e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1734  hypothetical protein  33.2 
 
 		 385 aa  120  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0725409  normal  0.221375 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1777  iron permease FTR1  29.71 
 
 		 691 aa  111  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3313  hypothetical protein  28.69 
 
 		 375 aa  97.1  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7481  iron permease FTR1  27.85 
 
 		 438 aa  96.3  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6260  iron permease FTR1  30.32 
 
 		 400 aa  89.7  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.787835  normal  0.324266 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3403  iron permease FTR1  26.38 
 
 		 702 aa  87.8  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1955  putative lipoprotein  25.3 
 
 		 365 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0906256  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3348  iron permease FTR1  23.5 
 
 		 677 aa  62.4  0.000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>