60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4242 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_4621  hypothetical protein  99.56 
 
 
309 aa  464  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223907  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4328  hypothetical protein  99.56 
 
 
309 aa  464  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.924044  normal  0.20283 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4242  hypothetical protein  100 
 
 
228 aa  461  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.711551  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1259  hypothetical protein  43.86 
 
 
375 aa  186  4e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.285306  normal  0.564709 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2625  conserved hypothetical protein  43.42 
 
 
375 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0630269  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01027  hypothetical protein  43.42 
 
 
375 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.210857  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2105  hypothetical protein  43.42 
 
 
375 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.258925  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2578  hypothetical protein  43.42 
 
 
375 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0453581 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1137  hypothetical protein  43.42 
 
 
375 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.108261  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1133  hypothetical protein  43.42 
 
 
375 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0150694  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01020  hypothetical protein  43.42 
 
 
375 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.154697  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2783  hypothetical protein  43.42 
 
 
373 aa  182  3e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2928  hypothetical protein  43.42 
 
 
378 aa  181  6e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000108571  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2365  hypothetical protein  44.3 
 
 
376 aa  180  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0102412  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2041  hypothetical protein  43.86 
 
 
376 aa  179  2.9999999999999997e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.117906 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2263  hypothetical protein  43.86 
 
 
376 aa  179  4e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1546  hypothetical protein  41.23 
 
 
375 aa  175  5e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.391559  normal  0.123429 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3144  hypothetical protein  41.67 
 
 
374 aa  171  9e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1957  hypothetical protein  46.51 
 
 
275 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.551724  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3311  hypothetical protein  39.91 
 
 
278 aa  161  9e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2600  hypothetical protein  41.58 
 
 
272 aa  155  6e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1915  hypothetical protein  43.72 
 
 
375 aa  154  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.395386 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1808  protein of unknown function DUF451  41.11 
 
 
281 aa  153  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.69294 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1736  hypothetical protein  37.99 
 
 
275 aa  150  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.387479  normal  0.0591392 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3856  hypothetical protein  40.61 
 
 
275 aa  150  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.344115  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5685  hypothetical protein  44.26 
 
 
376 aa  150  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.421727  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1661  hypothetical protein  36.24 
 
 
375 aa  139  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0432  hypothetical protein  37.72 
 
 
371 aa  137  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00842747 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3279  hypothetical protein  39.66 
 
 
295 aa  137  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3351  protein of unknown function DUF451  35.71 
 
 
385 aa  135  4e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0591139  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0189  hypothetical protein  39.61 
 
 
385 aa  135  5e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0428055 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3599  hypothetical protein  40.78 
 
 
274 aa  134  8e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2353  hypothetical protein  38.25 
 
 
396 aa  134  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3370  hypothetical protein  40.78 
 
 
285 aa  133  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0182189  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2875  hypothetical protein  40.78 
 
 
274 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.485418  normal  0.113701 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4288  hypothetical protein  41.95 
 
 
373 aa  131  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3597  hypothetical protein  34.8 
 
 
402 aa  128  6e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0230  hypothetical protein  35.27 
 
 
409 aa  126  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1567  Peptidase M75, Imelysin  35.08 
 
 
404 aa  124  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3368  hypothetical protein  37.99 
 
 
403 aa  122  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0438739  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7008  hypothetical protein  32.46 
 
 
393 aa  122  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.926109  normal  0.546103 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3899  hypothetical protein  38.14 
 
 
410 aa  122  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0203467 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1810  protein of unknown function DUF451  34.29 
 
 
386 aa  119  3e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.742224 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4774  hypothetical protein  34.35 
 
 
387 aa  119  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1024  hypothetical protein  37.06 
 
 
292 aa  119  3.9999999999999996e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000003997  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1951  hypothetical protein  33.91 
 
 
378 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.406258 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25530  predicted periplasmic lipoprotein involved in iron transport  32.9 
 
 
406 aa  114  7.999999999999999e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0819691  normal  0.228645 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4912  hypothetical protein  38.04 
 
 
418 aa  107  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1734  hypothetical protein  39.13 
 
 
385 aa  106  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0725409  normal  0.221375 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3858  hypothetical protein  32.6 
 
 
396 aa  105  7e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2873  hypothetical protein  34.04 
 
 
399 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.107096  normal  0.129995 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0391  hypothetical protein  32.22 
 
 
284 aa  99.8  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0401  hypothetical protein  32.22 
 
 
284 aa  99.8  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1777  iron permease FTR1  28.76 
 
 
691 aa  85.5  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2598  hypothetical protein  30.23 
 
 
395 aa  82  0.000000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7481  iron permease FTR1  28.14 
 
 
438 aa  72.4  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3403  iron permease FTR1  31.17 
 
 
702 aa  70.1  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3313  hypothetical protein  29.03 
 
 
375 aa  62.8  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6260  iron permease FTR1  27.17 
 
 
400 aa  55.8  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.787835  normal  0.324266 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3348  iron permease FTR1  25.97 
 
 
677 aa  52.8  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>