61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3856 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_3856  hypothetical protein  100 
 
 
275 aa  546  1e-154  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.344115  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2600  hypothetical protein  67.28 
 
 
272 aa  360  2e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1808  protein of unknown function DUF451  67.04 
 
 
281 aa  355  3.9999999999999996e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.69294 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3144  hypothetical protein  67.73 
 
 
374 aa  338  5.9999999999999996e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2928  hypothetical protein  66.26 
 
 
378 aa  333  2e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000108571  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2783  hypothetical protein  65.61 
 
 
373 aa  333  3e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3370  hypothetical protein  67.45 
 
 
285 aa  332  3e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0182189  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1957  hypothetical protein  61.09 
 
 
275 aa  332  3e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.551724  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3311  hypothetical protein  59.5 
 
 
278 aa  331  7.000000000000001e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3599  hypothetical protein  66.67 
 
 
274 aa  328  7e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1736  hypothetical protein  62.59 
 
 
275 aa  325  4.0000000000000003e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.387479  normal  0.0591392 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1259  hypothetical protein  63.41 
 
 
375 aa  323  1e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.285306  normal  0.564709 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2875  hypothetical protein  67.84 
 
 
274 aa  323  2e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.485418  normal  0.113701 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2105  hypothetical protein  63.41 
 
 
375 aa  323  2e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.258925  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2578  hypothetical protein  63.01 
 
 
375 aa  322  4e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0453581 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01027  hypothetical protein  63.01 
 
 
375 aa  322  4e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.210857  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01020  hypothetical protein  63.01 
 
 
375 aa  322  4e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.154697  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1137  hypothetical protein  63.01 
 
 
375 aa  322  4e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.108261  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1133  hypothetical protein  63.01 
 
 
375 aa  322  4e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0150694  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2625  conserved hypothetical protein  63.01 
 
 
375 aa  322  4e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0630269  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1546  hypothetical protein  64.17 
 
 
375 aa  321  8e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.391559  normal  0.123429 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2041  hypothetical protein  61.6 
 
 
376 aa  317  9e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.117906 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2365  hypothetical protein  61.6 
 
 
376 aa  317  1e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0102412  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2263  hypothetical protein  61.22 
 
 
376 aa  316  3e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1661  hypothetical protein  59.27 
 
 
375 aa  300  2e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0432  hypothetical protein  61.69 
 
 
371 aa  291  1e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00842747 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3279  hypothetical protein  48.32 
 
 
295 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1915  hypothetical protein  45.57 
 
 
375 aa  225  5.0000000000000005e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.395386 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1024  hypothetical protein  46.06 
 
 
292 aa  207  1e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000003997  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4774  hypothetical protein  44.73 
 
 
387 aa  206  3e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1951  hypothetical protein  43.04 
 
 
378 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.406258 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5685  hypothetical protein  41.74 
 
 
376 aa  198  9e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.421727  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3351  protein of unknown function DUF451  45.69 
 
 
385 aa  194  1e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0591139  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2353  hypothetical protein  44.12 
 
 
396 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3597  hypothetical protein  37.55 
 
 
402 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7008  hypothetical protein  38.91 
 
 
393 aa  188  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.926109  normal  0.546103 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4288  hypothetical protein  42.55 
 
 
373 aa  187  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0401  hypothetical protein  42.92 
 
 
284 aa  185  7e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0391  hypothetical protein  42.92 
 
 
284 aa  185  7e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3368  hypothetical protein  38.98 
 
 
403 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0438739  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4621  hypothetical protein  41.27 
 
 
309 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223907  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4328  hypothetical protein  41.27 
 
 
309 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.924044  normal  0.20283 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1567  Peptidase M75, Imelysin  38.97 
 
 
404 aa  179  2.9999999999999997e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1810  protein of unknown function DUF451  42.16 
 
 
386 aa  176  4e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.742224 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3858  hypothetical protein  33.46 
 
 
396 aa  175  7e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0230  hypothetical protein  40.34 
 
 
409 aa  173  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2873  hypothetical protein  37.95 
 
 
399 aa  171  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.107096  normal  0.129995 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4912  hypothetical protein  39.92 
 
 
418 aa  167  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4242  hypothetical protein  40.61 
 
 
228 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.711551  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0189  hypothetical protein  39.57 
 
 
385 aa  162  4.0000000000000004e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0428055 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3899  hypothetical protein  37.6 
 
 
410 aa  156  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0203467 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2598  hypothetical protein  36.21 
 
 
395 aa  150  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25530  predicted periplasmic lipoprotein involved in iron transport  37.25 
 
 
406 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0819691  normal  0.228645 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1734  hypothetical protein  36.36 
 
 
385 aa  139  3.9999999999999997e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0725409  normal  0.221375 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1777  iron permease FTR1  28.97 
 
 
691 aa  111  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3313  hypothetical protein  28.16 
 
 
375 aa  97.1  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6260  iron permease FTR1  30.05 
 
 
400 aa  92  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.787835  normal  0.324266 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7481  iron permease FTR1  28.16 
 
 
438 aa  92  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1955  putative lipoprotein  27.94 
 
 
365 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0906256  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3403  iron permease FTR1  25.53 
 
 
702 aa  78.2  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3348  iron permease FTR1  25.53 
 
 
677 aa  68.6  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>