256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_2737 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_2737  deoxyribose-phosphate aldolase  100 
 
 		 223 aa  455  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2652  deoxyribose-phosphate aldolase  99.55 
 
 		 223 aa  453  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1556  deoxyribose-phosphate aldolase  99.55 
 
 		 223 aa  453  1.0000000000000001e-126  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1685  deoxyribose-phosphate aldolase  80.54 
 
 		 222 aa  364  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0166673  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1951  deoxyribose-phosphate aldolase  80.09 
 
 		 222 aa  360  8e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000223419  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1632  deoxyribose-phosphate aldolase  83.19 
 
 		 226 aa  355  3.9999999999999996e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.101131  hitchhiker  0.000603292 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6902  deoxyribose-phosphate aldolase  67.73 
 
 		 226 aa  295  3e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.640052 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4491  deoxyribose-phosphate aldolase  65.75 
 
 		 226 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0748  deoxyribose-phosphate aldolase  58.96 
 
 		 224 aa  268  7e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000138208  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6946  deoxyribose-phosphate aldolase  66.82 
 
 		 226 aa  261  4e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1543  deoxyribose-phosphate aldolase  66.82 
 
 		 226 aa  261  4e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.486801  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6286  deoxyribose-phosphate aldolase  66.82 
 
 		 226 aa  261  4e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.576612 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2432  deoxyribose-phosphate aldolase  59.46 
 
 		 223 aa  250  2e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000478055  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0964  deoxyribose-phosphate aldolase  59.81 
 
 		 217 aa  243  9.999999999999999e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1018  deoxyribose-phosphate aldolase  59.26 
 
 		 223 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1028  deoxyribose-phosphate aldolase  53.27 
 
 		 223 aa  224  1e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0160558  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0509  deoxyribose-phosphate aldolase  53.18 
 
 		 222 aa  223  1e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2309  deoxyribose-phosphate aldolase  55.19 
 
 		 224 aa  222  3e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1752  deoxyribose-phosphate aldolase  54.5 
 
 		 223 aa  221  6e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000014838  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1469  deoxyribose-phosphate aldolase  52.25 
 
 		 223 aa  221  9e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000353478  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2002  deoxyribose-phosphate aldolase  54.98 
 
 		 223 aa  221  9e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000046318  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2024  deoxyribose-phosphate aldolase  54.72 
 
 		 224 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1975  deoxyribose-phosphate aldolase  54.5 
 
 		 223 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000361554  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1754  deoxyribose-phosphate aldolase  54.5 
 
 		 223 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000633467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1732  deoxyribose-phosphate aldolase  54.5 
 
 		 223 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000133767  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1703  deoxyribose-phosphate aldolase  54.5 
 
 		 223 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000427517  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1892  deoxyribose-phosphate aldolase  54.5 
 
 		 223 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00116548  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1927  deoxyribose-phosphate aldolase  54.5 
 
 		 223 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.03965e-43 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1895  deoxyribose-phosphate aldolase  54.03 
 
 		 223 aa  218  6e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00141039  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1790  deoxyribose-phosphate aldolase  50.23 
 
 		 221 aa  218  6e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3451  deoxyribose-phosphate aldolase  54.03 
 
 		 223 aa  217  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000347492  hitchhiker  7.10453e-17 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1529  deoxyribose-phosphate aldolase  53.37 
 
 		 220 aa  216  2e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.24647  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2211  deoxyribose-phosphate aldolase  53.02 
 
 		 220 aa  216  2.9999999999999998e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2173  deoxyribose-phosphate aldolase  53.02 
 
 		 220 aa  216  2.9999999999999998e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0129  deoxyribose-phosphate aldolase  52.34 
 
 		 220 aa  215  5e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1057  deoxyribose-phosphate aldolase  54.34 
 
 		 233 aa  215  5e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0124  deoxyribose-phosphate aldolase  52.34 
 
 		 220 aa  215  5e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.381743  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1745  deoxyribose-phosphate aldolase  51.16 
 
 		 220 aa  214  8e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1248  deoxyribose-phosphate aldolase  53.21 
 
 		 247 aa  213  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.747393  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0152  deoxyribose-phosphate aldolase  55.71 
 
 		 215 aa  213  1.9999999999999998e-54  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12490  deoxyribose-phosphate aldolase  52.05 
 
 		 233 aa  213  2.9999999999999995e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2303  deoxyribose-phosphate aldolase  52.51 
 
 		 238 aa  211  7.999999999999999e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0703624  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1597  deoxyribose-phosphate aldolase  51.16 
 
 		 220 aa  209  3e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.464616  unclonable  1.48452e-23 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1266  deoxyribose-phosphate aldolase  52.27 
 
 		 409 aa  207  1e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0916741  normal  0.0813164 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0243  deoxyribose-phosphate aldolase  52.38 
 
 		 241 aa  206  3e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.156632  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6095  deoxyribose-phosphate aldolase  53.81 
 
 		 317 aa  204  8e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0401108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1129  deoxyribose-phosphate aldolase  50.7 
 
 		 226 aa  204  8e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1301  deoxyribose-phosphate aldolase  51.82 
 
 		 238 aa  202  4e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000113978 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0156  deoxyribose-phosphate aldolase  51.64 
 
 		 222 aa  202  5e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl121  deoxyribose-phosphate aldolase  49.77 
 
 		 220 aa  201  7e-51  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  7.16893e-32  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1345  deoxyribose-phosphate aldolase  51.87 
 
 		 223 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532359  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2706  deoxyribose-phosphate aldolase  54.25 
 
 		 220 aa  200  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0134  deoxyribose-phosphate aldolase  53.14 
 
 		 213 aa  199  3e-50  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0772  deoxyribose-phosphate aldolase  50.23 
 
 		 224 aa  198  5e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1109  deoxyribose-phosphate aldolase  48.37 
 
 		 228 aa  197  7.999999999999999e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.875719  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1452  deoxyribose-phosphate aldolase  49.77 
 
 		 220 aa  194  6e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.922957  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4274  deoxyribose-phosphate aldolase  49.77 
 
 		 218 aa  194  7e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1233  deoxyribose-phosphate aldolase  50.47 
 
 		 248 aa  194  8.000000000000001e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0448  deoxyribose-phosphate aldolase  48.34 
 
 		 216 aa  194  9e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000718751  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05590  deoxyribose-phosphate aldolase  50.91 
 
 		 229 aa  192  2e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00397833  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1222  deoxyribose-phosphate aldolase  50 
 
 		 248 aa  192  4e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1774  deoxyribose-phosphate aldolase  48.82 
 
 		 221 aa  189  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2818  deoxyribose-phosphate aldolase  52.38 
 
 		 239 aa  188  5e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.964115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1507  deoxyribose-phosphate aldolase  49.52 
 
 		 241 aa  187  1e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4728  deoxyribose-phosphate aldolase  47.96 
 
 		 221 aa  186  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0689  deoxyribose-phosphate aldolase  44.81 
 
 		 215 aa  186  3e-46  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1322  deoxyribose-phosphate aldolase  44.76 
 
 		 219 aa  185  5e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0846127  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2600  deoxyribose-phosphate aldolase  48.64 
 
 		 219 aa  184  6e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1538  deoxyribose-phosphate aldolase  49.76 
 
 		 212 aa  184  7e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.539113  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0755  deoxyribose-phosphate aldolase  44.8 
 
 		 222 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3216  deoxyribose-phosphate aldolase  53.3 
 
 		 220 aa  181  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.840655 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0009  deoxyribose-phosphate aldolase  46.19 
 
 		 249 aa  180  1e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000000986742  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3057  deoxyribose-phosphate aldolase  47.14 
 
 		 237 aa  180  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.928441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0111  deoxyribose-phosphate aldolase  46.45 
 
 		 224 aa  179  2.9999999999999997e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000645513  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3950  deoxyribose-phosphate aldolase  44.91 
 
 		 219 aa  171  6.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf239  deoxyribose-phosphate aldolase  42.38 
 
 		 217 aa  170  2e-41  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000190899  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0832  deoxyribose-phosphate aldolase  46.54 
 
 		 236 aa  168  8e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0977  deoxyribose-phosphate aldolase  44.6 
 
 		 228 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.408395  normal  0.593139 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1583  deoxyribose-phosphate aldolase  41.86 
 
 		 222 aa  167  1e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3002  deoxyribose-phosphate aldolase  46.04 
 
 		 231 aa  166  4e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00170896 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2538  deoxyribose-phosphate aldolase  42.38 
 
 		 223 aa  165  5e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1239  deoxyribose-phosphate aldolase  41.04 
 
 		 243 aa  164  8e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0036  deoxyribose-phosphate aldolase  39.44 
 
 		 222 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000477173  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2321  deoxyribose-phosphate aldolase  43.46 
 
 		 221 aa  160  1e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000020157  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2790  deoxyribose-phosphate aldolase  44.02 
 
 		 248 aa  160  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21200  deoxyribose-phosphate aldolase  47.11 
 
 		 221 aa  160  1e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2070  deoxyribose-phosphate aldolase  40.93 
 
 		 223 aa  159  2e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.661265  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2961  deoxyribose-phosphate aldolase  42.47 
 
 		 260 aa  159  4e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1505  deoxyribose-phosphate aldolase  40.71 
 
 		 235 aa  158  6e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00680706  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1003  deoxyribose-phosphate aldolase  44.44 
 
 		 236 aa  157  1e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25660  deoxyribose-phosphate aldolase  48.58 
 
 		 240 aa  156  3e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.107736  normal  0.272128 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1525  deoxyribose-phosphate aldolase  42.31 
 
 		 234 aa  154  9e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1083  deoxyribose-phosphate aldolase  43.06 
 
 		 248 aa  154  9e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3408  deoxyribose-phosphate aldolase  40.38 
 
 		 224 aa  154  1e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00715959  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2833  deoxyribose-phosphate aldolase  40.38 
 
 		 231 aa  153  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0559245 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1943  deoxyribose-phosphate aldolase  43.69 
 
 		 227 aa  153  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.004325  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0114  deoxyribose-phosphate aldolase  41.83 
 
 		 221 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0753  deoxyribose-phosphate aldolase  37.67 
 
 		 231 aa  152  4e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1434  deoxyribose-phosphate aldolase  39.17 
 
 		 229 aa  151  7e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2974  deoxyribose-phosphate aldolase  43.18 
 
 		 241 aa  149  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.782608  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>