31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1954 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1954  Phage protein D-like protein  100 
 
 		 407 aa  839    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0982  hypothetical protein  27.66 
 
 		 362 aa  116  6e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2817  Rhs element Vgr protein  27 
 
 		 593 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1663  Rhs element Vgr protein  27.59 
 
 		 589 aa  114  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485896  normal  0.191701 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4347  hypothetical protein  26.43 
 
 		 393 aa  104  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.21518  normal  0.0759441 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1626  Rhs element Vgr protein  26.46 
 
 		 592 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0131276 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1869  hypothetical protein  22.55 
 
 		 406 aa  85.1  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1508  phage protein D  21.41 
 
 		 348 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1732  Rhs element Vgr protein  22.77 
 
 		 641 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00520263 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3664  hypothetical protein  25.77 
 
 		 360 aa  79  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000879822 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0770  Phage protein D-like protein  22.74 
 
 		 341 aa  75.1  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.737587  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5384  Rhs element Vgr protein  25.89 
 
 		 602 aa  72.4  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0926  Rhs element Vgr protein  23.37 
 
 		 587 aa  63.2  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.91076  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2945  Rhs element Vgr protein  25.91 
 
 		 589 aa  63.2  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703955  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1883  Phage protein D-like  22.62 
 
 		 427 aa  61.6  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.109131  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0938  Phage protein D-like  22.62 
 
 		 427 aa  61.6  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0367858  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3822  phage protein D-like  22.38 
 
 		 427 aa  60.8  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2267  Rhs element Vgr protein  27.78 
 
 		 610 aa  60.1  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.267374  hitchhiker  0.000675551 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3155  Rhs element Vgr protein  22.15 
 
 		 581 aa  60.1  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1682  Rhs element Vgr protein  20.63 
 
 		 589 aa  59.7  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1906  Rhs element Vgr protein  23.61 
 
 		 606 aa  58.2  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194585  hitchhiker  0.0014616 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2550  Rhs element Vgr protein  19.69 
 
 		 589 aa  57  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3822  Rhs element Vgr protein  21.85 
 
 		 578 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.112104  normal  0.0443202 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3042  hypothetical protein  30.26 
 
 		 361 aa  54.7  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000069589 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2462  hypothetical protein  22.7 
 
 		 595 aa  53.9  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0669  Rhs element Vgr protein  21.54 
 
 		 576 aa  50.1  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0662  putative phage late control gene D protein  21.84 
 
 		 417 aa  49.3  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2556  hypothetical protein  21.88 
 
 		 379 aa  48.1  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000358753 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1818  hypothetical protein  21.77 
 
 		 352 aa  47  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0852  putative phage late control gene D protein  21.52 
 
 		 417 aa  44.7  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1815  hypothetical protein  22.69 
 
 		 384 aa  43.5  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.553808 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>