45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1568 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1568  phage transcriptional regulator, AlpA  100 
 
 		 78 aa  161  3e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0794  phage transcriptional regulator, AlpA  52.7 
 
 		 80 aa  88.2  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3400  excisionase/Xis, DNA-binding  50 
 
 		 67 aa  68.6  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.149044  normal  0.941733 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23900  MerR family regulatory protein  52 
 
 		 58 aa  61.2  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0883926  normal  0.115779 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1445  excision promoter, Xis  48.98 
 
 		 89 aa  61.2  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.347702 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1293  regulatory protein MerR  42.59 
 
 		 59 aa  60.5  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0923  hypothetical protein  44.07 
 
 		 62 aa  60.1  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3570  excisionase/Xis, DNA-binding  45.1 
 
 		 65 aa  59.3  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00201756 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0015  regulatory protein MerR  39.24 
 
 		 75 aa  55.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6363  hypothetical protein  41.51 
 
 		 59 aa  54.7  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0603  excisionase/Xis, DNA-binding protein  43.14 
 
 		 58 aa  53.5  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.517756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2294  hypothetical protein  40 
 
 		 91 aa  50.8  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5292  hypothetical protein  39.58 
 
 		 69 aa  50.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1800  hypothetical protein  42.62 
 
 		 70 aa  47  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1297  hypothetical protein  38.71 
 
 		 93 aa  46.6  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2014  hypothetical protein  37.5 
 
 		 89 aa  46.2  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3473  DNA binding domain protein, excisionase family  41.18 
 
 		 88 aa  45.4  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1608  hypothetical protein  34.48 
 
 		 89 aa  45.4  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.254623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0183  hypothetical protein  39.58 
 
 		 252 aa  45.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.8786 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2021  DNA binding domain protein, excisionase family  38 
 
 		 77 aa  45.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1723  hypothetical protein  36 
 
 		 80 aa  45.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1452  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 77 aa  43.9  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3521  DNA binding domain protein, excisionase family  37.93 
 
 		 70 aa  44.3  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0859  putative transcriptional regulator, MerR family  38 
 
 		 117 aa  43.9  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3346  hypothetical protein  34.33 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.599025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3583  hypothetical protein  38.78 
 
 		 95 aa  43.5  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.529666 
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7734  hypothetical protein  36.54 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1035  putative transcriptor regulator  31.88 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.112928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2338  hypothetical protein  40 
 
 		 89 aa  42.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.440065  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1678  hypothetical protein  35.19 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7051  hypothetical protein  40 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3559  hypothetical protein  38.18 
 
 		 89 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1612  putative transcriptional regulator, MerR family  38.24 
 
 		 351 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1535  phage transcriptional regulator, AlpA  33.96 
 
 		 73 aa  42  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4915  hypothetical protein  41.67 
 
 		 65 aa  41.6  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.315038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4829  hypothetical protein  41.67 
 
 		 65 aa  41.6  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0479763  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1284  hypothetical protein  27.45 
 
 		 66 aa  41.6  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0195028  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3909  putative transcriptional regulator  31.34 
 
 		 94 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1419  DNA binding protein, putative  31.25 
 
 		 68 aa  41.2  0.004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.226949  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16860  hypothetical protein  39.29 
 
 		 74 aa  41.6  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.526145  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11069  hypothetical protein  41.67 
 
 		 251 aa  41.6  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.204604 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7730  hypothetical protein  32.81 
 
 		 91 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.196899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2528  hypothetical protein  44 
 
 		 79 aa  40.8  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.502118  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4449  hypothetical protein  39.58 
 
 		 65 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.219666  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2012  DNA binding domain protein, excisionase family  34 
 
 		 72 aa  40  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>