41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0323 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0323  flp pilus assembly protein FlpE  100 
 
 
266 aa  482  1e-135  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.264858  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33370  hypothetical protein  37.84 
 
 
309 aa  80.1  0.00000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.066941  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2225  hypothetical protein  41.36 
 
 
265 aa  76.3  0.0000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.503048 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5871  hypothetical protein  33.62 
 
 
369 aa  73.2  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.0000185366  normal  0.407546 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5422  hypothetical protein  35.71 
 
 
365 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0728  hypothetical protein  36.79 
 
 
359 aa  70.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1383  hypothetical protein  35.66 
 
 
365 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.068723  normal  0.317281 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3162  hypothetical protein  33.49 
 
 
362 aa  68.9  0.00000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0841875 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3909  hypothetical protein  37.56 
 
 
355 aa  67.8  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4422  hypothetical protein  39.91 
 
 
366 aa  67.8  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0164716 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0517  hypothetical protein  37.44 
 
 
352 aa  67.8  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1983  septum site determining protein  34.75 
 
 
403 aa  65.9  0.0000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0618  hypothetical protein  35.44 
 
 
345 aa  65.9  0.0000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0363  septum site determining protein  35.32 
 
 
348 aa  65.1  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000346854  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0591  septum site determining protein  37.55 
 
 
357 aa  62.4  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2778  flp pilus assembly protein FlpE  43.01 
 
 
229 aa  62  0.000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102172  hitchhiker  0.0000109666 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13690  hypothetical protein  35.06 
 
 
350 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00103627  normal  0.200408 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0213  chromosome partitioning-like ATPase  39.57 
 
 
346 aa  56.6  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4806  hypothetical protein  34.83 
 
 
353 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.723828  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4892  hypothetical protein  34.83 
 
 
353 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.131307 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4040  hypothetical protein  36.91 
 
 
366 aa  55.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.79902  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5193  hypothetical protein  34.83 
 
 
353 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000272361 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0053  hypothetical protein  46.91 
 
 
569 aa  53.5  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.544146  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03351  hypothetical protein  25.86 
 
 
411 aa  52.8  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0129  putative septum site determining protein  31.19 
 
 
364 aa  51.6  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4839  hypothetical protein  35.65 
 
 
359 aa  51.2  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0275  hypothetical protein  36.51 
 
 
371 aa  49.3  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0479  hypothetical protein  34.2 
 
 
348 aa  49.3  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.778166 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3334  septum site-determining protein MinD  23.28 
 
 
264 aa  47.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0234044  normal  0.602718 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1461  septum site-determining protein MinD  26.24 
 
 
266 aa  47.4  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63007  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25310  hypothetical protein  29.58 
 
 
235 aa  46.2  0.0005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3373  hypothetical protein  29.95 
 
 
325 aa  45.8  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2044  response regulator receiver protein  30.6 
 
 
401 aa  45.8  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.274196  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35930  hypothetical protein  31.62 
 
 
364 aa  45.4  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.184188 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0927  septum site-determining protein MinD  20.59 
 
 
274 aa  44.7  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000246443  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1415  flagellar number regulator  20.23 
 
 
280 aa  45.4  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.682888  normal  0.589632 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06194  hypothetical protein  23.85 
 
 
413 aa  44.3  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0949  septum site-determining protein MinD  20.59 
 
 
271 aa  44.7  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.790787  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2367  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  26.58 
 
 
418 aa  43.9  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.129539  normal  0.0992977 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3409  septum site-determining protein MinD  23.63 
 
 
270 aa  43.1  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.224611  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1558  septum site-determining protein MinD  23.63 
 
 
270 aa  43.5  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.859979  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>