68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_33370 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_33370  hypothetical protein  100 
 
 		 309 aa  575  1.0000000000000001e-163  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.066941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2225  hypothetical protein  36.33 
 
 		 265 aa  90.1  4e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.503048 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0323  flp pilus assembly protein FlpE  39.81 
 
 		 266 aa  90.1  4e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.264858  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1383  hypothetical protein  38.21 
 
 		 365 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.068723  normal  0.317281 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0618  hypothetical protein  40.28 
 
 		 345 aa  85.5  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5422  hypothetical protein  34.29 
 
 		 365 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0728  hypothetical protein  37.9 
 
 		 359 aa  80.5  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1983  septum site determining protein  44.35 
 
 		 403 aa  79.3  0.00000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5871  hypothetical protein  34.93 
 
 		 369 aa  77.8  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.0000185366  normal  0.407546 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4422  hypothetical protein  37.33 
 
 		 366 aa  75.1  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0164716 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2778  flp pilus assembly protein FlpE  43.26 
 
 		 229 aa  75.5  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102172  hitchhiker  0.0000109666 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0517  hypothetical protein  35.25 
 
 		 352 aa  70.9  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4040  hypothetical protein  39.07 
 
 		 366 aa  70.9  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.79902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25310  hypothetical protein  41.94 
 
 		 235 aa  70.1  0.00000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4839  hypothetical protein  40.35 
 
 		 359 aa  68.9  0.00000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3373  hypothetical protein  32.41 
 
 		 325 aa  65.1  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3162  hypothetical protein  33.17 
 
 		 362 aa  63.5  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0841875 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1298  chromosome partitioning ATPase  32.69 
 
 		 232 aa  61.6  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0053  hypothetical protein  51.85 
 
 		 569 aa  60.1  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.544146  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0213  chromosome partitioning-like ATPase  42.55 
 
 		 346 aa  59.3  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3777  capsular exopolysaccharide family  32.06 
 
 		 782 aa  54.3  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0395  cell division ATPase MinD  23.94 
 
 		 262 aa  53.5  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1524  cell division ATPase MinD  23.94 
 
 		 262 aa  53.5  0.000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.016628  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0440  septum site-determining protein MinD  23.94 
 
 		 262 aa  53.5  0.000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4892  hypothetical protein  30.56 
 
 		 353 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.131307 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4806  hypothetical protein  30.56 
 
 		 353 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.723828  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2317  response regulator receiver protein  24.42 
 
 		 392 aa  51.6  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.594065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5193  hypothetical protein  30.56 
 
 		 353 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000272361 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35930  hypothetical protein  34.04 
 
 		 364 aa  50.4  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.184188 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0868  septum site-determining protein MinD  22.9 
 
 		 269 aa  50.1  0.00005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.662974  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0479  hypothetical protein  45 
 
 		 348 aa  50.1  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.778166 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0119  hypothetical protein  32.56 
 
 		 391 aa  49.3  0.00009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2676  ATPase-like, ParA/MinD  36.59 
 
 		 365 aa  48.9  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0710053  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0129  putative septum site determining protein  37.16 
 
 		 364 aa  48.9  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1383  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.75 
 
 		 333 aa  48.9  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0363  septum site determining protein  29.06 
 
 		 348 aa  48.9  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000346854  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13690  hypothetical protein  34.12 
 
 		 350 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00103627  normal  0.200408 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0467  cell division ATPase MinD  22.87 
 
 		 262 aa  48.1  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.543355  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1415  flagellar number regulator  29.49 
 
 		 280 aa  47.4  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.682888  normal  0.589632 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2277  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.93 
 
 		 295 aa  46.2  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.37133 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0591  septum site determining protein  37.88 
 
 		 357 aa  46.2  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2105  septum site-determining protein MinD  23.01 
 
 		 265 aa  46.2  0.0008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000589774  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2393  septum site-determining protein MinD  23.01 
 
 		 265 aa  46.2  0.0008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000328791  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3284  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.27 
 
 		 309 aa  45.8  0.0009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1597  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.93 
 
 		 295 aa  45.8  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2197  chromosome partitioning ATPase  37.5 
 
 		 354 aa  45.8  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.04216  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2235  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  37.5 
 
 		 354 aa  45.8  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0694102  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16660  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.4 
 
 		 288 aa  44.7  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2661  hypothetical protein  30.26 
 
 		 684 aa  44.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3025  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.09 
 
 		 275 aa  44.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.30922  normal  0.446924 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06194  hypothetical protein  27.19 
 
 		 413 aa  44.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2693  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.31 
 
 		 293 aa  44.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2597  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.82 
 
 		 296 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000736548  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2501  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.82 
 
 		 296 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0308577  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0476  hypothetical protein  41.86 
 
 		 369 aa  44.3  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0000368033  normal  0.0256844 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3909  hypothetical protein  34.68 
 
 		 355 aa  44.3  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0842  response regulator receiver protein  30 
 
 		 390 aa  43.9  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.884409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1020  response regulator receiver protein  30.97 
 
 		 420 aa  43.5  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1765  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  38.18 
 
 		 355 aa  43.5  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.608782  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0378  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.27 
 
 		 276 aa  43.1  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2510  hypothetical protein  40.68 
 
 		 360 aa  43.1  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0350  cell division ATPase MinD  27.78 
 
 		 261 aa  43.1  0.007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0402773  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1764  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.62 
 
 		 370 aa  43.1  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.31364 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1509  ParaA family ATPase  21.43 
 
 		 287 aa  42.7  0.008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0144  ATPase-like, ParA/MinD  28.57 
 
 		 338 aa  42.7  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1356  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.3 
 
 		 296 aa  42.7  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0188424  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1287  hypothetical protein  35.71 
 
 		 391 aa  42.7  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.404261  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1034  putative tyrosine-protein kinase injvolved in exopolysaccharide polymerization  29.32 
 
 		 756 aa  42.4  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436669  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>