46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2728 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2728  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  246  8e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1431  hypothetical protein  47.87 
 
 		 135 aa  80.5  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.191025  hitchhiker  0.0000578227 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3125  hypothetical protein  52.71 
 
 		 129 aa  79.3  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.936872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1616  hypothetical protein  40.62 
 
 		 148 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.735089  hitchhiker  0.000199985 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1430  hypothetical protein  52.34 
 
 		 133 aa  71.6  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.731285  hitchhiker  0.000462383 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1184  hypothetical protein  37.68 
 
 		 137 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0429194 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3004  protein of unknown function DUF1236  48.57 
 
 		 131 aa  66.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1291  protein of unknown function DUF1236  46.27 
 
 		 104 aa  65.5  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1202  protein of unknown function DUF1236  46.27 
 
 		 104 aa  66.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.195228  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1500  protein of unknown function DUF1236  50 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.447894  normal  0.683768 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1342  protein of unknown function DUF1236  41.82 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.743835 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5267  protein of unknown function DUF1236  46.27 
 
 		 95 aa  63.9  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3254  protein of unknown function DUF1236  48.57 
 
 		 131 aa  63.9  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.304143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4345  hypothetical protein  34.59 
 
 		 118 aa  63.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0703177 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4727  protein of unknown function DUF1236  51.52 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2752  protein of unknown function DUF1236  40.91 
 
 		 205 aa  60.8  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.348159  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3015  protein of unknown function DUF1236  39.77 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0569  protein of unknown function DUF1236  50 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0136  hypothetical protein  50 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3342  hypothetical protein  47.37 
 
 		 225 aa  57.4  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.799557  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1396  protein of unknown function DUF1236  49.24 
 
 		 132 aa  57  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.955591 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3862  hypothetical protein  42.86 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0791  protein of unknown function DUF1236  52.94 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0234  hypothetical protein  34.06 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.301588  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3677  hypothetical protein  43.26 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.566857  hitchhiker  0.00495452 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0154  protein of unknown function DUF1236  37.25 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.285962 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0372  hypothetical protein  47.76 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6932  protein of unknown function DUF1236  53.78 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.019322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4377  hypothetical protein  50.75 
 
 		 94 aa  51.2  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2585  hypothetical protein  35.34 
 
 		 125 aa  51.6  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.100754 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2242  hypothetical protein  40.58 
 
 		 210 aa  50.8  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.700744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2358  hypothetical protein  33.83 
 
 		 115 aa  50.8  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.318896  normal  0.1272 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3380  hypothetical protein  41.67 
 
 		 221 aa  50.4  0.000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.374175  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3026  hypothetical protein  40.48 
 
 		 221 aa  50.4  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2804  protein of unknown function DUF1236  40 
 
 		 137 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.581612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2581  hypothetical protein  40 
 
 		 137 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0713  hypothetical protein  41.12 
 
 		 139 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2609  protein of unknown function DUF1236  38.98 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.330788  normal  0.659505 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7467  protein of unknown function DUF1236  32.29 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.311345  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0356  hypothetical protein  33.73 
 
 		 122 aa  44.3  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5270  hypothetical protein  39.29 
 
 		 137 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.100526  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3209  hypothetical protein  35.37 
 
 		 125 aa  43.9  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.542631  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2201  OmpA/MotB domain-containing protein  42 
 
 		 264 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.203533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1275  OmpA/MotB domain protein  42.11 
 
 		 227 aa  43.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0265448  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1806  protein of unknown function DUF1236  33.82 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.809056 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5927  protein of unknown function DUF1236  36.43 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>