198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4668 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_2617  transposase, IS4 family protein  97.5 
 
 
113 aa  84  7e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.699065  normal  0.338204 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2631  transposase, IS4 family protein  97.5 
 
 
113 aa  84  7e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0670539  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4715  transposase, IS4 family protein  97.5 
 
 
113 aa  83.6  8e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.54309 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3104  putative transposase  95 
 
 
96 aa  82  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.660761  normal  0.0351076 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4668  transposase, IS4  100 
 
 
40 aa  82.4  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.371042  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4381  transposase, IS4 family protein  97.44 
 
 
113 aa  82  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.537387  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4302  transposase, IS4 family protein  95 
 
 
113 aa  81.6  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.657565  normal  0.592473 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0047  transposase IS4  66.67 
 
 
177 aa  63.2  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.683119  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0621  transposase IS4  66.67 
 
 
177 aa  63.2  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0830  transposase IS4  66.67 
 
 
177 aa  63.2  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.172478  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2019  transposase IS4  66.67 
 
 
177 aa  63.2  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2650  transposase IS4  66.67 
 
 
177 aa  63.2  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8144  transposase IS4 family protein  53.85 
 
 
135 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0528  ISBm1, transposase orfB, interruption-C  68.42 
 
 
79 aa  55.5  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.300316  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0534  ISBm1, transposase orfB  68.42 
 
 
138 aa  56.2  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.162326  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0836  IS4 family transposase  61.54 
 
 
75 aa  55.8  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.504655  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0538  ISBm1, transposase orfB  68.42 
 
 
138 aa  56.2  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2121  hypothetical protein  62.16 
 
 
113 aa  55.5  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4159  transposase IS4 family protein  61.54 
 
 
151 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6136  transposase IS4 family protein  61.54 
 
 
151 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1107  transposase IS4 family protein  61.54 
 
 
151 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665048  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7770  hypothetical protein  63.89 
 
 
255 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.885835  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6118  transposase  65.79 
 
 
254 aa  53.9  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770853 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6168  transposase  65.79 
 
 
254 aa  53.9  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6167  transposase  65.79 
 
 
254 aa  53.9  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6137  transposase  65.79 
 
 
254 aa  53.9  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.876431 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6478  transposase  65.79 
 
 
254 aa  53.9  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.525266 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3433  putative transposase  63.89 
 
 
91 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.520481  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0006  putative transposase  58.97 
 
 
121 aa  53.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1589  hypothetical protein  58.97 
 
 
121 aa  53.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171898  normal  0.419285 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2661  putative transposase  58.97 
 
 
121 aa  53.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.225009  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2809  putative transposase  58.97 
 
 
121 aa  53.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4349  putative transposase  58.97 
 
 
121 aa  53.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.715691 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3828  transposase  57.89 
 
 
260 aa  52.8  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2954  transposase  63.16 
 
 
254 aa  51.6  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2971  transposase  63.16 
 
 
254 aa  51.6  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.213916 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2172  transposase  63.16 
 
 
254 aa  51.6  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10979  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0705  transposase  63.16 
 
 
254 aa  51.6  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0367  transposase  63.16 
 
 
254 aa  51.6  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.350235  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2604  transposase  63.16 
 
 
254 aa  51.6  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.656707  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0677  transposase, IS4  52.63 
 
 
164 aa  51.6  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.321651 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1127  ISBm1, transposase orfB  63.16 
 
 
102 aa  51.2  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9114  transposase protein  56.41 
 
 
122 aa  50.8  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0596  hypothetical protein  57.89 
 
 
116 aa  50.8  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429127  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3451  hypothetical protein  57.89 
 
 
116 aa  50.8  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.1001 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0548  hypothetical protein  56.41 
 
 
128 aa  50.8  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0242  transposase (IS4 family)  55.26 
 
 
171 aa  50.4  0.000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0225  transposase, IS4  50 
 
 
164 aa  49.7  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1053  transposase, IS4  50 
 
 
164 aa  49.7  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.133687  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1352  transposase, IS4  50 
 
 
164 aa  49.7  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.238339  normal  0.0658866 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3066  transposase, IS4  50 
 
 
164 aa  49.7  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.298578  normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0124  transposase (IS4 family)  55.26 
 
 
171 aa  50.1  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0291  transposase (IS4 family)  55.26 
 
 
171 aa  49.7  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  4.34578e-32  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2677  transposase IS4 family protein  51.28 
 
 
142 aa  48.9  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.183927  normal  0.153389 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5939  hypothetical protein  50 
 
 
266 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.754111  normal  0.0437323 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1612  hypothetical protein  53.85 
 
 
253 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.687153  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1798  hypothetical protein  53.85 
 
 
253 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0976503  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1002  hypothetical protein  53.85 
 
 
253 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0160346  normal  0.296217 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0250  transposase IS4 family protein  51.28 
 
 
142 aa  48.9  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00554315  hitchhiker  0.00627953 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6331  hypothetical protein  53.85 
 
 
253 aa  48.9  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3519  putative transposase  58.33 
 
 
251 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.343195  normal  0.0901515 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1015  ISCc1, transposase OrfB  51.28 
 
 
67 aa  48.9  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7095  transposase  53.85 
 
 
102 aa  48.5  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3783  hypothetical protein  70.97 
 
 
252 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.155847 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5636  hypothetical protein  70.97 
 
 
252 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3841  transposase IS4 family protein  70.97 
 
 
167 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01953  ISSod6, transposase  51.28 
 
 
249 aa  47.8  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0375505  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6401  hypothetical protein  58.82 
 
 
251 aa  47  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6448  putative transposase  58.82 
 
 
251 aa  47  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09600  Transposase, IS4  43.59 
 
 
245 aa  47  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1158  transposase  53.85 
 
 
138 aa  47  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1562  ISSod6, transposase  51.28 
 
 
252 aa  46.2  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2909  ISSod6 transposase  51.28 
 
 
252 aa  46.2  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3272  ISSod6, transposase  51.28 
 
 
252 aa  46.2  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0563  hypothetical protein  71.43 
 
 
159 aa  47  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0310  transposase, IS4  48.72 
 
 
210 aa  46.2  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.664621  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1095  transposase, IS4  48.72 
 
 
210 aa  46.2  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.282833 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2822  transposase, IS4  48.72 
 
 
127 aa  46.2  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7671  transposase  53.85 
 
 
131 aa  46.2  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.807085  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1552  transposase, IS4 family protein  53.85 
 
 
252 aa  47  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.185337  normal  0.508935 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21600  transposase  48.72 
 
 
294 aa  46.2  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.507901  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0773  ISSod6, transposase  51.28 
 
 
252 aa  46.2  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2732  ISSod6, transposase  51.28 
 
 
252 aa  46.2  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3478  ISSod6, transposase  51.28 
 
 
252 aa  46.2  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0074  ISSod6, transposase  51.28 
 
 
252 aa  46.2  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0426639  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0097  ISSod6, transposase  51.28 
 
 
252 aa  46.2  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0162  ISSod6, transposase  51.28 
 
 
252 aa  46.2  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.760495  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0180  transposase, IS4  44.74 
 
 
176 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.501437  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0435  transposase, IS4  44.74 
 
 
176 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.264496  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1015  transposase, IS4  44.74 
 
 
176 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.186494 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1934  transposase, IS4  44.74 
 
 
176 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2919  transposase, IS4  48.72 
 
 
210 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3116  transposase, IS4  44.74 
 
 
157 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.206046  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3060  hypothetical protein  43.59 
 
 
119 aa  45.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0481  putative transposase  54.05 
 
 
95 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.988677  normal  0.294669 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7817  transposase  56.41 
 
 
92 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.267815  normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0294  hypothetical protein  62.5 
 
 
76 aa  45.4  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000264556  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1673  IS711, transposase orfB  44.74 
 
 
130 aa  45.1  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.965912  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6121  putative transposase  58.82 
 
 
86 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1675  transposase, IS4 family protein  43.59 
 
 
250 aa  45.1  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000531811  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>