234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3976 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3976  AFG1 family ATPase  100 
 
 		 371 aa  758    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.605596  normal  0.0346423 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3245  AFG1 family ATPase  81.92 
 
 		 365 aa  628  1e-179  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.090067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1903  AFG1-family ATPase  79.18 
 
 		 367 aa  608  1e-173  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1825  AFG1 family ATPase  79.18 
 
 		 367 aa  608  1e-173  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1859  AFG1 family ATPase  77.41 
 
 		 367 aa  595  1e-169  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3496  AFG1 family ATPase  78.08 
 
 		 367 aa  588  1e-167  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.170583  normal  0.858132 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2621  AFG1-like ATPase  77.13 
 
 		 367 aa  588  1e-167  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338976  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2174  AFG1-family ATPase  75.89 
 
 		 366 aa  580  1e-164  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.393147  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2318  AFG1-like ATPase  76.16 
 
 		 365 aa  579  1e-164  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.90089  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2880  AFG1 family ATPase  72.88 
 
 		 366 aa  557  1e-158  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.549688 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2009  hypothetical protein  71.23 
 
 		 365 aa  554  1e-157  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.314691 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4652  AFG1-like ATPase  64.21 
 
 		 383 aa  498  1e-140  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.49278  normal  0.23421 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1487  AFG1 family ATPase  64.38 
 
 		 365 aa  498  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00037297 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1744  AFG1 family ATPase  64.66 
 
 		 365 aa  499  1e-140  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00067746 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1272  hypothetical protein  64.11 
 
 		 365 aa  495  1e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.723813 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1031  AFG1-like ATPase  64.38 
 
 		 365 aa  497  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28938  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1511  AFG1 family ATPase  64.38 
 
 		 365 aa  497  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.30464  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1100  AFG1-family ATPase  63.29 
 
 		 365 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.875706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2553  ATPase, AFG1 type  64.38 
 
 		 365 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.580202  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2809  putative ATPase, AFG1-like  63.56 
 
 		 365 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.735018  normal  0.0621067 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1393  AFG1 family ATPase  63.84 
 
 		 365 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1433  AFG1 family ATPase  63.56 
 
 		 365 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0379447  normal  0.0822065 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1049  ATPase, AFG1 type  63.56 
 
 		 366 aa  489  1e-137  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.235726  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1193  AFG1-family ATPase  62.47 
 
 		 365 aa  489  1e-137  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.832181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1927  ATPase, AFG1 type  63.56 
 
 		 365 aa  489  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.74358  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1643  AFG1-family ATPase  63.01 
 
 		 365 aa  489  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233451  normal  0.0874799 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1003  ATPase, AFG1 type  63.56 
 
 		 366 aa  489  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.064269  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1495  ATPase, AFG1 type  63.56 
 
 		 366 aa  489  1e-137  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0163  ATPase, AFG1 type  63.56 
 
 		 366 aa  489  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1753  AFG1 family ATPase  63.56 
 
 		 366 aa  489  1e-137  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1775  AFG1 family ATPase  63.56 
 
 		 366 aa  489  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420148  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2044  AFG1-like ATPase  61.64 
 
 		 365 aa  485  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.136156  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2047  AFG1-like ATPase  61.64 
 
 		 365 aa  480  1e-134  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0831727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1718  AFG1 family ATPase  61.64 
 
 		 365 aa  476  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0843  AFG1 family ATPase  59.28 
 
 		 367 aa  453  1.0000000000000001e-126  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0995  AFG1-family ATPase  58.73 
 
 		 367 aa  450  1e-125  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000410235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2541  AFG1-family ATPase  52.96 
 
 		 371 aa  372  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.538898  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2856  AFG1-like ATPase  51.85 
 
 		 371 aa  367  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.555037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0895  AFG1 family ATPase  49.01 
 
 		 364 aa  326  3e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2697  AFG1 family ATPase  46.46 
 
 		 377 aa  324  2e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5010  hypothetical protein  49.01 
 
 		 364 aa  322  5e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.991717  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57650  hypothetical protein  49.01 
 
 		 364 aa  322  6e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.994085 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4428  ATPase, putative  47.65 
 
 		 364 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.807531  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4122  AFG1-like ATPase  46.69 
 
 		 364 aa  317  2e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3295  AFG1 family ATPase  49.31 
 
 		 368 aa  315  6e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000879421  hitchhiker  0.00125364 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2208  AFG1-like ATPase  45.33 
 
 		 391 aa  314  9.999999999999999e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0336644  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4412  AFG1 family ATPase  47.08 
 
 		 364 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.744432  normal  0.254961 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1312  AFG1-family ATPase  47.08 
 
 		 364 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4537  AFG1 family ATPase  46.8 
 
 		 364 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13020  hypothetical protein  46.56 
 
 		 374 aa  313  2.9999999999999996e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.643406  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4698  AFG1-like ATPase  46.81 
 
 		 364 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00399589  normal  0.061499 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3270  AFG1 family ATPase  47.49 
 
 		 386 aa  312  4.999999999999999e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000167889  hitchhiker  0.000173764 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3596  AFG1 family ATPase  46.07 
 
 		 367 aa  312  4.999999999999999e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000179284  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0677  AFG1 family ATPase  47.49 
 
 		 386 aa  311  9e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000859941  hitchhiker  0.00165359 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0691  AFG1 family ATPase  47.21 
 
 		 388 aa  311  9e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000890952  hitchhiker  0.0000137092 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3361  AFG1 family ATPase  45.28 
 
 		 370 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000732022  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0701  AFG1 family ATPase  47.5 
 
 		 370 aa  310  4e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000196074  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0731  AFG1 family ATPase  47.5 
 
 		 370 aa  309  4e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000798254  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0505  AFG1-like ATPase  46.41 
 
 		 370 aa  309  5e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000013161  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3653  AFG1 family ATPase  47.78 
 
 		 370 aa  309  5e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000093907  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0722  AFG1-family ATPase  47.5 
 
 		 370 aa  309  5.9999999999999995e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000182538  hitchhiker  0.000146709 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3941  hypothetical protein  47.06 
 
 		 370 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2401  AFG1 family ATPase  44.85 
 
 		 366 aa  305  7e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.125095 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1591  AFG1 family ATPase  47.31 
 
 		 360 aa  305  8.000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.594153  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0919  AFG1 family ATPase  47.92 
 
 		 339 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.961251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3165  hypothetical protein  46.03 
 
 		 393 aa  303  4.0000000000000003e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.885121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0551  AFG1-like ATPase  45.51 
 
 		 368 aa  302  6.000000000000001e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000457757  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0743  AFG1 family ATPase  46.5 
 
 		 370 aa  301  9e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000113229  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4223  AFG1 family ATPase  45.3 
 
 		 368 aa  298  8e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000201844  hitchhiker  0.000390213 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0746  AFG1 family ATPase  44.85 
 
 		 368 aa  297  2e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000022417  normal  0.0814032 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3072  hypothetical protein  45.4 
 
 		 369 aa  296  6e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000740728  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03176  ATPase, AFG1 family protein  42.86 
 
 		 365 aa  292  7e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0954  AFG1 family ATPase  45.92 
 
 		 360 aa  289  5.0000000000000004e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.31762  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0102  hypothetical protein  44.17 
 
 		 367 aa  289  6e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000023398  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4344  AFG1 family ATPase  43.02 
 
 		 371 aa  289  7e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.659976  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0334  AFG1 family ATPase  50.84 
 
 		 372 aa  288  9e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004512  putative ATPase  42.46 
 
 		 367 aa  288  1e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000122216  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00880  hypothetical protein  41.9 
 
 		 367 aa  283  3.0000000000000004e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2878  AFG1 family ATPase  41.32 
 
 		 372 aa  278  1e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.067299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0298  AFG1-family ATPase  42.94 
 
 		 383 aa  275  7e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000565805  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1135  hypothetical protein  42.25 
 
 		 375 aa  274  2.0000000000000002e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000114731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0523  AFG1 family ATPase  42.25 
 
 		 375 aa  274  2.0000000000000002e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000232389  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0458  ATPase, AFG1 family protein  42.25 
 
 		 375 aa  274  2.0000000000000002e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000213862  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0407  ATPase  38.86 
 
 		 392 aa  273  3e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3798  AFG1-family ATPase  42.38 
 
 		 376 aa  272  6e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000375047  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1767  AFG1 family ATPase  38.57 
 
 		 365 aa  272  8.000000000000001e-72  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2665  hypothetical protein  42.62 
 
 		 368 aa  270  2e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00155012  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1406  AFG1 family ATPase  39.33 
 
 		 372 aa  270  2.9999999999999997e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0829352 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2359  AFG1-family ATPase  42.58 
 
 		 358 aa  268  8e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3640  AFG1-family ATPase  41.3 
 
 		 376 aa  267  2e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0569436  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0291  AFG1-family ATPase  40.86 
 
 		 383 aa  267  2e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00126781  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0631  AFG1 family ATPase  40.61 
 
 		 388 aa  259  4e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03824  ATPase  40.38 
 
 		 361 aa  256  4e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1094  AFG1-like ATPase  36.44 
 
 		 373 aa  256  4e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.432883 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0474  AFG1 family ATPase  41.01 
 
 		 395 aa  255  8e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.756994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1288  AFG1-like ATPase protein  36.24 
 
 		 373 aa  255  8e-67  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.444038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3537  ATPase, AFG1 family  40.91 
 
 		 374 aa  255  9e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000892623  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3706  AFG1 family ATPase  40.91 
 
 		 374 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00969037  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03043  hypothetical protein  45.12 
 
 		 375 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00168064  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0474  AFG1 family ATPase  45.12 
 
 		 375 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000625697  normal  0.126668 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>