More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3033 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3033  glutamine amidotransferase, class-II  100 
 
 		 302 aa  624  1e-178  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.572778 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0167  glutamine amidotransferase class-II  72.43 
 
 		 302 aa  447  1.0000000000000001e-124  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5919  glutamine amidotransferase class-II  70.67 
 
 		 302 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116128  normal  0.458284 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0457  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  63.12 
 
 		 298 aa  394  1e-109  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.598323  normal  0.402222 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1699  glutamine amidotransferase class-II  62 
 
 		 296 aa  376  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2499  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  55.78 
 
 		 305 aa  337  9.999999999999999e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0705172  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2583  glutamine amidotransferase, class-II protein  48.5 
 
 		 306 aa  298  1e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0230258  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2274  glutamine amidotransferase, class-II  48.17 
 
 		 306 aa  297  1e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0107042 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2248  glutamine amidotransferase class-II  49.5 
 
 		 301 aa  297  1e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280725 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3467  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  47.51 
 
 		 299 aa  293  3e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.836717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1346  glutamine amidotransferase, class-II  45.67 
 
 		 299 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1938  glutamine amidotransferase class-II  47.68 
 
 		 311 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.210707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1656  glutamine amidotransferase class-II  48.01 
 
 		 311 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.670859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4695  glutamine amidotransferase class-II  47.02 
 
 		 299 aa  283  3.0000000000000004e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.903048 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1575  glutamine amidotransferase class-II  47.35 
 
 		 316 aa  281  1e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1942  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  48.68 
 
 		 297 aa  281  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.738445 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4810  glutamine amidotransferase class-II  47.35 
 
 		 297 aa  277  2e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.917981  hitchhiker  0.00206329 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1138  glutamine amidotransferase, class-II  45.03 
 
 		 298 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.16804 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2632  glutamine amidotransferase class-II  44.98 
 
 		 299 aa  262  4e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5638  glutamine amidotransferase class-II  43.85 
 
 		 301 aa  253  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.52916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1870  putative glutamine amidotransferase  44.59 
 
 		 308 aa  252  5.000000000000001e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117624  normal  0.828633 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3291  glutamine amidotransferase class-II  45.57 
 
 		 301 aa  251  1e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6575  glutamine amidotransferase class-II  42.86 
 
 		 302 aa  250  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0505165 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6008  glutamine amidotransferase class-II  44.26 
 
 		 301 aa  247  2e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.362161  decreased coverage  0.00354269 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5749  amidophosphoribosyltransferase  44.41 
 
 		 301 aa  246  2e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3524  glutamine amidotransferase class-II  43.05 
 
 		 302 aa  244  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0234475 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1299  glutamine amidotransferase, class-II  41.2 
 
 		 302 aa  235  9e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0375941  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5510  glutamine amidotransferase, class-II  41.2 
 
 		 302 aa  230  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.623211  normal  0.154748 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4806  glutamine amidotransferase class-II  41.97 
 
 		 298 aa  229  5e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5261  glutamine amidotransferase, class-II  39.54 
 
 		 298 aa  220  3e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.228434 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4893  glutamine amidotransferase, class-II  39.54 
 
 		 298 aa  219  6e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4982  glutamine amidotransferase, class-II  39.54 
 
 		 298 aa  219  6e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1448  amidophosphoribosyltransferase  27.93 
 
 		 474 aa  84.3  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0230  amidophosphoribosyltransferase  31.05 
 
 		 463 aa  80.1  0.00000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0884272  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3061  amidophosphoribosyltransferase  29.83 
 
 		 629 aa  79.3  0.00000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1100  glutamate synthase alpha subunit  31.96 
 
 		 553 aa  79.3  0.00000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.154608 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3049  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  33.33 
 
 		 604 aa  79.3  0.00000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.749851  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2184  amidophosphoribosyltransferase  28.03 
 
 		 487 aa  78.2  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1249  amidophosphoribosyltransferase  25.95 
 
 		 488 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.917797  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0731  amidophosphoribosyltransferase  28.42 
 
 		 478 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0724  amidophosphoribosyltransferase  30.26 
 
 		 500 aa  77  0.0000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00225283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1632  amidophosphoribosyltransferase  31.15 
 
 		 469 aa  77  0.0000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1740  glutamate synthase alpha subunit domain protein  27.12 
 
 		 659 aa  76.6  0.0000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.627915  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0007  amidophosphoribosyltransferase  32.91 
 
 		 487 aa  75.9  0.0000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4571  amidophosphoribosyltransferase  29.8 
 
 		 468 aa  75.5  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.470676  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1408  amidophosphoribosyltransferase  30.63 
 
 		 446 aa  75.5  0.000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2118  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase  39.8 
 
 		 605 aa  73.2  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.710102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1000  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  30.86 
 
 		 602 aa  73.6  0.000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2822  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  33.04 
 
 		 610 aa  73.2  0.000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1419  amidophosphoribosyltransferase  26.53 
 
 		 461 aa  73.2  0.000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0127132  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04200  amidophosphoribosyltransferase  26.85 
 
 		 496 aa  72.8  0.000000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.289108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3212  amidophosphoribosyltransferase  30.19 
 
 		 463 aa  72  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.903412  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0980  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  27.78 
 
 		 599 aa  71.6  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1778  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  31.45 
 
 		 602 aa  71.6  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.285931  normal  0.0291099 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01750  amidophosphoribosyltransferase  29.66 
 
 		 482 aa  72  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.674101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2365  amidophosphoribosyltransferase  28.18 
 
 		 474 aa  72.4  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0276  amidophosphoribosyltransferase  25.68 
 
 		 471 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1147  amidophosphoribosyltransferase  29.61 
 
 		 478 aa  70.9  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.218005  normal  0.314166 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1778  hypothetical protein  27.87 
 
 		 475 aa  71.2  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000929805  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1766  amidophosphoribosyltransferase  30.22 
 
 		 488 aa  70.9  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0501857 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1389  amidophosphoribosyltransferase  27.39 
 
 		 479 aa  70.1  0.00000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.254172  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1475  amidophosphoribosyltransferase  28.42 
 
 		 472 aa  69.7  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00831  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  33.04 
 
 		 610 aa  70.1  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0468  amidophosphoribosyltransferase  27.22 
 
 		 456 aa  70.1  0.00000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.350158  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0228  amidophosphoribosyltransferase  27.54 
 
 		 478 aa  70.1  0.00000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.629689  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0085  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  31.01 
 
 		 611 aa  69.7  0.00000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.800313  normal  0.506708 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0282  amidophosphoribosyltransferase  27.22 
 
 		 471 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0267  amidophosphoribosyltransferase  27.22 
 
 		 471 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0270  amidophosphoribosyltransferase  27.22 
 
 		 471 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0295  amidophosphoribosyltransferase  27.22 
 
 		 471 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.312701  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4979  amidophosphoribosyltransferase  27.22 
 
 		 471 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0327  amidophosphoribosyltransferase  27.22 
 
 		 471 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4354  amidophosphoribosyltransferase  28.72 
 
 		 484 aa  69.3  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.463043 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0727  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  33.88 
 
 		 602 aa  69.3  0.00000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1511  amidophosphoribosyltransferase  30.77 
 
 		 466 aa  69.3  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.409813  normal  0.0292739 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0841  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  33.33 
 
 		 608 aa  68.9  0.00000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.121546  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0189  amidophosphoribosyltransferase  28.75 
 
 		 445 aa  68.6  0.0000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0953  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.85 
 
 		 599 aa  68.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.590452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2072  amidophosphoribosyltransferase  30.89 
 
 		 506 aa  68.6  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0227  amidophosphoribosyltransferase  28.75 
 
 		 445 aa  68.6  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001643  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase (isomerizing)  32.14 
 
 		 610 aa  67.8  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0244363  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0439  amidophosphoribosyltransferase  28.48 
 
 		 459 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4217  amidophosphoribosyltransferase  29.02 
 
 		 494 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0206  amidophosphoribosyltransferase  28.75 
 
 		 445 aa  67.8  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0095  amidophosphoribosyltransferase  29.94 
 
 		 476 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3743  amidophosphoribosyltransferase  30.77 
 
 		 466 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189021 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0174  amidophosphoribosyltransferase  28.67 
 
 		 445 aa  68.2  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.838457  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4178  amidophosphoribosyltransferase  29.02 
 
 		 494 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2095  amidophosphoribosyltransferase  30.82 
 
 		 480 aa  67.8  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.778059 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0522  amidophosphoribosyltransferase  26.58 
 
 		 465 aa  67.8  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1693  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  29.27 
 
 		 600 aa  67  0.0000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.457589  normal  0.0574833 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0368  amidophosphoribosyltransferase  27.85 
 
 		 471 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1727  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  27.61 
 
 		 599 aa  67  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.20079  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0309  amidophosphoribosyltransferase  28.8 
 
 		 473 aa  67.4  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0008  amidophosphoribosyltransferase  30.38 
 
 		 467 aa  67.4  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0324  amidophosphoribosyltransferase  27.85 
 
 		 471 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4361  amidophosphoribosyltransferase  27.13 
 
 		 485 aa  67  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4206  amidophosphoribosyltransferase  27.13 
 
 		 485 aa  67  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.975393  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3302  D-fructose-6-phosphate amidotransferase  29.6 
 
 		 608 aa  66.6  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0396  amidophosphoribosyltransferase  27.78 
 
 		 459 aa  67  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>