36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1648 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_1648  hypothetical protein  100 
 
 		 125 aa  258  2e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0644995  normal  0.560402 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5237  hypothetical protein  60.16 
 
 		 131 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1374  hypothetical protein  57.72 
 
 		 128 aa  147  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0189218 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1162  hypothetical protein  57.85 
 
 		 131 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.485481  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1353  hypothetical protein  56.2 
 
 		 131 aa  143  8.000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0872  hypothetical protein  51.24 
 
 		 131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.797688  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0902  hypothetical protein  49.59 
 
 		 126 aa  125  3e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00879275  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3474  hypothetical protein  50 
 
 		 128 aa  118  3e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3318  hypothetical protein  50 
 
 		 128 aa  118  3e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4655  hypothetical protein  49.59 
 
 		 131 aa  118  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0800268  normal  0.362221 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3454  hypothetical protein  50.88 
 
 		 146 aa  117  3.9999999999999996e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3333  hypothetical protein  50.88 
 
 		 155 aa  117  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3714  hypothetical protein  50.41 
 
 		 133 aa  117  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.387617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3195  hypothetical protein  50.88 
 
 		 155 aa  117  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0927  hypothetical protein  49.59 
 
 		 128 aa  117  7.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4055  hypothetical protein  50 
 
 		 131 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.144766  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0269  hypothetical protein  44 
 
 		 126 aa  114  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.106589  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0771  hypothetical protein  49.17 
 
 		 130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0529707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2234  hypothetical protein  46.77 
 
 		 128 aa  112  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0654  hypothetical protein  49.18 
 
 		 127 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1653  hypothetical protein  45.9 
 
 		 131 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0864916  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3027  hypothetical protein  46.62 
 
 		 138 aa  108  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0783  hypothetical protein  45.9 
 
 		 146 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0926  hypothetical protein  45.9 
 
 		 128 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0722  hypothetical protein  47.54 
 
 		 130 aa  106  9.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.540678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1058  hypothetical protein  44.8 
 
 		 129 aa  105  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.118135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1126  hypothetical protein  46.72 
 
 		 135 aa  104  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0455232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1692  hypothetical protein  46.72 
 
 		 135 aa  103  6e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0506341 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2011  hypothetical protein  46.72 
 
 		 135 aa  103  7e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.0066698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0845  hypothetical protein  43.44 
 
 		 148 aa  103  7e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4552  hypothetical protein  44 
 
 		 129 aa  100  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.362228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2142  hypothetical protein  47.97 
 
 		 141 aa  87.8  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.011692  normal  0.140922 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03788  hypothetical protein  42.86 
 
 		 131 aa  87  7e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2081  Amidase  38.39 
 
 		 546 aa  50.8  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2780  Amidase  41.51 
 
 		 579 aa  48.5  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.222213  hitchhiker  0.0000220235 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17220  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  31.58 
 
 		 535 aa  43.9  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>