243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0372 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0372  allophanate hydrolase subunit 1  100 
 
 
249 aa  491  9.999999999999999e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.701967  normal  0.529517 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0478  allophanate hydrolase, subunit 1  46.12 
 
 
229 aa  180  2e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2148  hypothetical protein TIGR00370  35.64 
 
 
237 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3088  conserved hypothetical protein TIGR00370  35.64 
 
 
237 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3395  allophanate hydrolase subunit 1  37.82 
 
 
240 aa  159  4e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0629739 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2810  hypothetical protein  35.15 
 
 
237 aa  157  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0710  Allophanate hydrolase subunit 1  35.59 
 
 
246 aa  157  2e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00179377  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3121  hypothetical protein  34.65 
 
 
237 aa  156  3e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.785464  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2882  hypothetical protein  34.65 
 
 
237 aa  156  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0696288  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3097  hypothetical protein  34.65 
 
 
237 aa  156  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.12026  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3102  conserved hypothetical protein TIGR00370  34.65 
 
 
237 aa  156  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1136  Allophanate hydrolase subunit 1  50.68 
 
 
218 aa  156  3e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2849  hypothetical protein  34.65 
 
 
237 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2874  allophanate hydrolase subunit 1  34.65 
 
 
237 aa  155  6e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.480079  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1957  Allophanate hydrolase subunit 1  45.41 
 
 
218 aa  154  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.360214  hitchhiker  0.00204684 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2336  Allophanate hydrolase subunit 1  42.25 
 
 
230 aa  154  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0736  allophanate hydrolase, subunit 1  42.05 
 
 
218 aa  154  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00671  predicted enzyme subunit  42.49 
 
 
218 aa  153  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2925  Allophanate hydrolase subunit 1  42.49 
 
 
218 aa  153  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.401511  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0801  allophanate hydrolase, subunit 1  42.49 
 
 
218 aa  153  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0935394  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0759  allophanate hydrolase, subunit 1  42.49 
 
 
218 aa  153  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00660  hypothetical protein  42.49 
 
 
218 aa  153  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0772  hypothetical protein  42.93 
 
 
218 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.984819 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3120  conserved hypothetical protein TIGR00370  34.65 
 
 
237 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000284554  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0820  hypothetical protein  42.93 
 
 
218 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0759  hypothetical protein  42.93 
 
 
218 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0628  allophanate hydrolase, subunit 1  42.49 
 
 
218 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0835  hypothetical protein  42.93 
 
 
218 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.473252  hitchhiker  0.00249119 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0869  hypothetical protein  42.41 
 
 
218 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.360014 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0521  Allophanate hydrolase subunit 1  39.75 
 
 
253 aa  152  4e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2944  allophanate hydrolase subunit 1  42.49 
 
 
218 aa  152  5e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1950  Allophanate hydrolase subunit 1  39.22 
 
 
233 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000391255  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0726  allophanate hydrolase, subunit 1  42.49 
 
 
218 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.385331  normal  0.445001 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58530  hypothetical protein  43.75 
 
 
225 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1270  Allophanate hydrolase subunit 1  34.8 
 
 
221 aa  150  3e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1145  Allophanate hydrolase subunit 1  28.99 
 
 
229 aa  149  4e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.110827  normal  0.406689 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02000  conserved hypothetical protein TIGR00370  39.8 
 
 
242 aa  149  4e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.620258 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1172  hypothetical protein  42.36 
 
 
243 aa  149  5e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2825  allophanate hydrolase subunit 1  38.75 
 
 
240 aa  149  6e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.140549  normal  0.0247911 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0178  Allophanate hydrolase subunit 1  35.17 
 
 
242 aa  148  8e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5815  allophanate hydrolase subunit 1  41.08 
 
 
244 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.100836  normal  0.0693408 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1666  hypothetical protein  33 
 
 
244 aa  146  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.947071  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1700  hypothetical protein  33 
 
 
244 aa  146  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1828  Allophanate hydrolase subunit 1  37.21 
 
 
227 aa  146  3e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.700808  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4367  Allophanate hydrolase subunit 1  44.62 
 
 
215 aa  146  4.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0062  hypothetical protein  44.33 
 
 
216 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1214  allophanate hydrolase subunit 1  42.41 
 
 
218 aa  145  5e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.491442  normal  0.0321852 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3311  hypothetical protein  39.74 
 
 
218 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0449  hypothetical protein  39.74 
 
 
256 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2981  hypothetical protein  39.74 
 
 
218 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78206  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2111  hypothetical protein  39.74 
 
 
218 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0266  putative allophanate hydrolase, subunit 1  39.74 
 
 
256 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.251765  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3367  putative allophanate hydrolase, subunit 1  39.74 
 
 
218 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0254  putative allophanate hydrolase, subunit 1  39.74 
 
 
256 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2922  Allophanate hydrolase subunit 1  41.27 
 
 
219 aa  144  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.820056  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2171  hypothetical protein  43.3 
 
 
215 aa  144  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.452484  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2903  allophanate hydrolase subunit 1  42.22 
 
 
217 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.282421 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1226  Allophanate hydrolase subunit 1  47.83 
 
 
218 aa  144  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3379  allophanate hydrolase subunit 1  38.65 
 
 
234 aa  144  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.332563  normal  0.85037 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0230  hypothetical protein  39.66 
 
 
259 aa  143  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3032  allophanate hydrolase subunit 1  41.81 
 
 
218 aa  142  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2062  allophanate hydrolase subunit 1  34.17 
 
 
233 aa  142  4e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.206067  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0087  hypothetical protein  42.78 
 
 
216 aa  142  5e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595386  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2958  Allophanate hydrolase subunit 1  34.91 
 
 
242 aa  142  5e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2636  hypothetical protein  36.64 
 
 
242 aa  142  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.24477  decreased coverage  0.0000373796 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2374  Allophanate hydrolase subunit 1  41.75 
 
 
215 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.635342 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1498  allophanate hydrolase subunit 1  37.71 
 
 
227 aa  140  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.403347  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1974  Allophanate hydrolase subunit 1  41.75 
 
 
215 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2224  allophanate hydrolase subunit 1  40.53 
 
 
231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1595  allophanate hydrolase subunit 1  29.96 
 
 
243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4576  allophanate hydrolase subunit 1  42.13 
 
 
229 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.179191  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3110  Allophanate hydrolase subunit 1  45.71 
 
 
218 aa  139  3e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3741  Allophanate hydrolase subunit 1  40.89 
 
 
217 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.456378 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12460  allophanate hydrolase subunit 1  45.45 
 
 
224 aa  139  3.9999999999999997e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.460318  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5124  hypothetical protein  40.87 
 
 
225 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1313  allophanate hydrolase subunit 1  42.03 
 
 
228 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.837273  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0008  allophanate hydrolase subunit 1  44.37 
 
 
228 aa  137  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00137026 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2832  hypothetical protein  35.34 
 
 
242 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.180643  normal  0.812146 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1255  allophanate hydrolase subunit 1  36.6 
 
 
218 aa  137  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0342486  normal  0.816656 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1814  Allophanate hydrolase subunit 1  37.55 
 
 
241 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.21016  normal  0.134293 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0195  hypothetical protein  43.65 
 
 
217 aa  136  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3548  allophanate hydrolase subunit 1  34.2 
 
 
234 aa  135  7.000000000000001e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0988  allophanate hydrolase subunit 1  30.86 
 
 
238 aa  135  8e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0659374  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4097  allophanate hydrolase subunit 1  40.87 
 
 
228 aa  135  8e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0199778  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3876  allophanate hydrolase subunit 1  42.03 
 
 
231 aa  135  8e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.348545  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1534  allophanate hydrolase subunit 1  37.12 
 
 
241 aa  135  9e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.107979 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3056  allophanate hydrolase subunit 1  40.97 
 
 
218 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0256997 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6384  hypothetical protein  40.97 
 
 
218 aa  133  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2624  hypothetical protein  34.91 
 
 
249 aa  132  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.288603 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1527  hypothetical protein  32.99 
 
 
246 aa  133  3e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1713  hypothetical protein  32.65 
 
 
246 aa  132  3.9999999999999996e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.115565  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1167  allophanate hydrolase subunit 1  45.71 
 
 
218 aa  132  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000046539  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1115  hypothetical protein  45.71 
 
 
218 aa  132  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000190238  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1900  hypothetical protein  32.49 
 
 
246 aa  132  6e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3082  hypothetical protein  40.09 
 
 
218 aa  132  6e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2948  allophanate hydrolase subunit 1  40.09 
 
 
218 aa  132  6e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.564581 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2423  hypothetical protein  40.53 
 
 
218 aa  131  9e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3037  hypothetical protein  40.53 
 
 
218 aa  131  9e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.998817  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4346  allophanate hydrolase subunit 1  40 
 
 
201 aa  131  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1501  hypothetical protein  34.48 
 
 
244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0895527 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>