25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_6340 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_6340  hypothetical protein  100 
 
 		 65 aa  135  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.932896  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1562  hypothetical protein  88.89 
 
 		 306 aa  82.8  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.252328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1162  hypothetical protein  88.89 
 
 		 304 aa  82.4  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2176  hypothetical protein  62.3 
 
 		 306 aa  70.9  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.19482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2404  hypothetical protein  62.3 
 
 		 306 aa  70.5  0.000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.839065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0933  hypothetical protein  62.3 
 
 		 284 aa  70.5  0.000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6035  hypothetical protein  68.89 
 
 		 316 aa  67.4  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2871  hypothetical protein  55.74 
 
 		 306 aa  64.3  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.199374  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1199  hypothetical protein  64.44 
 
 		 308 aa  64.3  0.0000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000000053087  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0874  hypothetical protein  60 
 
 		 330 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.801729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4370  hypothetical protein  62.22 
 
 		 307 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0962975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0904  hypothetical protein  60 
 
 		 330 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472436  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0425  hypothetical protein  60 
 
 		 330 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0439  hypothetical protein  70.73 
 
 		 305 aa  58.5  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0688498  normal  0.363441 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1976  hypothetical protein  62.22 
 
 		 307 aa  58.2  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0784  hypothetical protein  63.41 
 
 		 84 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0348  hypothetical protein  63.41 
 
 		 304 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.975914  normal  0.279252 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4611  hypothetical protein  52.54 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.626183  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1880  hypothetical protein  63.41 
 
 		 311 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.118335  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1991  hypothetical protein  63.41 
 
 		 311 aa  55.1  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.061979  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0570  hypothetical protein  59.52 
 
 		 199 aa  52.4  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4769  hypothetical protein  56.1 
 
 		 307 aa  51.2  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.184998  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3364  hypothetical protein  56.1 
 
 		 315 aa  51.2  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.041289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6591  hypothetical protein  56.1 
 
 		 318 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1964  hypothetical protein  68.57 
 
 		 305 aa  50.1  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0455905 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>