More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3626 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3626  ferric uptake regulator, Fur family  100 
 
 		 149 aa  306  5e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4458  ferric uptake regulator family protein  41.18 
 
 		 141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.342841  hitchhiker  0.00667855 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3389  ferric uptake regulator family protein  42.36 
 
 		 145 aa  110  5e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.261962  normal  0.0261677 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1469  ferric uptake regulator, Fur family  39.71 
 
 		 130 aa  110  8.000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0185274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3564  ferric uptake regulator family protein  42.86 
 
 		 137 aa  107  5e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.201475 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2000  ferric uptake regulator, Fur family  43.26 
 
 		 127 aa  103  6e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0519  ferric uptake regulator family protein  41.43 
 
 		 135 aa  95.1  3e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.639512  normal  0.494415 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1472  ferric uptake regulator, Fur family  32.87 
 
 		 131 aa  78.2  0.00000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000290418  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2295  ferric uptake regulator family protein  34.69 
 
 		 159 aa  77  0.00000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2294  ferric uptake regulator, Fur family  30.66 
 
 		 123 aa  75.9  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1144  ferric uptake regulator family protein  33.77 
 
 		 137 aa  73.6  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2401  ferric uptake regulator, Fur family  30.6 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0170  ferric uptake regulator, Fur family  28.36 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2644  ferric uptake regulator family protein  30.71 
 
 		 146 aa  68.2  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1388  ferric uptake regulator, Fur family  32.14 
 
 		 136 aa  67.8  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00327608  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2141  ferric uptake regulator family protein  33.81 
 
 		 137 aa  67.4  0.00000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1612  ferric uptake regulator family protein  26.87 
 
 		 136 aa  67  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.339502  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1646  ferric-uptake regulator  26.87 
 
 		 136 aa  67  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.200156  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1120  FUR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.224553  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4132  ferric uptake regulator family protein  27.07 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3007  ferric uptake regulator family protein  27.07 
 
 		 137 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.830794  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1228  ferric uptake regulator family protein  32.62 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2524  ferric uptake regulator, Fur family  31.03 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.568134  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0352  ferric uptake regulator, Fur family  30.5 
 
 		 131 aa  63.5  0.0000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.541343 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3674  ferric uptake regulator family protein  32.35 
 
 		 129 aa  63.5  0.0000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0279  ferric uptake regulator family protein  26.12 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.666463  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2612  ferric uptake regulator, Fur family  25.9 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.539435  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1562  ferric uptake regulator, Fur family  28.87 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1892  Fur family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4359  FUR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 137 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.291339  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4181  FUR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 137 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4019  FUR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 137 aa  62  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.642016  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4029  FUR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 137 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742096  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08960  ferric uptake regulator, Fur family  27.46 
 
 		 134 aa  62  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4503  FUR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 137 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.606254  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4301  transcriptional regulator, Fur family  26.32 
 
 		 137 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.08025e-17 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1140  ferric uptake regulator family protein  31.85 
 
 		 152 aa  62  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4413  transcriptional regulator, Fur family  26.32 
 
 		 137 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000236646  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0839  transcriptional regulator, Fur family  26.32 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.442755  hitchhiker  0.000379655 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4397  transcriptional regulator, Fur family  26.32 
 
 		 137 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.108592  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4185  ferric uptake regulator, Fur family  27.01 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.421488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0726  ferric uptake regulator, Fur family  31.51 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.787789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0141  ferric uptake regulator, Fur family  28.68 
 
 		 133 aa  60.5  0.000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.896296  normal  0.23625 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0284  ferric uptake regulator family protein  28.47 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0246387 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1379  ferric uptake regulation protein Fur  29.63 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.404925  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2251  ferric uptake regulator family protein  28.97 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.409228  normal  0.662099 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1623  ferric uptake regulator, Fur family  32.12 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2366  ferric uptake regulator, Fur family  28.99 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.437919 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1279  transcriptional regulator, Fur family  28.47 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000471651  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0543  ferric uptake regulator, Fur family  26.81 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.70942 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4078  ferric uptake regulator, Fur family  28.57 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000739269  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2189  ferric uptake regulator, Fur family  25 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000532241  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_571  transcriptional regulator, Fur family  28.47 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1564  ferric uptake regulator family protein  27.21 
 
 		 167 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0495536  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3209  ferric uptake regulator family protein  31.03 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.829925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1879  ferric uptake regulator, Fur family  32.86 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00751157  normal  0.013308 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1746  FUR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2477  ferric uptake regulator family protein  31.16 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0153326  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1995  ferric uptake regulator, Fur family  29.08 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.134138  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2445  ferric uptake regulator family protein  28.15 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164453  normal  0.662654 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0772  ferric uptake regulator family protein  28.87 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230128  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1064  ferric uptake regulator family protein  28.17 
 
 		 152 aa  57  0.00000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193805  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2029  FUR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 150 aa  57  0.00000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1577  ferric uptake regulator, Fur family  27.78 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0630  FUR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2300  ferric uptake regulator, Fur family  26.67 
 
 		 167 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.194588  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2982  ferric uptake regulator, Fur family  26.39 
 
 		 154 aa  57  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000154751  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2388  ferric uptake regulator, Fur family  26.67 
 
 		 167 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1415  ferric uptake regulator family protein  29.71 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.0000000000000163802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2043  ferric uptake regulator family protein  27.74 
 
 		 144 aa  57  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1061  FUR family transcriptional regulator  26 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.304588  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1373  ferric uptake regulator, Fur family  25 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000536701  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3496  ferric uptake regulator, Fur family  32.41 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0135  ferric uptake regulator, Fur family  24.48 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000000297915  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3452  ferric uptake regulator family protein  31.47 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.604214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4742  ferric uptake regulator, Fur family  28.79 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1586  ferric-uptake regulator  26.17 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.501887  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1364  ferric uptake regulator, Fur family  28.86 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1648  ferric uptake regulator family protein  31.72 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.499744 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0885  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  25.33 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0684  ferric uptake regulator family protein  30.66 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.564127  normal  0.74996 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1233  ferric uptake regulator family protein  27.86 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.272827 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2626  ferric uptake regulator, Fur family  26.28 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0754  ferric uptake regulator family protein  25.17 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.354602  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1555  ferric uptake regulator family protein  26.17 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2005  ferric uptake regulator, Fur family  26.43 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1604  putative transcription regulator protein  28.67 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000436344  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05900  ferric uptake regulator, Fur family  21.43 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000248432  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1411  ferric uptake regulator family protein  26.12 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000449804  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1493  ferric uptake regulator family protein  26.95 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1048  ferric uptake regulator family protein  27.46 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000518354  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2468  ferric uptake regulator, Fur family  27.14 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0653957  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1713  FUR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0366911  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4803  ferric uptake regulator, Fur family  30.66 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2788  putative zinc uptake regulation protein  28.28 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0061  zinc uptake regulator  29.79 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1966  ferric uptake regulator family protein  26.71 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00359557  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0734  ferric uptake regulator family protein  25.87 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000194517  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3814  ferric uptake regulator, Fur family  30.34 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000136698  normal  0.0742245 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1295  ferric uptake regulator family protein  27.01 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000494544  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>