22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0446 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_002359  lipid A core-O-antigen ligase  56.8 
 
 		 561 aa  648    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2811  hypothetical protein  51.97 
 
 		 597 aa  651    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03709  hypothetical protein  55.46 
 
 		 594 aa  661    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0446  O-antigen polymerase  100 
 
 		 585 aa  1187    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0368  O-antigen polymerase  34.04 
 
 		 579 aa  291  2e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0423  O-antigen polymerase  25.93 
 
 		 557 aa  177  5e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.955955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4715  O-antigen polymerase  29.13 
 
 		 545 aa  160  7e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.408363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4678  O-antigen polymerase  27.22 
 
 		 544 aa  159  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0410  O-antigen polymerase  26.76 
 
 		 552 aa  110  7.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4780  O-antigen polymerase  29.12 
 
 		 594 aa  65.5  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.793749  normal  0.179192 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0466  O-antigen polymerase  25 
 
 		 589 aa  50.4  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.285163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4678  O-antigen polymerase  25.5 
 
 		 556 aa  49.7  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4673  O-antigen polymerase  24.2 
 
 		 560 aa  48.9  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0142  O-antigen polymerase  21.97 
 
 		 496 aa  48.9  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0464  O-antigen polymerase  26.37 
 
 		 590 aa  48.5  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0063  O-antigen polymerase  24.61 
 
 		 531 aa  46.2  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0639643 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0534  O-antigen polymerase  24.68 
 
 		 607 aa  45.8  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.462274  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0822  inorganic carbon transporter  22.37 
 
 		 471 aa  45.4  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.999427  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4038  O-antigen ligase  25.95 
 
 		 404 aa  45.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3912  O-antigen ligase  25.68 
 
 		 404 aa  44.3  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0464096 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3931  O-antigen ligase  25.68 
 
 		 404 aa  43.9  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3993  O-antigen ligase  25.68 
 
 		 404 aa  43.5  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>