147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06662 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06662  hypothetical protein  100 
 
 		 290 aa  607  1e-173  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001123  hypothetical protein  88.62 
 
 		 290 aa  541  1e-153  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0238457  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0214  patatin-like phospholipase  67.59 
 
 		 290 aa  432  1e-120  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01883  hypothetical protein  46.15 
 
 		 287 aa  267  2e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06415  phospholipase  41.48 
 
 		 305 aa  223  4e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000588  hypothetical protein  39.33 
 
 		 282 aa  218  7e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.233579  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0656  patatin  35.94 
 
 		 373 aa  172  5e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.52912 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3501  patatin family phospholipase  34.95 
 
 		 422 aa  170  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0834  patatin family phospholipase  34.95 
 
 		 422 aa  170  3e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3630  patatin  34.95 
 
 		 424 aa  170  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.330139  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4925  patatin family phospholipase  33.82 
 
 		 357 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5890  phospholipase, patatin family  33.45 
 
 		 357 aa  161  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.547138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4612  patatin family phospholipase  33.45 
 
 		 357 aa  161  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4975  patatin family phospholipase  33.45 
 
 		 357 aa  161  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.065894  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2812  patatin  32.28 
 
 		 343 aa  161  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.338159  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04253  predicted esterase  33.09 
 
 		 357 aa  160  3e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.463702  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3621  Patatin  33.09 
 
 		 357 aa  160  3e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04219  hypothetical protein  33.09 
 
 		 357 aa  160  3e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.361585  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4921  phospholipase, patatin family  32.73 
 
 		 357 aa  159  4e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3679  patatin  32.73 
 
 		 357 aa  158  9e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.436712  hitchhiker  0.00198477 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4919  patatin  33.81 
 
 		 364 aa  158  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4817  patatin  33.81 
 
 		 357 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4884  phospholipase, patatin family  33.81 
 
 		 357 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0375868  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4971  patatin  34.06 
 
 		 364 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0537  patatin  33.82 
 
 		 356 aa  157  3e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.871804  hitchhiker  0.00848516 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4978  patatin  33.45 
 
 		 364 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.165091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2550  patatin  32.56 
 
 		 335 aa  150  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.128442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2385  patatin  32.44 
 
 		 335 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000835704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1204  putative phospholipase  31.88 
 
 		 638 aa  147  3e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2356  patatin  33.7 
 
 		 345 aa  146  3e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0718  patatin  32.21 
 
 		 344 aa  144  2e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0491611  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1730  patatin  29.88 
 
 		 372 aa  143  3e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.220053  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02679  Patatin  32.53 
 
 		 378 aa  142  5e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2559  Patatin  29.57 
 
 		 372 aa  142  8e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00539059  hitchhiker  0.000000000253034 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1591  patatin  29.78 
 
 		 383 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1725  patatin  29.25 
 
 		 380 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000438392  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1768  patatin  30.03 
 
 		 372 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.114347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0630  patatin  32.6 
 
 		 284 aa  137  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000302445  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4528  phospholipase, patatin family  30.58 
 
 		 284 aa  136  4e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.430948  normal  0.279256 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0803  phospholipase, patatin family  30.94 
 
 		 284 aa  135  9e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.240564  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0660  patatin  31.07 
 
 		 284 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0900  phospholipase, patatin family  30.58 
 
 		 284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0815  phospholipase, putative  30.22 
 
 		 284 aa  133  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0555533  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0709  phospholipase  30.22 
 
 		 284 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.626659  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0653  phospholipase  30.22 
 
 		 284 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000540236  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0745  phospholipase  30.22 
 
 		 284 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0574828  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0821  phospholipase, patatin family  30.22 
 
 		 284 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5960900000000002e-53 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0652  phospholipase  30.22 
 
 		 284 aa  132  5e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0951235  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1546  patatin family phospholipase  31.02 
 
 		 279 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00664201  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1339  patatin-like phospholipase family protein  31.02 
 
 		 279 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00020938  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1044  alpha-beta hydrolase family esterase  31.27 
 
 		 283 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0733835  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2613  patatin  29.97 
 
 		 415 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1409  hypothetical protein  30.6 
 
 		 282 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3501  patatin  31.18 
 
 		 289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0437866  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3733  patatin  30.11 
 
 		 290 aa  125  7e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.445531 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1851  patatin  28 
 
 		 283 aa  122  5e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.255911  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4525  hypothetical protein  29.75 
 
 		 289 aa  122  8e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3804  patatin  29.75 
 
 		 290 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3931  patatin  29.75 
 
 		 290 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00834869  normal  0.974076 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2735  patatin  29.09 
 
 		 304 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0568052  hitchhiker  0.0000690966 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4122  patatin  28.78 
 
 		 293 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00238218  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2716  putative phospholipase  27.34 
 
 		 283 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4243  patatin  28.78 
 
 		 293 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000146713  hitchhiker  0.00194419 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0217  Patatin  28.06 
 
 		 293 aa  119  7e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000888537  normal  0.183812 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0215  patatin  28.42 
 
 		 293 aa  119  7e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000161768  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02892  hypothetical protein  36.22 
 
 		 381 aa  119  7.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003010  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  37.43 
 
 		 383 aa  118  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.12929  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2763  putative phospholipase  26.98 
 
 		 283 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.224384  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2059  hypothetical protein  28.57 
 
 		 281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.291914  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2438  serine protease  26.62 
 
 		 283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00741052  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0299  hypothetical protein  27.21 
 
 		 285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2446  patatin  26.91 
 
 		 283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0616415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2473  patatin-like phospholipase  26.79 
 
 		 283 aa  117  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000274868  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2711  putative phospholipase  26.79 
 
 		 283 aa  117  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000208359 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2593  putative phospholipase  27.34 
 
 		 283 aa  116  5e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0159021 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0513  Patatin  28.11 
 
 		 289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000855028  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1410  hypothetical protein  29.84 
 
 		 270 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1792  Patatin  28.98 
 
 		 296 aa  112  9e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0543  alpha-beta hydrolase family esterase  28.16 
 
 		 282 aa  110  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.47199e-26 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1897  Patatin  30.66 
 
 		 290 aa  109  6e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184207  hitchhiker  0.00000000000000682914 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1595  hypothetical protein  31.6 
 
 		 389 aa  104  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14290  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  28.24 
 
 		 303 aa  100  3e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0103  putative esterase-like protein  27.44 
 
 		 281 aa  96.3  6e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0997  patatin  27.51 
 
 		 284 aa  95.9  7e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00027457  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08930  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  27.65 
 
 		 313 aa  91.3  2e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0254499  normal  0.882141 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2512  hypothetical protein  24.36 
 
 		 240 aa  84  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00693328  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15620  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  27 
 
 		 300 aa  81.3  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0266793  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1253  Patatin  23.76 
 
 		 304 aa  75.5  0.0000000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13100  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  27.66 
 
 		 293 aa  67  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0309972  normal  0.551391 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2574  Patatin  26.39 
 
 		 307 aa  61.6  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.649252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5074  Patatin  23.79 
 
 		 332 aa  58.5  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2927  patatin  22.95 
 
 		 301 aa  57.8  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.224599  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0455  patatin  29.91 
 
 		 323 aa  57  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0408  Patatin  29.59 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.129061  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1627  Patatin  28.57 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.999239  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  29.84 
 
 		 293 aa  53.9  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  29.53 
 
 		 320 aa  52.8  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  29.53 
 
 		 320 aa  52.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  29.38 
 
 		 333 aa  52.4  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10458  hypothetical protein  22.45 
 
 		 301 aa  51.6  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>