44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06645 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06645  hypothetical protein  100 
 
 
239 aa  491  9.999999999999999e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001140  putative secreted protein  81.25 
 
 
239 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0107  hypothetical protein  50.45 
 
 
211 aa  221  7e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003961  putative secreted protein  37.33 
 
 
225 aa  165  6.9999999999999995e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1444  hypothetical protein  36.67 
 
 
224 aa  163  3e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000075829  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2129  hypothetical protein  37.9 
 
 
208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.116207  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1590  hypothetical protein  31.78 
 
 
234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.124163 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2631  hypothetical protein  30.31 
 
 
252 aa  112  6e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3571  hypothetical protein  31.86 
 
 
212 aa  112  6e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1523  hypothetical protein  30.08 
 
 
234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1584  hypothetical protein  29.58 
 
 
238 aa  109  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.753254  normal  0.316977 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2745  hypothetical protein  30.08 
 
 
252 aa  108  5e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.284126 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1718  hypothetical protein  29.76 
 
 
252 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0414729  hitchhiker  0.0000333205 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1720  hypothetical protein  34.78 
 
 
224 aa  107  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.851625  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0786  hypothetical protein  30.38 
 
 
233 aa  107  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1610  hypothetical protein  29.2 
 
 
251 aa  107  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000546178  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2666  hypothetical protein  30.35 
 
 
252 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.141618  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2811  hypothetical protein  31.05 
 
 
226 aa  103  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.255962  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1784  hypothetical protein  28.69 
 
 
231 aa  98.2  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.215532  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3483  hypothetical protein  31.22 
 
 
194 aa  90.5  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.532841  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1761  hypothetical protein  26.67 
 
 
223 aa  89  5e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0748188  hitchhiker  0.000636371 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2355  hypothetical protein  27 
 
 
256 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1349  hypothetical protein  30.14 
 
 
217 aa  74.3  0.000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1476  hypothetical protein  26.94 
 
 
220 aa  72.8  0.000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1232  hypothetical protein  26.39 
 
 
243 aa  63.5  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2351  hypothetical protein  25.11 
 
 
220 aa  60.5  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.300281  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1128  hypothetical protein  25.11 
 
 
220 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.52869  normal  0.229343 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1073  hypothetical protein  25.11 
 
 
220 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00226171  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00975  hypothetical protein  25.11 
 
 
220 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.749344  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2155  hypothetical protein  25.11 
 
 
220 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.257613  normal  0.348745 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2632  hypothetical protein  25.11 
 
 
220 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.521459  hitchhiker  0.00000292473 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1079  hypothetical protein  25.11 
 
 
220 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928447  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00968  hypothetical protein  25.11 
 
 
220 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.554756  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2679  conserved hypothetical protein  25.11 
 
 
220 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.430544  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01270  hypothetical protein  31.33 
 
 
198 aa  59.7  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3206  hypothetical protein  24.43 
 
 
226 aa  58.2  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00873811  normal  0.0205878 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2623  hypothetical protein  24.43 
 
 
226 aa  57.4  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.515334  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2534  hypothetical protein  24.43 
 
 
226 aa  57.4  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000238326  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004185  hypothetical protein  33.56 
 
 
197 aa  57  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.737127  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1216  hypothetical protein  22.34 
 
 
215 aa  51.2  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.273624  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3089  hypothetical protein  25.53 
 
 
224 aa  49.3  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.841691  hitchhiker  0.0000201211 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1563  hypothetical protein  23.61 
 
 
230 aa  47  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.481041  hitchhiker  0.0000891871 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2815  hypothetical protein  25 
 
 
221 aa  47  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.270347  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2486  hypothetical protein  24.27 
 
 
229 aa  45.4  0.0009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.821286  normal  0.0164308 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>