24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06004 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000485  hypothetical protein  67.12 
 
 		 667 aa  928    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.889431  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0313  hypothetical protein  53.67 
 
 		 703 aa  714    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06004  hypothetical protein  100 
 
 		 702 aa  1425    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3363  hypothetical protein  40.97 
 
 		 702 aa  497  1e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1237  hypothetical protein  40.06 
 
 		 719 aa  478  1e-133  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1509  hypothetical protein  40.61 
 
 		 714 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.748736 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1368  hypothetical protein  41.4 
 
 		 713 aa  445  1e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0249  hypothetical protein  41.42 
 
 		 621 aa  275  2.0000000000000002e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.216419  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02388  hypothetical protein  34.2 
 
 		 703 aa  242  2e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06248  hypothetical protein  68.09 
 
 		 153 aa  189  2e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06616  hypothetical protein  36 
 
 		 562 aa  171  4e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3807  hypothetical protein  34.19 
 
 		 549 aa  144  4e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01506  hypothetical protein  33.33 
 
 		 561 aa  138  4e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2414  hypothetical protein  41.15 
 
 		 1898 aa  119  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1791  hypothetical protein  45 
 
 		 669 aa  117  8.999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0011076  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0535  hypothetical protein  32.51 
 
 		 1003 aa  102  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.525327 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06249  hypothetical protein  60.87 
 
 		 48 aa  72  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0047  hypothetical protein  28.26 
 
 		 1441 aa  69.7  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2337  hypothetical protein  30.8 
 
 		 1147 aa  64.7  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00625396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0048  hypothetical protein  27.51 
 
 		 1946 aa  58.2  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0532  hypothetical protein  23.03 
 
 		 757 aa  55.1  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0519891  normal  0.677455 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5608  hypothetical protein  30.6 
 
 		 808 aa  48.9  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.406327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0886  peptidase M4, thermolysin  33.87 
 
 		 924 aa  46.2  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2063  NHL repeat containing protein  33.08 
 
 		 652 aa  45.1  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>