More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01305 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02426  RNA-directed DNA polymerase  99.43 
 
 
430 aa  724    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02975  RNA-directed DNA polymerase  99.71 
 
 
430 aa  724    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03017  RNA-directed DNA polymerase  99.14 
 
 
430 aa  722    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00759  RNA-directed DNA polymerase  99.43 
 
 
430 aa  723    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03670  RNA-directed DNA polymerase  99.43 
 
 
430 aa  723    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01083  RNA-directed DNA polymerase  99.14 
 
 
430 aa  718    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01305  RNA-directed DNA polymerase  100 
 
 
350 aa  725    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01296  RNA-directed DNA polymerase  99.43 
 
 
430 aa  720    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03030  RNA-directed DNA polymerase  98.86 
 
 
430 aa  718    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01811  RNA-directed DNA polymerase  99.71 
 
 
430 aa  724    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06996  Na-directed DNA polymerase  99.43 
 
 
430 aa  723    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06317  RNA-directed DNA polymerase  99.43 
 
 
430 aa  723    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03266  RNA-directed DNA polymerase  99.14 
 
 
430 aa  721    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00141  RNA-directed DNA polymerase  99.71 
 
 
430 aa  724    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00350  reverse transcriptase  99.14 
 
 
430 aa  722    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02652  RNA-directed DNA polymerase  99.71 
 
 
430 aa  724    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02490  RNA-directed DNA polymerase  98.57 
 
 
430 aa  719    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03119  RNA-directed DNA polymerase  99.43 
 
 
430 aa  723    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05463  RNA-directed DNA polymerase  99.71 
 
 
430 aa  724    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04800  RNA-directed DNA polymerase  99.43 
 
 
430 aa  723    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05916  RNA-directed DNA polymerase  99.14 
 
 
430 aa  722    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06379  RNA-directed DNA polymerase  99.43 
 
 
367 aa  721    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06609  RNA-directed DNA polymerase  99.71 
 
 
430 aa  724    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03476  RNA-directed DNA polymerase  91.71 
 
 
404 aa  630  1e-179  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03650  RNA-directed DNA polymerase  91.71 
 
 
404 aa  630  1e-179  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01846  RNA-directed DNA polymerase  100 
 
 
247 aa  505  9.999999999999999e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06329  RNA-directed DNA polymerase  99.1 
 
 
225 aa  457  9.999999999999999e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00271  reverse transcriptase  99 
 
 
281 aa  412  1e-114  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06049  RNA-directed DNA polymerase  99.5 
 
 
217 aa  412  1e-114  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00341  RNA-directed DNA polymerase  98.94 
 
 
289 aa  384  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0829  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  51.65 
 
 
470 aa  329  4e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.880768  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2224  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  51.65 
 
 
470 aa  329  4e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.321211  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0487  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  51.35 
 
 
470 aa  327  1.0000000000000001e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0265658  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0156  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  51.65 
 
 
470 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0749  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  51.35 
 
 
470 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0167  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  50.75 
 
 
470 aa  324  1e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2027  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  50.75 
 
 
470 aa  325  1e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3200  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  49.85 
 
 
467 aa  319  3.9999999999999996e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1070  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  50.29 
 
 
446 aa  315  8e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000276308  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0483  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  50.15 
 
 
419 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000125765  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1915  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  50 
 
 
446 aa  311  6.999999999999999e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.552101  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0849  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  50.61 
 
 
466 aa  308  8e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.141781  normal  0.131758 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1723  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  48.97 
 
 
420 aa  308  9e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0152  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  50.61 
 
 
466 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.765246  normal  0.510076 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2298  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  50.61 
 
 
466 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0963  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  50.61 
 
 
466 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000244111  hitchhiker  0.000000045445 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0293  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  49.41 
 
 
446 aa  306  2.0000000000000002e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1335  maturase-related protein  50 
 
 
529 aa  306  3e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000303487  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0883  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  50.3 
 
 
466 aa  306  3e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00469922  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0841  group II intron-encoding maturase  49.85 
 
 
529 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000535871  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2831  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  47.02 
 
 
469 aa  305  7e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1316  group II intron-encoding maturase  49.55 
 
 
529 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1373  reverse transcriptase/maturase  49.7 
 
 
529 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1255  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  45.95 
 
 
472 aa  304  1.0000000000000001e-81  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0426  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  45.65 
 
 
472 aa  301  1e-80  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0566133  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4614  putative recombinase  49.24 
 
 
461 aa  299  4e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.179717  normal  0.182467 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00340  RNA-directed DNA polymerase  100 
 
 
142 aa  299  4e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2156  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  48.2 
 
 
467 aa  299  5e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341983  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4139  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  48.2 
 
 
467 aa  299  5e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.813307  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2376  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  48.2 
 
 
467 aa  299  5e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.207221  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3888  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  48.2 
 
 
467 aa  299  5e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.248408  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4251  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  48.2 
 
 
467 aa  299  5e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.90502  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0183  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  48.2 
 
 
467 aa  299  5e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0252  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  48.2 
 
 
467 aa  299  5e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.486482  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0645  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  48.2 
 
 
467 aa  299  5e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0867872  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1333  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  48.2 
 
 
467 aa  299  5e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0724737  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06770  RNA-directed DNA polymerase  98.6 
 
 
230 aa  298  9e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00270  reverse transcriptase  99.3 
 
 
142 aa  297  1e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3163  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  47.63 
 
 
420 aa  297  2e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6534  putative reverse transcriptasematurase of intron  48.94 
 
 
455 aa  297  2e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.339692  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2085  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  47.63 
 
 
420 aa  296  3e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1421  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  47.63 
 
 
420 aa  296  3e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1201  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  47.63 
 
 
420 aa  296  3e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1269  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  45.29 
 
 
472 aa  294  2e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.418772  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1707  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  45.59 
 
 
467 aa  294  2e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.330237  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1671  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  45.59 
 
 
467 aa  294  2e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3293  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  45.59 
 
 
467 aa  294  2e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2349  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  45.59 
 
 
467 aa  294  2e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4543  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  45.59 
 
 
467 aa  294  2e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1035  hypothetical protein  44.35 
 
 
482 aa  280  2e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1253  hypothetical protein  44.35 
 
 
482 aa  280  2e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1977  hypothetical protein  44.35 
 
 
482 aa  280  2e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1430  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  41.72 
 
 
460 aa  281  2e-74  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0093  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  41.72 
 
 
460 aa  280  3e-74  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0963  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  41.72 
 
 
460 aa  280  3e-74  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.120749  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1089  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  41.72 
 
 
460 aa  280  3e-74  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000601644  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0939  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  41.72 
 
 
460 aa  280  3e-74  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000533516  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0498  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  41.72 
 
 
460 aa  280  3e-74  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000103036  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0231  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  41.42 
 
 
460 aa  278  1e-73  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000484003  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1257  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  41.42 
 
 
460 aa  278  1e-73  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0248  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  41.42 
 
 
460 aa  276  4e-73  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000485137  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1349  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  40.95 
 
 
457 aa  273  2.0000000000000002e-72  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000323944  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2180  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  44.28 
 
 
434 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00037099  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5396  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  45.02 
 
 
456 aa  272  6e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.476043  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4100  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  47.72 
 
 
450 aa  271  2e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.720955  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3498  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  47.72 
 
 
423 aa  271  2e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16674  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1212  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  45.45 
 
 
455 aa  268  8e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.835307  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18750  RNA-directed DNA polymerase  44.55 
 
 
455 aa  267  2e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.844696  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1841  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  43.67 
 
 
448 aa  266  4e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2412  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  43.67 
 
 
448 aa  266  4e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>