58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000024 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000024  uncharacterized protein ImpF  100 
 
 		 154 aa  314  3e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.472951  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2365  hypothetical protein  43.15 
 
 		 154 aa  118  3e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1533  hypothetical protein  34.69 
 
 		 165 aa  73.2  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01962  hypothetical protein  32.48 
 
 		 157 aa  72  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0416888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3075  GPW/gp25 family protein  31.19 
 
 		 173 aa  68.2  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2174  hypothetical protein  27.92 
 
 		 159 aa  67.8  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000567459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2636  hypothetical protein  31.01 
 
 		 161 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0433868  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0448  type VI secretion system lysozyme-related protein  31.01 
 
 		 161 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.42159  normal  0.655562 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0470  hypothetical protein  31.01 
 
 		 161 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000139842  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3562  hypothetical protein  31.01 
 
 		 161 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.132433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6047  hypothetical protein  30 
 
 		 169 aa  66.2  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.183356  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0384  hypothetical protein  30.38 
 
 		 161 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.576989  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3657  hypothetical protein  29.87 
 
 		 160 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.403377  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2927  type VI secretion system lysozyme-related protein  30.38 
 
 		 161 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.132533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3632  hypothetical protein  29.87 
 
 		 160 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1710  hypothetical protein  29.87 
 
 		 160 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0057  hypothetical protein  29.87 
 
 		 160 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0405  type VI secretion system lysozyme-related protein  29.75 
 
 		 161 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00895356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3641  hypothetical protein  29.87 
 
 		 160 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0866939  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3143  hypothetical protein  29.87 
 
 		 160 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2961  hypothetical protein  29.87 
 
 		 160 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4916  type VI secretion system lysozyme-related protein  27.92 
 
 		 159 aa  62  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00677472  decreased coverage  0.00161069 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02048  hypothetical protein  31.65 
 
 		 162 aa  61.2  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.103916  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3029  hypothetical protein  29.86 
 
 		 180 aa  58.5  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0316867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3040  type VI secretion system lysozyme-related protein  29.93 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3858  type VI secretion system lysozyme-related protein  31.68 
 
 		 184 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.229758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1730  hypothetical protein  34.94 
 
 		 154 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0454443  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1210  type VI secretion system lysozyme-related protein  26.32 
 
 		 145 aa  49.7  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2363  type VI secretion system lysozyme-related protein  32.95 
 
 		 182 aa  48.1  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0568076 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1689  type VI secretion system lysozyme-related protein  33.33 
 
 		 173 aa  48.1  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.438523 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5981  type VI secretion system lysozyme-related protein  32.5 
 
 		 151 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2832  hypothetical protein  32.43 
 
 		 178 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0526  type VI secretion system lysozyme-related protein  31.93 
 
 		 171 aa  47  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0406  hypothetical protein  32.43 
 
 		 182 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0456  hypothetical protein  32.43 
 
 		 186 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2957  hypothetical protein  32.43 
 
 		 186 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1786  hypothetical protein  32.43 
 
 		 186 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.325097  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1197  hypothetical protein  32.43 
 
 		 186 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1603  hypothetical protein  32.43 
 
 		 186 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00262  hypothetical protein  31.78 
 
 		 167 aa  45.4  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.885463  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2270  hypothetical protein  26.43 
 
 		 160 aa  44.7  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0945  type VI secretion system lysozyme-related protein  27.43 
 
 		 178 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01060  hypothetical protein  30.93 
 
 		 169 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1585  hypothetical protein  31.3 
 
 		 182 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22173  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6118  type VI secretion system lysozyme-related protein  29.52 
 
 		 183 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0590599  normal  0.324873 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1676  hypothetical protein  24.82 
 
 		 153 aa  43.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0261  hypothetical protein  31.53 
 
 		 186 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2328  GPW/gp25 family protein  31.58 
 
 		 170 aa  42  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570455  normal  0.0349509 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0292  hypothetical protein  25.93 
 
 		 164 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.871177 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50830  hypothetical protein  30.34 
 
 		 150 aa  41.6  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0626343  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0307  type VI secretion system lysozyme-related protein  25.93 
 
 		 164 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0294  type VI secretion system lysozyme-related protein  25.93 
 
 		 164 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.214716 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0976  hypothetical protein  29.52 
 
 		 190 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2817  hypothetical protein  25.74 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2452  type VI secretion system lysozyme-related protein  33.03 
 
 		 191 aa  41.2  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0480301  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4087  type VI secretion system lysozyme-related protein  32.04 
 
 		 184 aa  40.8  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000692593 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3470  hypothetical protein  26.09 
 
 		 185 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.303478  normal  0.684408 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3312  hypothetical protein  28.06 
 
 		 136 aa  40.4  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>