35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_6047 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_6047  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  335  1.9999999999999998e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.183356  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3029  hypothetical protein  38.71 
 
 		 180 aa  107  9.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0316867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1533  hypothetical protein  32.68 
 
 		 165 aa  79.3  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3075  GPW/gp25 family protein  33.08 
 
 		 173 aa  77  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2365  hypothetical protein  33.33 
 
 		 154 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4916  type VI secretion system lysozyme-related protein  29.8 
 
 		 159 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00677472  decreased coverage  0.00161069 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3562  hypothetical protein  28.67 
 
 		 161 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.132433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0448  type VI secretion system lysozyme-related protein  28.67 
 
 		 161 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.42159  normal  0.655562 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0470  hypothetical protein  28.67 
 
 		 161 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000139842  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2636  hypothetical protein  28.67 
 
 		 161 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0433868  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02048  hypothetical protein  29.41 
 
 		 162 aa  67.8  0.00000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.103916  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2927  type VI secretion system lysozyme-related protein  28.67 
 
 		 161 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.132533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2270  hypothetical protein  30.2 
 
 		 160 aa  67  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000024  uncharacterized protein ImpF  30 
 
 		 154 aa  66.2  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.472951  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0384  hypothetical protein  28 
 
 		 161 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.576989  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2961  hypothetical protein  27.7 
 
 		 160 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0405  type VI secretion system lysozyme-related protein  28 
 
 		 161 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00895356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1710  hypothetical protein  27.03 
 
 		 160 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3143  hypothetical protein  27.03 
 
 		 160 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3657  hypothetical protein  27.03 
 
 		 160 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.403377  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3632  hypothetical protein  27.03 
 
 		 160 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0057  hypothetical protein  27.03 
 
 		 160 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3641  hypothetical protein  27.03 
 
 		 160 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0866939  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3040  type VI secretion system lysozyme-related protein  31.65 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4955  hypothetical protein  31.4 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2766  type VI secretion system lysozyme-related protein  28.26 
 
 		 160 aa  57.4  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0113374  normal  0.377174 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3098  hypothetical protein  28.26 
 
 		 160 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2624  GPW/gp25 family protein  28.26 
 
 		 160 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2508  type VI secretion system lysozyme-related protein  27.54 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0785456  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01962  hypothetical protein  27.45 
 
 		 157 aa  53.1  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0416888  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1210  type VI secretion system lysozyme-related protein  28.77 
 
 		 145 aa  51.6  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2174  hypothetical protein  26.49 
 
 		 159 aa  47.4  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000567459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1122  putative type VI secretion protein VasS  29.58 
 
 		 141 aa  46.6  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.111003  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0261  hypothetical protein  27.01 
 
 		 186 aa  41.2  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1585  hypothetical protein  26.95 
 
 		 182 aa  41.2  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22173  normal  0.16892 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>