More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1011 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1011  chemotaxis protein methyltransferase CheR  100 
 
 
281 aa  580  1.0000000000000001e-165  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03244  chemotaxis protein methyltransferase CheR  53.82 
 
 
284 aa  315  7e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2325  MCP methyltransferase, CheR-type  50 
 
 
276 aa  289  3e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4609  MCP methyltransferase, CheR-type  45.62 
 
 
290 aa  264  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0764  MCP methyltransferase, CheR-type  44.93 
 
 
286 aa  259  4e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.872365  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3302  MCP methyltransferase, CheR-type  46.18 
 
 
274 aa  247  2e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.905154 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1849  Protein-glutamate O-methyltransferase  46.1 
 
 
291 aa  242  5e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.313486  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2051  MCP methyltransferase, CheR-type  41.81 
 
 
299 aa  240  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.156898  hitchhiker  0.000266106 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1457  protein-glutamate O-methyltransferase  40.44 
 
 
276 aa  211  1e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0777  MCP methyltransferase, CheR-type  40.44 
 
 
297 aa  210  2e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.152669  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2305  MCP methyltransferase, CheR-type  38.08 
 
 
291 aa  210  3e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2118  MCP methyltransferase, CheR-type  36.96 
 
 
283 aa  209  5e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3139  protein-glutamate O-methyltransferase  37.77 
 
 
291 aa  208  8e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2215  chemotaxis protein methyltransferase CheR  38.13 
 
 
289 aa  206  4e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.171483  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0579  MCP methyltransferase, CheR-type  37.37 
 
 
280 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1379  MCP methyltransferase, CheR-type  37.28 
 
 
553 aa  194  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.991559  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0762  MCP methyltransferase, CheR-type  37.59 
 
 
288 aa  194  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.454256 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0747  MCP methyltransferase, CheR-type  37.32 
 
 
288 aa  193  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2815  MCP methyltransferase, CheR-type  37.55 
 
 
275 aa  189  5e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.904459  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4027  MCP methyltransferase, CheR-type  37.32 
 
 
290 aa  187  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000815784 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3943  MCP methyltransferase, CheR-type  37.32 
 
 
290 aa  187  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.331314  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1573  MCP methyltransferase, CheR-type  33.45 
 
 
292 aa  186  5e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0438911  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1152  protein-glutamate O-methyltransferase  35.34 
 
 
291 aa  186  5e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.14728 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0878  MCP methyltransferase, CheR-type  36.1 
 
 
275 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0295  chemotaxis protein methyltransferase CheR  36.96 
 
 
277 aa  181  9.000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.468009  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4421  protein-glutamate O-methyltransferase  37.09 
 
 
277 aa  178  8e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2231  MCP methyltransferase, CheR-type  37.08 
 
 
279 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0778  MCP methyltransferase, CheR-type  33.97 
 
 
292 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0203537 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0163  MCP methyltransferase, CheR-type  37.28 
 
 
280 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3267  MCP methyltransferase, CheR-type  35.61 
 
 
277 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.335431  hitchhiker  0.0000324119 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1198  protein-glutamate O-methyltransferase  33.84 
 
 
327 aa  169  3e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.112441  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1065  MCP methyltransferase, CheR-type  36.96 
 
 
271 aa  169  4e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4168  response regulator receiver protein  35.52 
 
 
622 aa  168  8e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22590  Protein-glutamate O-methyltransferase  35.13 
 
 
309 aa  165  8e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1988  Protein-glutamate O-methyltransferase  34.44 
 
 
275 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0183  protein-glutamate O-methyltransferase  36.43 
 
 
280 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4376  MCP methyltransferase, CheR-type  35.96 
 
 
295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.525329  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0910  chemotaxis protein methyltransferase CheR  34.73 
 
 
269 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0783  protein-glutamate O-methyltransferase  35.11 
 
 
269 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.827996  normal  0.901412 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0993  protein-glutamate O-methyltransferase  33.7 
 
 
468 aa  161  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2689  protein-glutamate O-methyltransferase  36.5 
 
 
283 aa  161  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000470829  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1199  methylase of chemotaxis methyl-accepting protein, CheR-like  34.87 
 
 
291 aa  160  3e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0110  MCP methyltransferase, CheR-type  37.16 
 
 
288 aa  160  3e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0281  MCP methyltransferase, CheR-type  32.13 
 
 
292 aa  159  4e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354754  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1415  MCP methyltransferase, CheR-type  33.2 
 
 
281 aa  159  5e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.299383  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2379  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  35.77 
 
 
614 aa  158  7e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1796  protein-glutamate O-methyltransferase  36.19 
 
 
294 aa  159  7e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2282  MCP methyltransferase, CheR-type  39.39 
 
 
270 aa  158  1e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.977677  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2618  MCP methyltransferase, CheR-type  34.24 
 
 
292 aa  157  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2434  putative MCP methyltransferase, CheR1  37.25 
 
 
305 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1098  protein-glutamate O-methyltransferase  37.25 
 
 
305 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0871  MCP methyltransferase, CheR-type  31.91 
 
 
414 aa  156  3e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3498  protein-glutamate O-methyltransferase  36.96 
 
 
273 aa  156  3e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0757  MCP methyltransferase, CheR-type  33.83 
 
 
275 aa  156  4e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1595  MCP methyltransferase, CheR-type  34.24 
 
 
284 aa  156  4e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3195  TPR repeat-containing CheR-type MCP methyltransferase  33.7 
 
 
463 aa  155  6e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.13083 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0657  MCP methyltransferase, CheR-type  34.46 
 
 
296 aa  155  7e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.120935 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0635  MCP methyltransferase, CheR-type  35.58 
 
 
301 aa  155  8e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1146  MCP methyltransferase, CheR-type  34.5 
 
 
270 aa  155  9e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.492811  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2820  MCP methyltransferase, CheR-type  40.26 
 
 
277 aa  155  9e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.353038  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0975  MCP methyltransferase, CheR-type  35.14 
 
 
281 aa  154  1e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0569  MCP methyltransferase, CheR-type  34.7 
 
 
298 aa  154  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.429442  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0808  MCP methyltransferase, CheR-type  35.29 
 
 
272 aa  154  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0152  chemotaxis protein methyltransferase CheR  36.9 
 
 
276 aa  153  2e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1932  MCP methyltransferase, CheR-type  37.5 
 
 
283 aa  153  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1320  MCP methyltransferase, CheR-type  35.38 
 
 
269 aa  154  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.711153  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1143  chemotaxis protein methyltransferase CheR  34.4 
 
 
292 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0207024  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0089  MCP methyltransferase, CheR-type  35.32 
 
 
283 aa  153  2.9999999999999998e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2166  protein-glutamate O-methyltransferase  36.88 
 
 
292 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00016475  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0626  MCP methyltransferase, CheR-type  35.21 
 
 
301 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.325159  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0904  MCP methyltransferase, CheR-type  34.91 
 
 
267 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24390  protein-glutamate O-methyltransferase. chemotaxis protein  35.94 
 
 
287 aa  152  4e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.273905  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2455  chemotaxis methyltransferase CheR  34.96 
 
 
288 aa  153  4e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1609  protein-glutamate O-methyltransferase  37.18 
 
 
259 aa  152  7e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00317018  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2073  chemotaxis methyltransferase CheR  35.71 
 
 
288 aa  152  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.50771  hitchhiker  0.000251677 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2078  chemotaxis methyltransferase CheR  35.71 
 
 
288 aa  152  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.687941  hitchhiker  2.73756e-16 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2133  chemotaxis methyltransferase CheR  35.71 
 
 
288 aa  152  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000021864 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1327  chemotaxis methyltransferase CheR  35.71 
 
 
288 aa  152  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000151288 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3062  MCP methyltransferase, CheR-type  34.46 
 
 
297 aa  151  1e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.509251  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1204  chemotaxis methyltransferase CheR  35.71 
 
 
288 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0255  putative chemotaxis protein methyltransferase  37.37 
 
 
280 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3204  MCP methyltransferase, CheR-type  32.68 
 
 
285 aa  150  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.25041  normal  0.841939 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3788  MCP methyltransferase, CheR-type  34.46 
 
 
297 aa  150  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.236792  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2622  chemotaxis methyltransferase CheR  35.71 
 
 
286 aa  149  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000206628 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1300  chemotaxis methyltransferase CheR  36.09 
 
 
286 aa  150  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000891589 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1756  MCP methyltransferase, CheR-type  35.71 
 
 
286 aa  149  4e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0553359  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1980  chemotaxis methyltransferase CheR  35.71 
 
 
286 aa  149  4e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0661  MCP methyltransferase, CheR-type  34.85 
 
 
271 aa  149  4e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3218  MCP methyltransferase, CheR-type  37.45 
 
 
295 aa  149  4e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.108561 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01855  chemotaxis regulator, protein-glutamate methyltransferase  35.71 
 
 
286 aa  149  6e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.435118  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0601  MCP methyltransferase, CheR-type  34.46 
 
 
299 aa  149  6e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1444  MCP methyltransferase, CheR-type  32.43 
 
 
300 aa  149  6e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01844  hypothetical protein  35.71 
 
 
286 aa  149  6e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.370669  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02200  putative chemotaxis protein methyltransferase  38.61 
 
 
280 aa  149  7e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.077708  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3811  MCP methyltransferase, CheR-type  32.5 
 
 
318 aa  149  7e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1077  MCP methyltransferase, CheR-type  35.06 
 
 
300 aa  148  8e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00329536 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2710  protein-glutamate O-methyltransferase  34.24 
 
 
298 aa  148  8e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2984  protein-glutamate O-methyltransferase  30.88 
 
 
285 aa  148  8e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1748  chemotaxis methyltransferase CheR  35.71 
 
 
286 aa  148  9e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0645  protein-glutamate O-methyltransferase  33.58 
 
 
302 aa  148  9e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0464454  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>